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嗜酸性喜溫硫桿菌中tetH和rpoS基因功能研究

發(fā)布時(shí)間:2024-03-11 00:50
  嗜酸喜溫硫桿菌(Acidithiobacillus caldus,簡(jiǎn)稱A.caldus)是一種嗜酸,中溫,化能自養(yǎng)菌,能夠氧化還原性無機(jī)硫化物獲得能量和還原力,是浸礦環(huán)境中的優(yōu)勢(shì)菌群,其硫氧化能力和抗逆能力決定著浸礦效率的高低。本文以喜溫硫桿菌硫代謝中重要酶組分連四硫酸鹽水解酶TetH(tetrathionate hydrolase)和全局調(diào)控因子RpoS為切入點(diǎn),分別研究它們?cè)诹虼x中重要作用和在環(huán)境壓力下的調(diào)控作用,為提高嗜酸喜溫硫桿菌的浸礦能力奠定理論基礎(chǔ)。本論文主要從以下3個(gè)方面展開。首先,不同情況下RT-qPCR穩(wěn)定內(nèi)參基因的確定。通過對(duì)實(shí)驗(yàn)室已有生物芯片數(shù)據(jù)分析和文獻(xiàn)查閱,確定了 6個(gè)常用的潛在內(nèi)參基因rrs、era、map、alas、rpoc和gapdh。分別在不同硫源和不同環(huán)境壓力下培養(yǎng)獲得不同樣品,進(jìn)行RT-PCR,以Ct值為基礎(chǔ),運(yùn)用內(nèi)參基因分析軟件geNorm、normfinder和Bestkeeper對(duì)6個(gè)基因的穩(wěn)定性進(jìn)行分析排序,獲得最穩(wěn)定的基因或組合。穩(wěn)定內(nèi)參基因的確定為開展A.caldus轉(zhuǎn)錄水平的研究提供了有利條件。其次,系統(tǒng)研究了連四硫酸鹽水解酶(th...

【文章頁數(shù)】:146 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.2人腸桿尚中sigma因丫?種類??Fig.?1.2?Properties?oi'?Escherichia?coli?sigma?facto?

圖1.2人腸桿尚中sigma因丫?種類??Fig.?1.2?Properties?oi'?Escherichia?coli?sigma?facto?

Cavaliere?et?al.,?2014;?Landini?et?al.,?2014),不同的<j因子間通過競(jìng)爭(zhēng)與核心聚合??酶E結(jié)合,一般情況下主要是持家基因^〇£>發(fā)揮作用,當(dāng)環(huán)境發(fā)生變化時(shí),其??它一些cr因子開始代替r/?〇D發(fā)揮作用,主要是較多,如圖1.1所示,當(dāng)進(jìn)....


圖1:4rpoS表達(dá)調(diào)控模型

圖1:4rpoS表達(dá)調(diào)控模型

ig.?1.4?Model?for?the?regulation?of?expression?of?rpoS(\Icngge-Aronis,?20酸或低?pH?方面。Small?等(Small?et?al.,1994)發(fā)現(xiàn)?£.〇>//?和?57?/講//a??受性相關(guān)。大腸桿歯....


圖1.5?rpoS和rpol)的進(jìn)化??Figure?1.5?Evolution?of?the?RpoS?and?RpoD?sigma?factors(Chiang?and?Schellhom,??

圖1.5?rpoS和rpol)的進(jìn)化??Figure?1.5?Evolution?of?the?RpoS?and?RpoD?sigma?factors(Chiang?and?Schellhom,??

的調(diào)控關(guān)系,Smith等發(fā)現(xiàn)在中RpoS?H接受RpoN調(diào)控??(Smith?et?al.,2007)。??RpoS的起源與進(jìn)化如圖1.5所。ǎ茫瑁椋幔睿?and?Schellhom,20】0),所私的RpoS??來自共問的古老祖先,早期是?種RpoD,經(jīng)過不斷的復(fù)制丟失,在不....


圖2.〗標(biāo)準(zhǔn)Ittl線及斜率和相關(guān)系數(shù)沁例??

圖2.〗標(biāo)準(zhǔn)Ittl線及斜率和相關(guān)系數(shù)沁例??

?山東大學(xué)碩士學(xué)位論文???2.2.5.S引物擴(kuò)增效率的計(jì)算??將S因組校板進(jìn)行10倍稀釋,至少6個(gè)梯度,叫各個(gè)^丨物進(jìn)行熒光定貴PCR,??根據(jù)Ct位與起始模板濃度的對(duì)數(shù)位間的線性關(guān)系即可繪制出標(biāo)準(zhǔn)丨丨丨丨線,標(biāo)準(zhǔn)丨丨1|??線山兩部分纟U成,相義系數(shù)R:和斜率(slope),....



本文編號(hào):3925569

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