馬鈴薯鋅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白（Solanum tuberosum zinc transporter 11,StZnT11）對(duì)于維持細(xì)胞中鋅穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要。通過(guò)研究StZnT11在非生物脅迫和生物脅迫下的表達(dá)情況,為驗(yàn)證馬鈴薯StZnT11在青枯菌生物脅迫過(guò)程中的作用奠定了基礎(chǔ)。從前期工作獲得的表達(dá)文庫(kù)中得到EST序列,利用NCBI中的Blast工具,對(duì)原始序列進(jìn)行同源性分析,選擇與原始序列的相似度、覆蓋度、e期望值最高的一條同源對(duì)象序列。通過(guò)電子克隆,得到StZnT11基因。采用生物信息學(xué)方法對(duì)StZnT11基因的基因序列及編碼的氨基酸組成、理化性質(zhì)、分子進(jìn)化、磷酸化位點(diǎn)、高級(jí)結(jié)構(gòu)等多角度進(jìn)行分析。結(jié)果表明,該基因cDNA全長(zhǎng)1300bp,編碼348個(gè)氨基酸,編碼蛋白含23個(gè)磷酸化位點(diǎn),有1個(gè)信號(hào)肽,有9個(gè)跨膜區(qū)域,是定位在質(zhì)膜上的疏水性蛋白。通過(guò)氨基酸序列比對(duì),StZnT11蛋白與煙草、番茄和辣椒等植物中的鋅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白同源性較高。實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)檢測(cè)結(jié)果表明,StZnT11在不同濃度的外源植物激素脫落酸（ABA）的作用下上調(diào)。組織定位檢測(cè)提示StZnT11主要表達(dá)于特定組織（莖維管系統(tǒng)的韌皮... 

【文章來(lái)源】：生物工程學(xué)報(bào). 2020,36(02)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【文章目錄】：
1材料與方法
    1.1植物與菌株
    1.2生物信息學(xué)分析
        1.2.1基因克隆
        1.2.2基因序列分析
        1.2.3基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
        1.2.4基因的啟動(dòng)子分析
    1.3激素處理
    1.4青枯菌處理
    1.5用RT-q PCR測(cè)定St Zn T11基因表達(dá)
        1.5.1 RNA制備
        1.5.2 cDNA全長(zhǎng)的獲得
        1.5.3 Real-time PCR
    1.6熒光原位雜交
2結(jié)果與分析
    2.1生物信息學(xué)分析
    2.2 StZnT11蛋白的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和分析
    2.3氨基酸同源性分析及進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建
    2.4 St Zn T11啟動(dòng)子預(yù)測(cè)和分析
    2.5植物激素誘導(dǎo)的StZnT11表達(dá)模式
    2.6青枯菌誘導(dǎo)的StZnT11表達(dá)模式
    2.7 StZnT11表達(dá)的組織定位
3討論


【參考文獻(xiàn)】：
博士論文
[1]青枯菌誘導(dǎo)的馬鈴薯防衛(wèi)相關(guān)基因克隆與表達(dá)[D]. 郜剛.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008



本文編號(hào)：3632873