S-腺苷甲硫氨酸脫羧酶(S-adenosylmethionine decarboxylase, SAMDC)是生物體內(nèi)亞精胺合成過程中的限速酶,在植物生長(zhǎng)發(fā)育及抗逆境脅迫方面起到重要的調(diào)節(jié)作用。本研究通過RT-PCR技術(shù)從大白菜栽培種Chiifu-401中克隆得到一個(gè)BrSAMDC基因,并對(duì)其進(jìn)行表達(dá)特性及其蛋白的結(jié)構(gòu)與功能進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,BrSAMDC的cDNA擴(kuò)增序列為1 566 bp,CDS區(qū)為1 107 bp,編碼368個(gè)氨基酸。定量PCR結(jié)果顯示,BrSAMDC基因在白菜的各個(gè)組織均有較高表達(dá),其中角果中的表達(dá)量最高,其次為花、莖和根,而在葉片中的表達(dá)量最低。BrSAMDC蛋白分子量為40.52 kD,屬于親水、穩(wěn)定蛋白;預(yù)測(cè)其分布于細(xì)胞核內(nèi),不存在信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)域;二級(jí)結(jié)構(gòu)中以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主,三級(jí)結(jié)構(gòu)同源建模成功。14種植物SAMDC蛋白的序列對(duì)比分析顯示,均含有LSESSLF結(jié)構(gòu)域和PEST結(jié)構(gòu)域,且十分保守;十字花科的SAMDC蛋白同源性較高,且其氨基酸的進(jìn)化與植物分化具有一致性。本研究為白菜SAMDC基因的功能研究及應(yīng)用提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 白菜總RNA提取及c DNA第一鏈合成
    1.2 白菜BrSAMDC基因的克隆
    1.3 白菜BrSAMDC基因表達(dá)分析
    1.4 白菜BrSAMDC蛋白的生物信息學(xué)分析
        1.4.1 BrSAMDC蛋白質(zhì)基本理化特征預(yù)測(cè)
        1.4.2 BrSAMDC蛋白功能預(yù)測(cè)
        1.4.3 白菜BrSAMDC蛋白的結(jié)構(gòu)分析
        1.4.4 同源序列和進(jìn)化樹
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗(yàn)材料
    3.2 白菜總RNA提取及cDNA合成
    3.3 白菜BrSAMDC基因的克隆
    3.4 BrSAMDC基因表達(dá)分析
    3.5 生物信息學(xué)分析
作者貢獻(xiàn)



本文編號(hào)：3838789