為了全面鑒定蕨類植物中質子焦磷酸酶(AVP1)編碼基因,并構建家族進化關系,本研究首先通過檢索PfamA數(shù)據(jù)庫從AVP1蛋白序列中鑒定到了一個保守結構域,在此基礎上,結合HMMER和BLAST,從6個物種基因組中鑒定到了18條質子焦磷酸酶家族基因。進化樹構建結果表明,在勺葉槐葉萍中沒有鑒定到AVP亞家族成員;而在細葉滿江紅中沒有鑒定到AVPL亞家族成員。本研究為今后針對蕨類植物中AVP1基因功能的深入研究提供了基因靶標。

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【文章目錄】：
1 結果與分析
    1.1 保守結構域鑒定
    1.2 含PF03030.15結構域的序列挖掘
    1.3 質子焦磷酸酶基因(AVP1)基因家族進化樹構建
2 討論
3 材料與方法
    3.1 基因模型數(shù)據(jù)庫下載及修正
    3.2 保守結構域鑒定
    3.3 含有特定結構域的序列挖掘
    3.4 進化樹構建
作者貢獻



本文編號：3854131