黑水虻金屬硫蛋白基因的鑒定及功能研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-15 01:40
黑水虻Hermetia illucens幼蟲是重要的資源昆蟲。一方面幼蟲可以轉(zhuǎn)化多種有機(jī)廢棄物,另一方面幼蟲富含脂質(zhì)和蛋白質(zhì),可用作畜禽養(yǎng)殖和水產(chǎn)養(yǎng)殖的優(yōu)質(zhì)飼料。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn)黑水虻幼蟲可以在高濃度的重金屬環(huán)境中存活,因而可利用黑水虻來(lái)處理重金屬污染的有機(jī)廢棄物,如畜禽養(yǎng)殖場(chǎng)的糞便、重金屬污染農(nóng)田的農(nóng)作物秸稈。有關(guān)黑水虻對(duì)重金屬耐受性,人們已表征了其生物學(xué)參數(shù),但分子機(jī)制還不清楚。本研究擬從金屬硫蛋白基因的角度出發(fā),探究其在黑水虻重金屬耐受性中的作用。主要結(jié)果如下:1.黑水虻內(nèi)參基因穩(wěn)定性評(píng)價(jià)不同條件下內(nèi)參基因的穩(wěn)定性排序結(jié)果不同,在不同組織條件下EF1和Actin的穩(wěn)定性最佳;不同發(fā)育階段應(yīng)選用Actin和RPL8;不同性別應(yīng)選用Tubulin和RPL8。通過(guò)綜合6個(gè)條件下的內(nèi)參基因表達(dá)情況及Ref Finder計(jì)算結(jié)果,Actin和RP49的穩(wěn)定性綜合排名最高。2.黑水虻MT基因序列及表達(dá)模式分析從黑水虻幼蟲轉(zhuǎn)錄組中克隆得到三個(gè)金屬硫蛋白基因(BSFMT1、BSFMT2A和BSFMT2B)的c DNA序列。表達(dá)模式分析表明BSFMT1在整個(gè)幼蟲階段低表達(dá),但在成蟲與脂肪體中高表達(dá)。...
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
黑水虻MT基因重組選用的酶切位點(diǎn)(黑色三角標(biāo)示)
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文16表2-4黑水虻MT基因原核表達(dá)引物Table2-4PrimerforheterologousgeneexpressionofBSFMT圖2-2pET-42a克隆載體結(jié)構(gòu)圖Fig.2-2ThestructureofpET-42avector注:本研究中選用的兩個(gè)酶切位點(diǎn)由三角符號(hào)標(biāo)注(SpeI和XhoI);騁ene引物序列(5’-3’)Primersequence(5’-3’)BSFMT1F:CATGACTAGTATGCCTTGTCCGGGATGTR:CTCACTCGAGTCAATCCTTCCTTCCTTGGCBSFMT2AF:CATGACTAGTATGGGTTGTCCAAAGTGR:CTCACTCGAGTTATTTACAGCATTTCTCTTTTBSFMT2BF:CATGACTAGTATGCCCTGCGGAGGTTR:CTCACTCGAGTCACTTCCCTTTGCAGCATT
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文22RT-qPCR分析8個(gè)候選內(nèi)參基因在6種不同條件下的表達(dá)模式(Ct值對(duì)應(yīng)內(nèi)參基因的表達(dá)水平)。Ct值范圍為16.96(GAPDH)到36.95(TBP),其中絕大部分Ct值在19到26之間。在這些基因中,RPL8(22.86),Actin(22.94)和RP49(22.10)是表達(dá)量最豐富的基因,在23個(gè)循環(huán)后就達(dá)到了熒光閾值,TBP(30.21)的表達(dá)水平最低(圖3-1)。圖3-1所有樣品中內(nèi)參基因的Ct值Fig.3-1Ctvaluesofcandidatereferencegenesintotalsamples3.1.2候選內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析為了分析內(nèi)參基因在不同條件下的穩(wěn)定性,將6個(gè)條件分為了生物學(xué)條件和非生物學(xué)條件兩種,其中生物學(xué)條件包括不同發(fā)育階段、不同組織和不同性別,非生物學(xué)條件包括不同濃度重金屬、不同濃度抗生素、不同食物。首先對(duì)于不同發(fā)育階段條件下,NormFinder的評(píng)估結(jié)果從高到低排名為:Actin、RPL8、Tubulin、GAPDH、EF1、ATP6V1A、RP49、TBP;BestKeeper的評(píng)估結(jié)果從高到低排名為:RP49、Tubulin、RPL8、GAPDH、Actin、TBP、ATP6V1A、EF1;geNorm的評(píng)估結(jié)果從高到低排名為:ATP6V1A=GAPDH、Actin、EF1、Tubulin、RPL8、RP49以及TBP;ΔCt的評(píng)估結(jié)果從高到低排名為:Actin、Tubulin、RPL8、GAPDH、EF1、ATP6V1A、RP49以及TBP(表3-1)。通過(guò)綜合以上四種軟件的分析結(jié)果,RefFinder結(jié)果表明Actin、Tubulin和GAPDH三個(gè)內(nèi)參基因在生物學(xué)條件下穩(wěn)定性排名前三,其中Actin在不同發(fā)育條件下的穩(wěn)定性最好,TBP的穩(wěn)定性最差(圖3-2A)。
本文編號(hào):3589639
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
黑水虻MT基因重組選用的酶切位點(diǎn)(黑色三角標(biāo)示)
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文16表2-4黑水虻MT基因原核表達(dá)引物Table2-4PrimerforheterologousgeneexpressionofBSFMT圖2-2pET-42a克隆載體結(jié)構(gòu)圖Fig.2-2ThestructureofpET-42avector注:本研究中選用的兩個(gè)酶切位點(diǎn)由三角符號(hào)標(biāo)注(SpeI和XhoI);騁ene引物序列(5’-3’)Primersequence(5’-3’)BSFMT1F:CATGACTAGTATGCCTTGTCCGGGATGTR:CTCACTCGAGTCAATCCTTCCTTCCTTGGCBSFMT2AF:CATGACTAGTATGGGTTGTCCAAAGTGR:CTCACTCGAGTTATTTACAGCATTTCTCTTTTBSFMT2BF:CATGACTAGTATGCCCTGCGGAGGTTR:CTCACTCGAGTCACTTCCCTTTGCAGCATT
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文22RT-qPCR分析8個(gè)候選內(nèi)參基因在6種不同條件下的表達(dá)模式(Ct值對(duì)應(yīng)內(nèi)參基因的表達(dá)水平)。Ct值范圍為16.96(GAPDH)到36.95(TBP),其中絕大部分Ct值在19到26之間。在這些基因中,RPL8(22.86),Actin(22.94)和RP49(22.10)是表達(dá)量最豐富的基因,在23個(gè)循環(huán)后就達(dá)到了熒光閾值,TBP(30.21)的表達(dá)水平最低(圖3-1)。圖3-1所有樣品中內(nèi)參基因的Ct值Fig.3-1Ctvaluesofcandidatereferencegenesintotalsamples3.1.2候選內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析為了分析內(nèi)參基因在不同條件下的穩(wěn)定性,將6個(gè)條件分為了生物學(xué)條件和非生物學(xué)條件兩種,其中生物學(xué)條件包括不同發(fā)育階段、不同組織和不同性別,非生物學(xué)條件包括不同濃度重金屬、不同濃度抗生素、不同食物。首先對(duì)于不同發(fā)育階段條件下,NormFinder的評(píng)估結(jié)果從高到低排名為:Actin、RPL8、Tubulin、GAPDH、EF1、ATP6V1A、RP49、TBP;BestKeeper的評(píng)估結(jié)果從高到低排名為:RP49、Tubulin、RPL8、GAPDH、Actin、TBP、ATP6V1A、EF1;geNorm的評(píng)估結(jié)果從高到低排名為:ATP6V1A=GAPDH、Actin、EF1、Tubulin、RPL8、RP49以及TBP;ΔCt的評(píng)估結(jié)果從高到低排名為:Actin、Tubulin、RPL8、GAPDH、EF1、ATP6V1A、RP49以及TBP(表3-1)。通過(guò)綜合以上四種軟件的分析結(jié)果,RefFinder結(jié)果表明Actin、Tubulin和GAPDH三個(gè)內(nèi)參基因在生物學(xué)條件下穩(wěn)定性排名前三,其中Actin在不同發(fā)育條件下的穩(wěn)定性最好,TBP的穩(wěn)定性最差(圖3-2A)。
本文編號(hào):3589639
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3589639.html
最近更新
教材專著