歐洲型PRRSV反向遺傳操作平臺(tái)構(gòu)建及轉(zhuǎn)錄特性分析
發(fā)布時(shí)間:2023-07-24 21:44
豬繁殖與呼吸綜合征(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome,PRRS)是目前全球養(yǎng)豬業(yè)面臨的最大困擾之一,由豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus,PRRSV)引起。該病毒具有變異度高,變異速度快的特點(diǎn),該病的蔓延給全球養(yǎng)豬業(yè)造成了難以估量的損失,有效防控豬繁殖與呼吸綜合征對(duì)養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展十分重要。PRRSV亞基因組RNA(sg RNA)的轉(zhuǎn)錄過程是不連續(xù)的,轉(zhuǎn)錄過程中會(huì)形成一系列具有相同5’和3’末端的亞基因組sg RNA。從PRRSV這一特殊的轉(zhuǎn)錄機(jī)制入手,或許會(huì)為PRRSV防控找到新思路。目前發(fā)現(xiàn)PRRSV的轉(zhuǎn)錄過程由基因組中眾多的轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列(Transcriptional regulatory sequence,TRS)調(diào)控,包括位于5’UTR中的Leader-TRS和位于基因組內(nèi)的Body-TRS。根據(jù)地域分布的不同和基因差異,PRRSV被分為兩種基因型,分別是歐洲型(I型)和美洲型(II型)。兩種基因型的PRRSV不僅核酸同源性低,...
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 豬繁殖與呼吸綜合征病毒
1.1.1 PRRSV的概述
1.1.2 PRRSV的基因組結(jié)構(gòu)
1.1.3 PRRSV遺傳變異分析
1.1.4 PRRSV的蛋白及其功能
1.2 PRRSV轉(zhuǎn)錄機(jī)制的研究進(jìn)展
1.3 PRRSV反向遺傳學(xué)研究進(jìn)展
1.4 研究的目的與意義
第二章 PRRSV LLV-1 毒株反向遺傳平臺(tái)建立及轉(zhuǎn)錄特性分析
2.1 材料
2.1.1 細(xì)胞、毒株及質(zhì)粒
2.1.3 試劑與耗材
2.1.4 試驗(yàn)儀器
2.2 方法
2.2.1 PRRSV歐洲型LLV-1 毒株反向遺傳平臺(tái)的建立
2.2.2 高通量測(cè)序樣品的制備及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 重組質(zhì)粒PCDNA3.1-LLV-1 的構(gòu)建
2.3.2 LLV-1病毒分離株的拯救
2.3.3 LLV-1毒株轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)分析
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第三章 歐美嵌合型PRRSV的拯救
3.1 材料
3.2 方法
3.2.1 嵌合毒株P(guān)CDNA3.1-LLV-1-HUN4 的構(gòu)建
3.2.2 嵌合毒株LLV-1-HUN4 的拯救
3.2.3 嵌合毒株LLV-1-HUN4 病毒學(xué)特征的鑒定
3.3 結(jié)果
3.3.1 PCDNA3.1-LLV-1-HUN4 質(zhì)粒構(gòu)建
3.3.2 LLV-1-HuN4嵌合病毒的拯救
3.3.3 LLV-1-HUN4 增殖及誘導(dǎo)IL-8/IL-10 表達(dá)特性
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第四章 TRS及其側(cè)翼序列對(duì)外源蛋白表達(dá)的影響
4.1 材料
4.2 方法
4.2.1 探究外源基因插入位置對(duì)于外源基因表達(dá)的影響
4.2.2 探究B-TRS對(duì)于外源基因表達(dá)的影響
4.3 結(jié)果
4.3.1 插入位置對(duì)于外源基因表達(dá)的影響
4.3.2 B-TRS對(duì)于外源基因表達(dá)的影響
4.4 討論
4.5 小結(jié)
第五章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3836580
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 豬繁殖與呼吸綜合征病毒
1.1.1 PRRSV的概述
1.1.2 PRRSV的基因組結(jié)構(gòu)
1.1.3 PRRSV遺傳變異分析
1.1.4 PRRSV的蛋白及其功能
1.2 PRRSV轉(zhuǎn)錄機(jī)制的研究進(jìn)展
1.3 PRRSV反向遺傳學(xué)研究進(jìn)展
1.4 研究的目的與意義
第二章 PRRSV LLV-1 毒株反向遺傳平臺(tái)建立及轉(zhuǎn)錄特性分析
2.1 材料
2.1.1 細(xì)胞、毒株及質(zhì)粒
2.1.3 試劑與耗材
2.1.4 試驗(yàn)儀器
2.2 方法
2.2.1 PRRSV歐洲型LLV-1 毒株反向遺傳平臺(tái)的建立
2.2.2 高通量測(cè)序樣品的制備及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 重組質(zhì)粒PCDNA3.1-LLV-1 的構(gòu)建
2.3.2 LLV-1病毒分離株的拯救
2.3.3 LLV-1毒株轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)分析
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第三章 歐美嵌合型PRRSV的拯救
3.1 材料
3.2 方法
3.2.1 嵌合毒株P(guān)CDNA3.1-LLV-1-HUN4 的構(gòu)建
3.2.2 嵌合毒株LLV-1-HUN4 的拯救
3.2.3 嵌合毒株LLV-1-HUN4 病毒學(xué)特征的鑒定
3.3 結(jié)果
3.3.1 PCDNA3.1-LLV-1-HUN4 質(zhì)粒構(gòu)建
3.3.2 LLV-1-HuN4嵌合病毒的拯救
3.3.3 LLV-1-HUN4 增殖及誘導(dǎo)IL-8/IL-10 表達(dá)特性
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第四章 TRS及其側(cè)翼序列對(duì)外源蛋白表達(dá)的影響
4.1 材料
4.2 方法
4.2.1 探究外源基因插入位置對(duì)于外源基因表達(dá)的影響
4.2.2 探究B-TRS對(duì)于外源基因表達(dá)的影響
4.3 結(jié)果
4.3.1 插入位置對(duì)于外源基因表達(dá)的影響
4.3.2 B-TRS對(duì)于外源基因表達(dá)的影響
4.4 討論
4.5 小結(jié)
第五章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3836580
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