利用Crispr/Cas9技術(shù)構(gòu)建影響先天性心臟病關(guān)鍵基因的表達(dá)載體
發(fā)布時(shí)間:2022-02-09 00:44
目的利用Crispr/Cas9技術(shù)構(gòu)建影響先天性心臟病關(guān)鍵基因表達(dá)載體,為后續(xù)基因編輯工作做好前期分子實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。方法利用NCBI數(shù)據(jù)庫檢索調(diào)控先天性心臟病關(guān)鍵基因NKX2-5、GATA4、TBX5,通過生物軟件在線設(shè)計(jì)3個(gè)基因?qū)?yīng)的sgRNA。對慢性病毒載體lentiCRISPRv2進(jìn)行BsmB I單酶切,通過膠回收獲得線性化載體。利用T4連接酶將處理后的雙鏈sgRNA和載體連接,通過大腸桿菌轉(zhuǎn)化、質(zhì)粒提取和測序最終得到lentiCRISPRv2-NKX2-5、lentiCRISPRv2-GATA4、lentiCRISPRv2-TBX5 3種病毒表達(dá)載體。結(jié)果獲得評分最高且堿基數(shù)量合適的sgRNA,通過對表達(dá)載體的線性化酶切,成功去除載體中2 000 bp左右的置換片段,對連接后的載體測序顯示雙鏈sgRNA與病毒表達(dá)載體置換片段序列一致。結(jié)論利用Crispr/Cas9可成功構(gòu)建先天性心臟病關(guān)鍵基因NKX2-5、GATA4、TBX5病毒表達(dá)載體。
【文章來源】:蘭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2020,46(01)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
sgRNA序列
利用T4連接酶將sgRNA雙鏈和載體長片段混勻后置于4°C過夜反應(yīng),見圖1。反應(yīng)體系:T4連接酶1μL,T4 Buffer 5μL,回收載體2μL,目的基因2μL。12~16 h后將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化進(jìn)入DH5a感受態(tài),方法:將連接后的感受肽均勻涂布于LB(Luria-Bertani)固體培養(yǎng)基(AMP100μg/mL),晾干后倒置于37°C恒溫培養(yǎng)過夜。隔日挑選單一白色菌落接種于液體LB培養(yǎng)基(AMP100μg/mL),振蕩(37°C,150 r/min)培養(yǎng)。使用超純質(zhì)粒DNA純化試劑盒提取質(zhì)粒,送至諾禾致源科技股份有限公司測序。2 結(jié)果
利用BsmB I內(nèi)切酶分別酶切3份載體,Marker作為片段大小參照,見圖2;對照質(zhì)粒沒有被酶切,在酶切質(zhì)粒中分別得到一條2 000 bp左右的條帶,該條帶即為置換片段,后續(xù)工作只需回收載體長片段即可。2.3 載體回收
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NKX2-5、TBX5、GATA4基因與先天性心臟病關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 杜佳,易豈建. 兒科藥學(xué)雜志. 2018(05)
[2]Nodal信號通路、Nodal纖毛與先天性心臟病研究進(jìn)展[J]. 孫曉瑋,張建剛,謝小冬. 蘭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(04)
[3]GATA4基因多態(tài)性與先天性心臟病相關(guān)性研究[J]. 尤濤,丁兆紅,劉興光,王新寬,侯小東,丁凡,移康. 蘭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(01)
本文編號:3616062
【文章來源】:蘭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2020,46(01)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
sgRNA序列
利用T4連接酶將sgRNA雙鏈和載體長片段混勻后置于4°C過夜反應(yīng),見圖1。反應(yīng)體系:T4連接酶1μL,T4 Buffer 5μL,回收載體2μL,目的基因2μL。12~16 h后將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化進(jìn)入DH5a感受態(tài),方法:將連接后的感受肽均勻涂布于LB(Luria-Bertani)固體培養(yǎng)基(AMP100μg/mL),晾干后倒置于37°C恒溫培養(yǎng)過夜。隔日挑選單一白色菌落接種于液體LB培養(yǎng)基(AMP100μg/mL),振蕩(37°C,150 r/min)培養(yǎng)。使用超純質(zhì)粒DNA純化試劑盒提取質(zhì)粒,送至諾禾致源科技股份有限公司測序。2 結(jié)果
利用BsmB I內(nèi)切酶分別酶切3份載體,Marker作為片段大小參照,見圖2;對照質(zhì)粒沒有被酶切,在酶切質(zhì)粒中分別得到一條2 000 bp左右的條帶,該條帶即為置換片段,后續(xù)工作只需回收載體長片段即可。2.3 載體回收
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NKX2-5、TBX5、GATA4基因與先天性心臟病關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 杜佳,易豈建. 兒科藥學(xué)雜志. 2018(05)
[2]Nodal信號通路、Nodal纖毛與先天性心臟病研究進(jìn)展[J]. 孫曉瑋,張建剛,謝小冬. 蘭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(04)
[3]GATA4基因多態(tài)性與先天性心臟病相關(guān)性研究[J]. 尤濤,丁兆紅,劉興光,王新寬,侯小東,丁凡,移康. 蘭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(01)
本文編號:3616062
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