三種不同天然木質(zhì)纖維素材料降解過程中物種種類、組成和多樣性的對比分析
發(fā)布時間:2021-11-06 20:25
木質(zhì)纖維素是地球上存儲量最多的可再生碳源,開發(fā)以木質(zhì)纖維類為原料的清潔能源,是未來亟待解決的重大課題之一。為探討真核生物對木質(zhì)纖維素降解的影響,本文通過PCR克隆文庫構(gòu)建,克隆測序并結(jié)合RDP真菌分類鑒定,對小麥秸稈、玉米秸稈及木材腐爛樣品中真核生物的群落結(jié)構(gòu)組成、核心種群以及多樣性進行分析。結(jié)果表明Opisthokonta(55%)和SAR(36.1%)是最主要的優(yōu)勢群,多樣性也最為豐富,其次為Archaeplastida(0.3%)及未定義真核生物等。對同時期三個樣品的對比分析表明,小麥秸稈中真核生物的豐度和多樣性都明顯高于玉米秸稈和腐爛樹木,并且,小麥秸稈分解期間真核生物的組成和物種多樣性更高。在木質(zhì)纖維素降解過程中不同的微生物擔負著不同的功能,對這些微生物的研究將會使木質(zhì)纖維素降解方面的利用率大大提升。
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)科學. 2018,43(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品的采集與處理
1.2 樣品總DNA的提取
1.3 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物1 8 S rRNA基因的擴增和文庫構(gòu)建
1.4 18S rRNA基因克隆文庫的篩選、測序、數(shù)據(jù)處理和OTU聚類
1.5 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物的分類、比對和系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
2.1 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物18S rRNA基因的PCR擴增、文庫篩選和測序1 8 S rRN
2.2 真核生物18S rDNA基因序列的拼接和OTU聚類分析
2.3 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物的多樣性分析
2.4 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物的群落數(shù)量、結(jié)構(gòu)組成和對比
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]環(huán)境微生物宏基因組學研究中的生物信息學方法[J]. 魏子艷,金德才,鄧曄. 微生物學通報. 2015(05)
[2]真菌降解木質(zhì)纖維素的功能基因組學研究進展[J]. 田朝光,馬延和. 生物工程學報. 2010(10)
[3]森林凋落物的微生物分解[J]. 嚴海元,辜夕容,申鴻. 生態(tài)學雜志. 2010(09)
[4]纖維素酶與木質(zhì)纖維素生物降解轉(zhuǎn)化的研究進展[J]. 方詡,秦玉琪,李雪芝,王祿山,汪天虹,朱明田,曲音波. 生物工程學報. 2010(07)
[5]不同地區(qū)森林土壤降解天然木質(zhì)纖維素能力的分析評價[J]. 呂睿瑞,田寶玉,高媛媛,林偉鈴,王春香,黃建忠. 生物技術. 2010(02)
[6]福州森林紅壤細菌的菌群結(jié)構(gòu)及其功能分析[J]. 黃欽耿,田寶玉,江賢章,柯崇榕,徐燕,楊欣偉,黃建忠. 生物技術通報. 2009(03)
[7]玉米秸稈還田技術研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢[J]. 李萬良,劉武仁. 吉林農(nóng)業(yè)科學. 2007(03)
[8]木材上的微生物類群對木材的分解及其演替規(guī)律[J]. 池玉杰,劉智會,鮑甫成. 菌物研究. 2004(03)
碩士論文
[1]天然木質(zhì)纖維素降解機制的宏基因組學和宏蛋白質(zhì)組學分析[D]. 周俊雄.福建師范大學 2015
本文編號:3480468
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)科學. 2018,43(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品的采集與處理
1.2 樣品總DNA的提取
1.3 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物1 8 S rRNA基因的擴增和文庫構(gòu)建
1.4 18S rRNA基因克隆文庫的篩選、測序、數(shù)據(jù)處理和OTU聚類
1.5 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物的分類、比對和系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
2.1 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物18S rRNA基因的PCR擴增、文庫篩選和測序1 8 S rRN
2.2 真核生物18S rDNA基因序列的拼接和OTU聚類分析
2.3 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物的多樣性分析
2.4 小麥秸稈、玉米秸稈和腐爛樹木中真核生物的群落數(shù)量、結(jié)構(gòu)組成和對比
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]環(huán)境微生物宏基因組學研究中的生物信息學方法[J]. 魏子艷,金德才,鄧曄. 微生物學通報. 2015(05)
[2]真菌降解木質(zhì)纖維素的功能基因組學研究進展[J]. 田朝光,馬延和. 生物工程學報. 2010(10)
[3]森林凋落物的微生物分解[J]. 嚴海元,辜夕容,申鴻. 生態(tài)學雜志. 2010(09)
[4]纖維素酶與木質(zhì)纖維素生物降解轉(zhuǎn)化的研究進展[J]. 方詡,秦玉琪,李雪芝,王祿山,汪天虹,朱明田,曲音波. 生物工程學報. 2010(07)
[5]不同地區(qū)森林土壤降解天然木質(zhì)纖維素能力的分析評價[J]. 呂睿瑞,田寶玉,高媛媛,林偉鈴,王春香,黃建忠. 生物技術. 2010(02)
[6]福州森林紅壤細菌的菌群結(jié)構(gòu)及其功能分析[J]. 黃欽耿,田寶玉,江賢章,柯崇榕,徐燕,楊欣偉,黃建忠. 生物技術通報. 2009(03)
[7]玉米秸稈還田技術研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢[J]. 李萬良,劉武仁. 吉林農(nóng)業(yè)科學. 2007(03)
[8]木材上的微生物類群對木材的分解及其演替規(guī)律[J]. 池玉杰,劉智會,鮑甫成. 菌物研究. 2004(03)
碩士論文
[1]天然木質(zhì)纖維素降解機制的宏基因組學和宏蛋白質(zhì)組學分析[D]. 周俊雄.福建師范大學 2015
本文編號:3480468
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