9個X-STR基因座熒光復合擴增體系的建立及其遺傳多態(tài)性
發(fā)布時間:2017-10-18 11:31
本文關鍵詞:9個X-STR基因座熒光復合擴增體系的建立及其遺傳多態(tài)性
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【摘要】:研究背景常染色體和Y染色體STR分型目前已廣泛應用于法醫(yī)學個體識別和親權鑒定。然而,面對祖母-孫女關系鑒定、同父異母的半同胞姐妹關系鑒定及缺少雙親的姐妹認親等這些特殊的親權案件時,常染色體STR及Y-STR均無法解決,而此時X-STR標記卻具有無法比擬的優(yōu)勢。盡管目前已有少數(shù)進口商品化的X-STR分型試劑盒,如MentypeArgusX-8、InvestigatorArgusX-12等可供使用,但這些以白人群體為主構建的試劑盒中部分基因座在中國人群中應用價值較低,加之價格昂貴,限制了其在國內的推廣應用。因此,,開發(fā)適合中國人群特點的X-STR基因座熒光復合擴增體系極為必要。 目的構建9個X-STR基因座熒光復合擴增體系,并調查這些基因座在中國漢族、彝族和壯族群體中的遺傳多態(tài)性,以評估其法醫(yī)學應用價值并為法醫(yī)學應用提供數(shù)據(jù)基礎。 方法篩選9個在漢族群體中多態(tài)性程度較高X-STR基因座GATA172D05、DXS10159、DXS6797、HPRTB、DXS10079、DXS6789、DXS9895、DXS10146和GATA31E08,按照復合擴增引物設計要求,重新設計部分引物并標記三色熒光染料,經(jīng)反復調整和優(yōu)化,構建9個X-STR基因座熒光復合擴增體系。然后用該復合擴增體系分別對300、180和176名武漢漢族、云南彝族及壯族無關個體進行群體遺傳學調查,并計算其法醫(yī)學多態(tài)性參數(shù),評估其法醫(yī)學應用價值。 結果⑴本文構建的9個X-STR基因座熒光復合擴增體系分型穩(wěn)定,可重復性好,與各自相應單基因座分型結果完全一致;⑵9個X-STR基因座在武漢漢族、云南彝族及壯族群體中均具有高度多態(tài)性(PIC>0.65),三個群體中女性和男性樣本的PD值范圍分別為0.8650~0.9671和0.6856~0.8721,針對女性小孩的三聯(lián)體和二聯(lián)體鑒定PE值范圍分別為0.6594~0.8497和0.5157~0.7507;⑶9個X-STR基因座在武漢漢族、云南彝族及壯族群體之間存在基因頻率分布差異。 結論⑴本研究選擇的9個X-STR基因座在武漢漢族、云南壯族和彝族群體中均具有很高的多態(tài)性,法醫(yī)學應用價值較大;⑵9個X-STR基因座在武漢漢族、云南壯族和彝族群體中的等位基因頻率分布資料為這些基因座的法醫(yī)學應用提供了基礎數(shù)據(jù);⑶本文構建的9個X-STR基因座熒光復合擴增體系分型穩(wěn)定、重復性好、靈敏度高,為疑難復雜親權案件的鑒定提供有效的手段。
【關鍵詞】:X染色體 短串聯(lián)重復序列 復合擴增 遺傳多態(tài)性
【學位授予單位】:華中科技大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:D919.4
【目錄】:
- 英文縮略詞注解5-6
- 中文摘要6-8
- 英文摘要8-10
- 第一部分 9個X-STR基因座熒光復合擴增體系的建立10-22
- 前言10-11
- 材料與方法11-16
- 結果16-18
- 討論18-22
- 第二部分 漢族、彝族和壯族群體9個X-STR基因座的遺傳多態(tài)性22-59
- 前言22-23
- 材料與方法23-24
- 結果24-57
- 討論57-59
- 結論59-60
- 參考文獻60-62
- 綜述62-79
- 參考文獻74-79
- 致謝79
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條
1 李莉;趙書民;張素華;李成濤;柳燕;林源;劉俊宏;;X染色體上16個STR基因座的分型檢測和多態(tài)性分析[J];法醫(yī)學雜志;2012年01期
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本文編號:1054679
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