本研究通過克隆香樟植物的1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶（DXS）基因,進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為香樟DXS基因的功能及其表達(dá)調(diào)控提供基礎(chǔ)。根據(jù)香樟轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中注釋為DXS的核苷酸拼接序列,設(shè)計(jì)特異性引物,進(jìn)行香樟DXS基因的克隆,應(yīng)用熒光定量PCR方法分析DXS基因在香樟根、莖和葉中的表達(dá)量。克隆獲得香樟DXS基因,其c DNA序列長度為2 333 bp,開放讀碼閱讀框（ORF）為2 187 bp,編碼728個(gè)氨基酸,含有轉(zhuǎn)酮醇酶等3個(gè)保守結(jié)構(gòu)域。香樟DXS蛋白定位于葉綠體,是一個(gè)不含信號(hào)肽、無跨膜結(jié)構(gòu)域的親水性穩(wěn)定蛋白,且蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)主要為α-螺旋和無規(guī)則卷曲。通過氨基酸序列同源性分析發(fā)現(xiàn),香樟DXS氨基酸序列與黃蘭和魚腥草的DXS氨基酸序列相似性較高,均為85%。分子進(jìn)化樹結(jié)果表明,香樟DXS蛋白與黃蘭DXS蛋白親緣關(guān)系較近。組織特異性表達(dá)分析結(jié)果顯示,DXS在香樟葉與莖中的表達(dá)量高于根。成功克隆獲得香樟DXS基因,研究結(jié)果為進(jìn)一步探討香樟DXS基因在萜類物質(zhì)生物合成途徑中的作用提供理論依據(jù)。 

【文章來源】：基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

PCR擴(kuò)增香樟DXS基因

CcDXS的ORF序列及其編碼蛋白質(zhì)的氨基酸序列

香樟DXS三級(jí)結(jié)構(gòu)建模

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號(hào)：3598357