雙歧桿菌是人體腸道菌群中一類重要的微生物,一些雙歧桿菌與其宿主之間存在復(fù)雜的相互作用。某些特定的雙歧桿菌菌株已被證明具有拮抗腸侵襲性致病菌、抑制結(jié)直腸癌、抑制炎癥性腸病以及緩解便秘等功能。長雙歧桿菌是嬰兒和成人腸道菌群中存在最廣泛的一種雙歧桿菌,本研究從比較基因組分析、體外特性和體內(nèi)功能（緩解結(jié)腸炎）三個方面對其多樣性進行了研究,得出主要結(jié)論如下:（1）基于高通量測序技術(shù),分析了不同地區(qū)、年齡、民族和性別人群的腸道微生物組成,及雙歧桿菌的組成。多元統(tǒng)計分析的結(jié)果顯示,不同地區(qū)、年齡、民族的人群在菌群組成上存在差異;通過隨機森林分析法,發(fā)現(xiàn)雙歧桿菌的是不同人群之間差異較大的一個屬,其中西藏當(dāng)雄地區(qū)藏族人群的樣品中雙歧桿菌的豐度顯著高于其他地區(qū)和民族人群的樣品,兒童樣品中雙歧桿菌的豐度顯著高于成年樣品;不同性別人群的腸道微生物組成沒有顯著差異。雙歧桿菌的高通量分析結(jié)果顯示,長雙歧桿菌是所有人群腸道中相對豐度最高的雙歧桿菌,其平均相對豐度達34.30%;地區(qū)、年齡和民族因素對腸道中雙歧桿菌組成具有影響,其中西藏當(dāng)雄的樣品中B.kashiwanohense的相對豐度顯著高于其他地區(qū)的樣品,壯族... 

【文章頁數(shù)】：122 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略符號對照表
第一章 緒論
    1.1 腸道微生物與人體生理健康
    1.2 雙歧桿菌的多樣性
        1.2.1 雙歧桿菌的種類及分布
        1.2.2 雙歧桿菌多樣性的研究方法
        1.2.3 影響腸道雙歧桿菌組成的因素
    1.3 長雙歧桿菌的多樣性及其基因組學(xué)
    1.4 長雙歧桿菌的主要生理功能及菌株間差異
        1.4.1 長雙歧桿菌的主要生理功能
        1.4.2 長雙歧桿菌對結(jié)腸炎的改善作用及其免疫調(diào)節(jié)作用的菌株間差異
    1.5 長雙歧桿菌的應(yīng)用
    1.6 立題意義及研究內(nèi)容
        1.6.1 立題意義
        1.6.2 主要研究內(nèi)容
第二章 不同人群腸道菌群及長雙歧桿菌多樣性的分析
    2.1 前言
    2.2 材料與設(shè)備
        2.2.1 主要試劑
        2.2.2 培養(yǎng)基
        2.2.3 主要儀器設(shè)備
    2.3 實驗方法
        2.3.1 樣品采集
        2.3.2 糞便總DNA的提取
        2.3.3 16SrRNA和GroEL基因擴增子高通量測序及數(shù)據(jù)分析
        2.3.4 糞便樣品中雙歧桿菌的分離純化、鑒定和保藏
        2.3.5 長雙歧桿菌全基因組的測序、組裝和生物信息學(xué)分析
        2.3.6 統(tǒng)計分析
    2.4 結(jié)果與討論
        2.4.1 基于16SrRNA序列的腸道菌群分析
        2.4.2 基于GroEL基因的雙歧桿菌組成多樣性分析
        2.4.3 糞便樣品中長雙歧桿菌的分離、純化
        2.4.4 長雙歧桿菌比較基因組學(xué)分析
    2.5 本章小結(jié)
第三章 長雙歧桿菌功能基因和體外特性的比較分析
    3.1 前言
    3.2 材料與設(shè)備
        3.2.1 主要試劑
        3.2.2 培養(yǎng)基
        3.2.3 主要儀器設(shè)備
    3.3 實驗方法
        3.3.1 直系同源基因分析
        3.3.2 共線性分析
        3.3.3 COG功能基因注釋
        3.3.4 全基因組序列比對
        3.3.5 雙歧桿菌體外特性的分析
    3.4 結(jié)果與討論
        3.4.1 長雙歧桿菌直系同源基因分析
        3.4.2 長雙歧桿菌COG功能基因組成的比較分析
        3.4.3 長雙歧桿菌全基因組序列比對
        3.4.4 碳水化合物代謝相關(guān)基因的比較分析
        3.4.5 胞外多糖合成基因簇的分析
        3.4.6 S-層蛋白基因的比對分析
        3.4.7 長雙歧桿菌菌株特性的比較分析
    3.5 本章小結(jié)
第四章 不同長雙歧桿菌對結(jié)腸炎的改善作用
    4.1 前言
    4.2 材料與設(shè)備
        4.2.1 菌株與細胞株
        4.2.2 實驗動物
        4.2.3 主要試劑
        4.2.4 主要儀器
    4.3 實驗方法
        4.3.1 雙歧桿菌的培養(yǎng)
        4.3.2 細胞實驗設(shè)計
        4.3.3 動物實驗設(shè)計
        4.3.4 細胞培養(yǎng)上清液及動物血清中細胞因子的測定
        4.3.5 結(jié)腸組織中髓過氧化物酶(MPO)的測定
        4.3.6 結(jié)腸組織細胞因子和緊密連接蛋白表達水平的測定
        4.3.7 結(jié)腸組織病理切片的制作、蘇木素-伊紅(HE)染色和組織損傷評分
        4.3.8 結(jié)腸粘液層的阿利新藍染色
        4.3.9 統(tǒng)計分析
    4.4 結(jié)果與討論
        4.4.1 長雙歧桿菌對炎癥狀態(tài)腸上皮細胞炎癥因子表達的影響
        4.4.2 長雙歧桿菌對結(jié)腸炎小鼠的改善作用
    4.5 本章小結(jié)
第五章 不同長雙歧桿菌免疫調(diào)節(jié)差異性的機制分析
    5.1 前言
    5.2 材料與設(shè)備
        5.2.1 菌株與細胞株
        5.2.2 主要試劑
        5.2.3 主要儀器
    5.3 實驗方法
        5.3.1 雙歧桿菌的培養(yǎng)
        5.3.2 無細胞發(fā)酵液的準(zhǔn)備
        5.3.3 莢膜多糖的提取
        5.3.4 菌體S-層蛋白的提取
        5.3.5 HT-29細胞的培養(yǎng)
        5.3.6 炎癥狀態(tài)細胞的誘導(dǎo)
        5.3.7 細胞培養(yǎng)上清液中炎癥因子的測定
        5.3.8 HT-29細胞中炎癥因子及緊密連接蛋白表達水平的檢測
        5.3.9 統(tǒng)計分析
    5.4 結(jié)果與討論
        5.4.1 不同菌株發(fā)酵上清液對炎癥狀態(tài)HT-29細胞的影響
        5.4.2 不同菌株莢膜多糖對炎癥狀態(tài)HT-29細胞的影響
        5.4.3 不同菌株S-層蛋白對炎癥狀態(tài)HT-29細胞的免疫調(diào)節(jié)作用
        5.4.4 長雙歧桿菌胞外多糖影響S層蛋白的免疫調(diào)節(jié)作用
    5.5 本章小結(jié)
第六章 產(chǎn)黏性胞外多糖長雙歧桿菌YS108R在發(fā)酵乳中的應(yīng)用及其對結(jié)腸炎的改善作用
    6.1 前言
    6.2 材料與設(shè)備
        6.2.1 菌株
        6.2.2 主要試劑
        6.2.3 主要儀器
    6.3 實驗方法
        6.3.1 發(fā)酵乳的制備
        6.3.2 發(fā)酵乳理化指標(biāo)的測定
        6.3.3 電子鼻分析
        6.3.4 感官品評
        6.3.5 動物實驗設(shè)計
        6.3.6 結(jié)腸組織中髓過氧化物酶(MPO)活性的測定
        6.3.7 血清中細胞因子的測定
        6.3.8 結(jié)腸組織中細胞因子和緊密連接蛋白表達水平的RT-PCR測定
        6.3.9 結(jié)腸組織切片的制作和觀察
        6.3.10 16SrRNA基因V3-V4區(qū)擴增子高通量測序和糞便菌群的分析
        6.3.11 統(tǒng)計分析
    6.4 結(jié)果與討論
        6.4.1 發(fā)酵乳理化特性的分析
        6.4.2 YS108R發(fā)酵乳對結(jié)腸炎的影響
    6.5 本章小結(jié)
主要結(jié)論與展望
    主要結(jié)論
    展望
論文創(chuàng)新點
致謝
參考文獻
附錄1:作者在攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的論文
附錄2:用于比較基因組學(xué)分析的基因組信息
附錄3:不同長雙歧桿菌S-層蛋白基因相應(yīng)的氨基酸序列比對
附錄4:長雙歧桿菌C11A10B和YS108R基因組比對圈圖


【參考文獻】：
期刊論文
[1]血紅蛋白及其衍生物在食品中的應(yīng)用[J]. 宋璇,侯成立,高遠,朱杰,張德權(quán).  中國食品學(xué)報. 2018(07)
[2]分娩方式及性別對母乳喂養(yǎng)嬰兒腸道菌群的影響[J]. 李菊芳,姜鐵民,賈妮,侯海鷗,陳歷俊,戴耀華.  中國婦幼健康研究. 2017(09)
[3]3株益生菌體外降膽固醇能力及體內(nèi)降血脂效果評價[J]. 韋云路,劉義,王瑤,孟祥飛,李平蘭.  食品科學(xué). 2017(23)
[4]普拉梭菌與腸道疾病關(guān)系的研究進展[J]. 黃曉麗,王國品,于成功.  世界華人消化雜志. 2017(09)
[5]嬰兒糞便長雙歧桿菌的分離與多樣性分析[J]. 張秋雪,劉曉嬋,朱宗濤,萬峰,孫思睿,賈芳芳,孟祥晨.  食品科學(xué). 2017(24)
[6]四磨湯口服液聯(lián)合雙歧桿菌三聯(lián)活菌膠囊治療小兒功能性消化不良療效觀察[J]. 齊冰.  中國中西醫(yī)結(jié)合兒科學(xué). 2016(04)
[7]長雙歧桿菌BBMN68誘導(dǎo)的樹突狀細胞對小鼠牛乳β-乳球蛋白過敏的緩解作用[J]. 楊景,羅緒剛,任發(fā)政.  現(xiàn)代食品科技. 2016(07)
[8]短鏈脂肪酸的研究進展[J]. 萬曉,王新穎,李寧.  中華胃腸外科雜志. 2015 (09)
[9]Pediatric functional constipation treatment with Bifi dobacterium-containing yogurt:A crossover,double-blind,controlled trial[J]. Paula VP Guerra,Luiza N Lima,Tassia C Souza,Vanessa Mazochi,Francisco J Penna,Andreia M Silva,Jacques R Nicoli,Elizabet V Guimares.  World Journal of Gastroenterology. 2011(34)
[10]長雙歧桿菌BBMN68對便秘模型小鼠的通便作用[J]. 丁圣,蔣菁莉,劉松玲,劉愛萍,任發(fā)政.  食品科學(xué). 2011(03)

博士論文
[1]雙歧桿菌對便秘的影響及其作用機理研究[D]. 王琳琳.江南大學(xué) 2017
[2]復(fù)雜樣品中雙歧桿菌的高通量檢測和菌種高效分離方法的研究[D]. 胡陸軍.江南大學(xué) 2017
[3]乳桿菌表層蛋白的理化性質(zhì)和生物學(xué)功能研究[D]. 孟珺.江南大學(xué) 2016
[4]以健康人和大熊貓為模型的哺乳動物腸道菌群多樣性分布與核心功能種屬的研究[D]. 薛正晟.上海交通大學(xué) 2015
[5]廣西巴馬長壽老人腸道菌群及其與膳食纖維多糖飲食關(guān)聯(lián)性研究[D]. 王芳.廣西大學(xué) 2015
[6]功能性低聚糖對腸道細菌的影響及機制[D]. 毛丙永.江南大學(xué) 2015
[7]蒙古族腸道核心菌群及其與飲食關(guān)聯(lián)性研究[D]. 張家超.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[8]應(yīng)用焦磷酸測序技術(shù)對不同人群腸道微生物群落結(jié)構(gòu)的研究[D]. 郭壯.江南大學(xué) 2013
[9]酸乳質(zhì)量及其胞外多糖的研究[D]. 李全陽.江南大學(xué) 2004

碩士論文
[1]產(chǎn)細菌素乳酸菌對小鼠腸道微生態(tài)的影響[D]. 俞赟霞.江南大學(xué) 2018
[2]雙歧桿菌生理特性與其腸道定殖能力相關(guān)性的研究[D]. 韓俊燕.江南大學(xué) 2016
[3]雙歧桿菌高效濃縮型酸奶發(fā)酵劑制備關(guān)鍵技術(shù)研究[D]. 種克.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[4]雙歧桿菌胡蘿卜汁酸乳工藝研究[D]. 李雅乾.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



本文編號：3674583