隨著對植物內(nèi)生菌研究的不斷深入,發(fā)現(xiàn)植物體內(nèi)不僅具有非常豐富的微生物資源,而且這些內(nèi)生菌本身還具有一定的有益功能,如促生、防病、降解有機污染物等,具有良好的農(nóng)業(yè)應用前景。關于植物微生物組研究的難點之一是如何確定其核心微生物組,現(xiàn)有研究證實,植物種子內(nèi)存在著豐富的細菌群落,這些群落可能會成為下一代植物內(nèi)生細菌的來源,并在世代間進行傳播。相對于植物的根際和葉際微生物,種子作為種子植物的繁殖器官,對其相關微生物的研究至今還十分薄弱,特別是對其種子內(nèi)生細菌的研究尤為落后。本課題利用Illumina高通量測序技術對6個基因型的水稻親代種子和其子代水稻根、莖、種子內(nèi)生細菌及根際細菌進行調(diào)查,揭示水稻基因型與環(huán)境對水稻根、莖、種子內(nèi)生細菌及根際細菌菌群結構與多樣性的影響,并確定水稻種子內(nèi)生細菌核心微生物菌群。此外,利用來源追蹤方法探討水稻內(nèi)生細菌的來源,從而探討水稻內(nèi)生細菌是否可以垂直傳播及其來源途徑。取得了如下主要結果:a)基因型與環(huán)境對水稻內(nèi)生細菌的影響:水稻各組織內(nèi)生細菌α-多樣性Shannon、Simpson和Chao指數(shù)以及主坐標分析結果顯示:基因型對水稻根際細菌群落結構沒有顯著影響,但對...

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2.1水稻種子表面滅菌效果檢測Figure2.1Detectionofsterilizationeffectonsurfaceofriceseeds

圖2.1水稻種子表面滅菌效果檢測ure2.1Detectionofsterilizationeffectonsurfaceofrice與檢測SPINKitforSoil提取DNA，具體方法如下品放入無菌研缽中，加液氮研磨至粉狀，之sohat....

圖2.21%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物Figure2.2DetectionofPCRproductsby1%agarosegelelectrophoresis

內(nèi)生細菌與根際、散土細菌16SrRNA基因利用帶有60(CCAGCAGCCGCGGTAAT)和783R(ACCMGGGT進行擴增。配制50μLPCR體系：Mix25μL，534F與70μL；PCR反應程序為：95℃預變性3min；94℃變性....

圖2.31%瓊脂糖凝膠電泳對純化產(chǎn)物進行凈光密度大小的檢測Figure2.3DetectionofnetopticaldensityofpurifiedPCRproductsby1%agarosegelelectrophoresis

碩士學位論文第二章實驗材料膠回收產(chǎn)物重新進行1%瓊脂糖凝膠電泳。據(jù)每個樣品純化產(chǎn)物的濃度與純樣品的凈光密度值（圖2.3）。由于目的條帶約300bp，因此以marker250b密度值等于1，將全部樣品凈光密度值進行標準化（樣品凈光密度值/mark度值），之后將凈光密度值....

圖2.4Illumina測序數(shù)據(jù)分析流程

12圖2.4Illumina測序數(shù)據(jù)分析流程Figure2.4TheIlluminasequencingpipelineofGalaxy高通量原始數(shù)據(jù)的處理主要在中國科學院生態(tài)環(huán)境研究中心鄧曄研究員數(shù)據(jù)分析Galaxy網(wǎng)站進行(http://159.22....

本文編號：3946371