馬鈴薯鋅轉(zhuǎn)運蛋白（Solanum tuberosum zinc transporter 11,StZnT11）對于維持細胞中鋅穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要。通過研究StZnT11在非生物脅迫和生物脅迫下的表達情況,為驗證馬鈴薯StZnT11在青枯菌生物脅迫過程中的作用奠定了基礎。從前期工作獲得的表達文庫中得到EST序列,利用NCBI中的Blast工具,對原始序列進行同源性分析,選擇與原始序列的相似度、覆蓋度、e期望值最高的一條同源對象序列。通過電子克隆,得到StZnT11基因。采用生物信息學方法對StZnT11基因的基因序列及編碼的氨基酸組成、理化性質(zhì)、分子進化、磷酸化位點、高級結(jié)構(gòu)等多角度進行分析。結(jié)果表明,該基因cDNA全長1300bp,編碼348個氨基酸,編碼蛋白含23個磷酸化位點,有1個信號肽,有9個跨膜區(qū)域,是定位在質(zhì)膜上的疏水性蛋白。通過氨基酸序列比對,StZnT11蛋白與煙草、番茄和辣椒等植物中的鋅轉(zhuǎn)運蛋白同源性較高。實時熒光定量聚合酶鏈反應檢測結(jié)果表明,StZnT11在不同濃度的外源植物激素脫落酸（ABA）的作用下上調(diào)。組織定位檢測提示StZnT11主要表達于特定組織（莖維管系統(tǒng)的韌皮... 

【文章來源】：生物工程學報. 2020,36(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1材料與方法
    1.1植物與菌株
    1.2生物信息學分析
        1.2.1基因克隆
        1.2.2基因序列分析
        1.2.3基因的系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
        1.2.4基因的啟動子分析
    1.3激素處理
    1.4青枯菌處理
    1.5用RT-q PCR測定St Zn T11基因表達
        1.5.1 RNA制備
        1.5.2 cDNA全長的獲得
        1.5.3 Real-time PCR
    1.6熒光原位雜交
2結(jié)果與分析
    2.1生物信息學分析
    2.2 StZnT11蛋白的結(jié)構(gòu)預測和分析
    2.3氨基酸同源性分析及進化樹的構(gòu)建
    2.4 St Zn T11啟動子預測和分析
    2.5植物激素誘導的StZnT11表達模式
    2.6青枯菌誘導的StZnT11表達模式
    2.7 StZnT11表達的組織定位
3討論


【參考文獻】：
博士論文
[1]青枯菌誘導的馬鈴薯防衛(wèi)相關(guān)基因克隆與表達[D]. 郜剛.中國農(nóng)業(yè)科學院 2008



本文編號：3632873