基于嗜酸氧化亞鐵硫桿菌蛋白組學研究砷及金屬相關(guān)蛋白的代謝重建
發(fā)布時間：2020-12-30 23:04
生物冶金技術(shù)具有操作簡單、經(jīng)濟、環(huán)境友好等優(yōu)點。生物冶金中微生物的浸出效率主要和以下因素相關(guān):（1）嗜酸氧化亞鐵硫桿菌的代謝能力和氧化活性等菌體自身因素;（2）礦石的成分對嗜酸氧化亞鐵硫桿菌的生長和氧化反應的進行是否有利;（3）浸礦堆的溫度以及pH范圍;（4）酸性礦坑水中有毒離子的濃度是否超過嗜酸氧化亞鐵硫桿菌耐受程度。在實際工業(yè)化生產(chǎn)中,嗜酸氧化亞鐵硫桿菌經(jīng)常要耐受礦石中高濃度金屬離子的脅迫,高濃度重金屬離子會嚴重抑制浸礦細菌的活性,進而影響浸出效率。對于含砷礦物的生物冶金工業(yè),其首要任務就是提高浸礦微生物的耐砷性能,或改善反應體系中砷離子的濃度,使之不會對嗜酸氧化亞鐵硫桿菌的代謝活動造成明顯的影響。本研究擬圍繞嗜酸氧化亞鐵硫桿菌代謝、砷及金屬相關(guān)蛋白生物信息建立蛋白數(shù)據(jù)整合體系,包括各元素相關(guān)蛋白數(shù)據(jù)庫,本數(shù)據(jù)庫總共獲取了2128條嗜酸氧化亞鐵硫桿菌元素相關(guān)蛋白序列信息。并在生物信息數(shù)據(jù)整合的基礎(chǔ)之上,針對嗜酸氧化亞鐵硫桿菌的蛋白序列信息,構(gòu)建亞鐵氧化代謝、硫代謝及砷代謝模型。并通過研究嗜酸氧化亞鐵硫桿菌砷脅迫條件下的蛋白質(zhì)組學,了解菌株的砷抗性機制,有助于我們進一步在工業(yè)化應用中...
【文章來源】：蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：64 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
技術(shù)路線圖
蘭州大學碩士論文 基于嗜酸氧化亞鐵硫桿菌蛋白組學研究砷及金屬相關(guān)蛋白的代謝重建保存于數(shù)據(jù)庫中。通過網(wǎng)站 http://www.eamsyslzb.com/admin/login.aspx 后臺服務進行操作。3 結(jié)果與討論3.1 數(shù)據(jù)庫基本信息本數(shù)據(jù)庫總共獲取了 2128 條嗜酸氧化亞鐵硫桿菌元素相關(guān)蛋白序列信息。如圖 2.1 所示。為確保數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)資料的可靠性和有效性，查閱相關(guān)文獻資料，又補充了 164 條蛋白序列。本數(shù)據(jù)庫主要由主頁和數(shù)據(jù)展示頁兩部分構(gòu)成。
蘭州大學碩士論文 基于嗜酸氧化亞鐵硫桿菌蛋白組學研究砷及金屬相關(guān)蛋白的代謝重建的文獻資料中進行更加深入的了解。同時主頁也是本數(shù)據(jù)庫的檢索頁，為數(shù)據(jù)的綜合查詢服務。本數(shù)據(jù)庫提供了三個字段的關(guān)鍵詞查詢，包括蛋白質(zhì)序列號（GI編號），GenBank（代碼），元素。我們設計了三種邏輯關(guān)系，可供用戶自行選擇，包括“and（和）、or（或）、not（非）”。用戶提交檢索請求后，會得到檢索結(jié)果列表。
【參考文獻】：
期刊論文
[1]含砷難處理金礦提金工藝的研究現(xiàn)狀[J]. 崔毅琦,王凱,孟奇,童雄. 礦冶. 2015(01)
[2]生物浸出系統(tǒng)中Acidithiobacillus ferrooxidans對雄黃表面改性研究[J]. 陳朋,李紅玉,晏磊,李素岳. 微生物學通報. 2014(08)
[3]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌的耐砷馴化與浸礦能力[J]. 方芳,鐘宏,江放明,羅忠銀,孫曉偉,許凱揚. 中南大學學報(自然科學版). 2013(10)
[4]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌ATP硫酸化酶的表達、純化及性質(zhì)鑒定[J]. 錢林,鄭春麗,柳建設. 生物技術(shù)通報. 2012(06)
[5]生物體砷代謝及其相關(guān)酶與蛋白的研究概況[J]. 李莉,幕曉玲. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2009(20)
[6]氧化亞鐵硫桿菌亞鐵氧化系統(tǒng)的研究進展[J]. 歐陽建平,陳新華. 生物技術(shù)通報. 2009(03)
[7]生物冶金中混合菌的作用[J]. 陳勃偉,溫建康. 金屬礦山. 2008(04)
[8]我國生物冶金研究的發(fā)展概況[J]. 彭艷平,余水靜. 礦業(yè)快報. 2006(12)
[9]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌亞鐵氧化系統(tǒng)研究進展[J]. 張成桂,夏金蘭,邱冠周. 中國有色金屬學報. 2006(07)
[10]生物信息學在生物冶金研究中的應用[J]. 劉新星,謝建平,霍強,邱冠周. 礦冶工程. 2005(05)
碩士論文
[1]重金屬對嗜酸氧化亞鐵硫桿菌菌株活性及金屬抗性相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄表達的影響[D]. 張真真.中南大學 2014
[2]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌比較蛋白質(zhì)組學研究[D]. 歐陽建平.廈門大學 2008
[3]喜溫硫桿菌蛋白質(zhì)組學研究技術(shù)建立及抗砷機制初步探討[D]. 羅金學.山東大學 2008
[4]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌亞鐵氧化酶、銅藍蛋白及鐵硫簇組裝蛋白IscA的表達純化及定點突變[D]. 耿梅梅.中南大學 2007
本文編號：2948463
【文章來源】：蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：64 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
技術(shù)路線圖
蘭州大學碩士論文 基于嗜酸氧化亞鐵硫桿菌蛋白組學研究砷及金屬相關(guān)蛋白的代謝重建保存于數(shù)據(jù)庫中。通過網(wǎng)站 http://www.eamsyslzb.com/admin/login.aspx 后臺服務進行操作。3 結(jié)果與討論3.1 數(shù)據(jù)庫基本信息本數(shù)據(jù)庫總共獲取了 2128 條嗜酸氧化亞鐵硫桿菌元素相關(guān)蛋白序列信息。如圖 2.1 所示。為確保數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)資料的可靠性和有效性，查閱相關(guān)文獻資料，又補充了 164 條蛋白序列。本數(shù)據(jù)庫主要由主頁和數(shù)據(jù)展示頁兩部分構(gòu)成。
蘭州大學碩士論文 基于嗜酸氧化亞鐵硫桿菌蛋白組學研究砷及金屬相關(guān)蛋白的代謝重建的文獻資料中進行更加深入的了解。同時主頁也是本數(shù)據(jù)庫的檢索頁，為數(shù)據(jù)的綜合查詢服務。本數(shù)據(jù)庫提供了三個字段的關(guān)鍵詞查詢，包括蛋白質(zhì)序列號（GI編號），GenBank（代碼），元素。我們設計了三種邏輯關(guān)系，可供用戶自行選擇，包括“and（和）、or（或）、not（非）”。用戶提交檢索請求后，會得到檢索結(jié)果列表。
【參考文獻】：
期刊論文
[1]含砷難處理金礦提金工藝的研究現(xiàn)狀[J]. 崔毅琦,王凱,孟奇,童雄. 礦冶. 2015(01)
[2]生物浸出系統(tǒng)中Acidithiobacillus ferrooxidans對雄黃表面改性研究[J]. 陳朋,李紅玉,晏磊,李素岳. 微生物學通報. 2014(08)
[3]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌的耐砷馴化與浸礦能力[J]. 方芳,鐘宏,江放明,羅忠銀,孫曉偉,許凱揚. 中南大學學報(自然科學版). 2013(10)
[4]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌ATP硫酸化酶的表達、純化及性質(zhì)鑒定[J]. 錢林,鄭春麗,柳建設. 生物技術(shù)通報. 2012(06)
[5]生物體砷代謝及其相關(guān)酶與蛋白的研究概況[J]. 李莉,幕曉玲. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2009(20)
[6]氧化亞鐵硫桿菌亞鐵氧化系統(tǒng)的研究進展[J]. 歐陽建平,陳新華. 生物技術(shù)通報. 2009(03)
[7]生物冶金中混合菌的作用[J]. 陳勃偉,溫建康. 金屬礦山. 2008(04)
[8]我國生物冶金研究的發(fā)展概況[J]. 彭艷平,余水靜. 礦業(yè)快報. 2006(12)
[9]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌亞鐵氧化系統(tǒng)研究進展[J]. 張成桂,夏金蘭,邱冠周. 中國有色金屬學報. 2006(07)
[10]生物信息學在生物冶金研究中的應用[J]. 劉新星,謝建平,霍強,邱冠周. 礦冶工程. 2005(05)
碩士論文
[1]重金屬對嗜酸氧化亞鐵硫桿菌菌株活性及金屬抗性相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄表達的影響[D]. 張真真.中南大學 2014
[2]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌比較蛋白質(zhì)組學研究[D]. 歐陽建平.廈門大學 2008
[3]喜溫硫桿菌蛋白質(zhì)組學研究技術(shù)建立及抗砷機制初步探討[D]. 羅金學.山東大學 2008
[4]嗜酸氧化亞鐵硫桿菌亞鐵氧化酶、銅藍蛋白及鐵硫簇組裝蛋白IscA的表達純化及定點突變[D]. 耿梅梅.中南大學 2007
本文編號：2948463
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