發(fā)布時(shí)間：2023-10-15 15:02

　　為了全面鑒定蕨類(lèi)植物中質(zhì)子焦磷酸酶(AVP1)編碼基因,并構(gòu)建家族進(jìn)化關(guān)系,本研究首先通過(guò)檢索PfamA數(shù)據(jù)庫(kù)從AVP1蛋白序列中鑒定到了一個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,在此基礎(chǔ)上,結(jié)合HMMER和BLAST,從6個(gè)物種基因組中鑒定到了18條質(zhì)子焦磷酸酶家族基因。進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建結(jié)果表明,在勺葉槐葉萍中沒(méi)有鑒定到AVP亞家族成員;而在細(xì)葉滿江紅中沒(méi)有鑒定到AVPL亞家族成員。本研究為今后針對(duì)蕨類(lèi)植物中AVP1基因功能的深入研究提供了基因靶標(biāo)。

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【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 保守結(jié)構(gòu)域鑒定
    1.2 含PF03030.15結(jié)構(gòu)域的序列挖掘
    1.3 質(zhì)子焦磷酸酶基因(AVP1)基因家族進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
2 討論
3 材料與方法
    3.1 基因模型數(shù)據(jù)庫(kù)下載及修正
    3.2 保守結(jié)構(gòu)域鑒定
    3.3 含有特定結(jié)構(gòu)域的序列挖掘
    3.4 進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
作者貢獻(xiàn)



本文編號(hào)：3854131