鈣依賴型蛋白激酶（calcium-dependent protein kinases,CDPKs）是高等植物細胞中重要的鈣離子信號受體,在植物抵御逆境脅迫過程中發(fā)揮著重要作用。該研究以地黃為材料,設(shè)計特異引物,克隆地黃RgCDPK基因全長序列,并使用在線軟件進行生物信息學(xué)分析,采用熒光定量PCR技術(shù)進行組織特異性分析。結(jié)果表明:（1）克隆得到的地黃CDPK基因長度為1 770 bp,編碼589個氨基酸;（2）多序列比對和結(jié)構(gòu)分析顯示,該蛋白含有鈣依賴蛋白激酶典型結(jié)構(gòu)域絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶區(qū)及EF-手性區(qū)。系統(tǒng)進化分析表明其與擬南芥AtCDPK28的同源關(guān)系最近,因此命名為RgCDPK（Genbank登錄號為MT024235）;（3）組織特異性分析得出RgCDPK在地黃葉中表達量最高。該研究成功克隆出地黃CDPK基因,且發(fā)現(xiàn)該基因在不同組織中的表達存在差異,為以后深入研究CDPK在地黃連作障礙等生物及非生物脅迫中的分子機制提供理論基礎(chǔ)。 

【文章來源】：廣西植物. 2020,40(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

Rg CDPK基因克隆

使用NPSA server在線軟件預(yù)測Rg CDPK的二級結(jié)構(gòu)，結(jié)果表明Rg CDPK蛋白由41.94%的α-螺旋、12.05%的延伸鏈、6.62%的β-轉(zhuǎn)角和39.39%的無規(guī)卷曲組成。使用Swiss-model在線軟件預(yù)測地黃Rg CDPK的三級結(jié)構(gòu)。同源建模結(jié)果顯示(圖2),Rg CDPK與擬南芥CDPK (SMTL ID:3q5i.1)相似度為33.94%，具有較高可信度(>30%)。圖3 Rg CDPK蛋白的系統(tǒng)進化樹

圖2 Rg CDPK蛋白的三級結(jié)構(gòu)通過在線軟件對地黃Rg CDPK蛋白進行磷酸化位點預(yù)測，結(jié)果顯示，Rg CDPK蛋白整個多肽鏈有71個磷酸化位點(>0.5)，其中，絲氨酸42個，蘇氨酸23個，酪氨酸6個。

【參考文獻】：
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碩士論文
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本文編號：3586017