霍山石斛內(nèi)生真菌的多樣性、差異性及抑菌活性
發(fā)布時(shí)間:2022-01-06 16:37
目的:霍山石斛為蘭科石斛屬植物;贗llumina MiSeqTM高通量測(cè)序技術(shù),(1)比較五種不同生長(zhǎng)模式的霍山石斛內(nèi)生真菌的多樣性和差異性;(2)比較設(shè)施栽培模式下,不同生長(zhǎng)年限的霍山石斛莖段內(nèi)生真菌的多樣性和差異性;(3)通過分離、純化霍山石斛內(nèi)生真菌,篩選出霍山石斛中具有抑菌活性的內(nèi)生真菌,并進(jìn)行分子水平鑒定。探明不同生長(zhǎng)模式和不同生長(zhǎng)年限的霍山石斛內(nèi)生真菌的多樣性和差異,同時(shí)考察內(nèi)生真菌潛在的提升植株的抗病害能力,為生態(tài)栽培提供發(fā)酵菌肥研制提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。方法:(1)采用E.Z.N.ATMM Mag-Bind Soil DNA Kit的試劑盒提取DNA,通用引物ITS1和ITS2對(duì)基因組DNA進(jìn)行兩輪PCR擴(kuò)增,MiSeq測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序,得到的原始圖像數(shù)據(jù)經(jīng)過CASAVA堿基識(shí)別轉(zhuǎn)化為原始測(cè)序序列,再進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理去除引物接頭,去除嵌合體及非特異性擴(kuò)增序列,根據(jù)序列之間的相似性(97%)將序列分成不同的操作分類單元即OTU,最后進(jìn)行Alpha、Beta多樣性分析、物種分類分析、多維度分析、菌群差異分析等統(tǒng)計(jì)分析。(2)選用組織切片和組織研磨兩種方法對(duì)霍...
【文章來源】:安徽中醫(yī)藥大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【圖文】:
霍山石斛內(nèi)生真菌群落的α多樣性估計(jì)
Cladosporium、Aspergillus 、Lophiostoma、Articulospora、Diaporthe 在五種生長(zhǎng)方式的霍山石斛內(nèi)生菌中沒有明顯差異(P > 0.05),但是Alternaria在五種生長(zhǎng)方式的霍山石斛內(nèi)生菌中存在極顯著差異(P < 0.01)(圖1-3c)。圖 1-3 菌群分布組成柱狀圖a) 在門水平,b) 在屬水平,c) 高分類群的分類群定義內(nèi)生真菌群落的構(gòu)建塊五組霍山石斛內(nèi)生菌群相對(duì)豐度的統(tǒng)計(jì)比較,F(xiàn)usarium P = 0.243、Cladosporium P = 0.906、Aspergillus P = 0.619、Lophiostoma P = 0.215、Alternaria P = 0.003、Articulospora P = 0.366、Diaporthe P = 0.278.Fig. 1-3 Frequence in microbial communities from samplesa) community distribution of phylum,b) community distribution of genus,c) Taxa at high
abundance of endophytic microbiota among the five groups D. huoshanenseladosporium P = 0.906、Aspergillus P = 0.619、Lophiostoma P = 0.215、A0.003、Articulospora P = 0.366、Diaporthe P = 0.278.多樣性比較究五組霍山石斛內(nèi)生真菌菌群的相似性和差異性,選擇主法將所研究的數(shù)據(jù)可視化,即通過一系列的特征值和特征向量主要排在前幾位的特征值;分為加權(quán)主坐標(biāo)分析(Weighted UniF主坐標(biāo)分析(Unweighted UniFrac PCoA)。通過 PCoA 可以觀差異,在 PCoA 圖(圖 1-4)中,每個(gè)符號(hào)代表一個(gè)樣本,類似中樹栽、設(shè)施栽培與林下栽培、野生霍山石斛在第一坐標(biāo)軸上分差的 18.0%;在第二坐標(biāo)軸上,野生霍山石斛與林下栽培霍山石方式的霍山石斛分開,PCo2 解釋總變差的 11.0%。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同樹齡銀杏葉內(nèi)生真菌的多樣性及群落結(jié)構(gòu)分析[J]. 楊琴,鄒凱,陳愛佳,郭雪,劉學(xué)端,梁伊麗. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(01)
[2]不同產(chǎn)地甘草內(nèi)生真菌多樣性及分離條件研究[J]. 陳靜,許貞,張雪,李妍芃,劉春生. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2019(02)
[3]刺五加內(nèi)生真菌分離鑒定及抗菌活性研究[J]. 劉悅,張爽,李佳賓,沈宏偉,崔紅花,王振月. 天然產(chǎn)物研究與開發(fā). 2019(01)
[4]霍山石斛多糖對(duì)小鼠的雙向免疫調(diào)節(jié)作用[J]. 徐海軍,方予,汪俊濤,王成苗,馮瑤瑤,梁麗萍. 免疫學(xué)雜志. 2018(08)
[5]霍山石斛對(duì)小鼠肝臟細(xì)胞色素P450酶表達(dá)和活性的影響[J]. 王長(zhǎng)鎖,王凱,孟欣,歐陽(yáng)臻,戴軍,陳乃富,韓邦興,魏淵. 中國(guó)中藥雜志. 2018(21)
[6]Root microbiota shift in rice correlates with resident time in the field and developmental stage[J]. Jingying Zhang,Na Zhang,Yong-Xin Liu,Xiaoning Zhang,Bin Hu,Yuan Qin,Haoran Xu,Hui Wang,Xiaoxuan Guo,Jingmei Qian,Wei Wang,Pengfan Zhang,Tao Jin,Chengcai Chu,Yang Bai. Science China(Life Sciences). 2018(06)
[7]丹參多酚酸鹽對(duì)陽(yáng)離子化牛血清白蛋白致膜性腎病大鼠的影響[J]. 陳素枝,陳文軍,張卓,宋瑞婧,檀金川. 中草藥. 2018(08)
[8]霍山石斛內(nèi)生真菌的分離及其及活性菌株的鑒定[J]. 閔長(zhǎng)莉,閔運(yùn)江,徐慧欣,汪學(xué)軍. 天然產(chǎn)物研究與開發(fā). 2018(06)
[9]不同生長(zhǎng)年限霍山石斛高效液相指紋圖譜研究[J]. 劉剛,俞年軍,韓榮春,謝冬梅,劉路路,彭代銀,何祥林,張淇軍. 中草藥. 2018(06)
[10]道地藥材品質(zhì)形成機(jī)制的組學(xué)研究思路[J]. 王程成,趙慧,嚴(yán)穎,石婧婧,陳舒妤,談夢(mèng)霞,陳佳麗,劉子修,陳翠花,鄒立思,劉訓(xùn)紅. 中國(guó)中藥雜志. 2018(11)
博士論文
[1]石斛屬藥用植物內(nèi)生真菌多樣性研究[D]. 胡克興.中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué) 2008
[2]石斛屬植物菌根生物學(xué)研究[D]. 侯曉強(qiáng).中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué) 2007
碩士論文
[1]寧夏枸杞根際微生物群落多樣性及叢枝菌根真菌對(duì)其耐鹽性的影響[D]. 肖龍敏.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]石斛種子內(nèi)生真菌及對(duì)石斛苗生長(zhǎng)和耐高溫的影響[D]. 盧敏.西南大學(xué) 2018
[3]大別山產(chǎn)四種石斛的分子生物學(xué)鑒定[D]. 劉楓.安徽中醫(yī)藥大學(xué) 2017
[4]不同栽培環(huán)境下霍山石斛內(nèi)生真菌生物多樣性的研究[D]. 郁陽(yáng).安徽中醫(yī)藥大學(xué) 2017
[5]鐵皮石斛內(nèi)生菌根真菌的篩選及其作用機(jī)理研究[D]. 楊鶴同.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[6]蘭花內(nèi)生菌對(duì)鐵皮石斛抗逆性的研究[D]. 張霞.南京林業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3572802
【文章來源】:安徽中醫(yī)藥大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【圖文】:
霍山石斛內(nèi)生真菌群落的α多樣性估計(jì)
Cladosporium、Aspergillus 、Lophiostoma、Articulospora、Diaporthe 在五種生長(zhǎng)方式的霍山石斛內(nèi)生菌中沒有明顯差異(P > 0.05),但是Alternaria在五種生長(zhǎng)方式的霍山石斛內(nèi)生菌中存在極顯著差異(P < 0.01)(圖1-3c)。圖 1-3 菌群分布組成柱狀圖a) 在門水平,b) 在屬水平,c) 高分類群的分類群定義內(nèi)生真菌群落的構(gòu)建塊五組霍山石斛內(nèi)生菌群相對(duì)豐度的統(tǒng)計(jì)比較,F(xiàn)usarium P = 0.243、Cladosporium P = 0.906、Aspergillus P = 0.619、Lophiostoma P = 0.215、Alternaria P = 0.003、Articulospora P = 0.366、Diaporthe P = 0.278.Fig. 1-3 Frequence in microbial communities from samplesa) community distribution of phylum,b) community distribution of genus,c) Taxa at high
abundance of endophytic microbiota among the five groups D. huoshanenseladosporium P = 0.906、Aspergillus P = 0.619、Lophiostoma P = 0.215、A0.003、Articulospora P = 0.366、Diaporthe P = 0.278.多樣性比較究五組霍山石斛內(nèi)生真菌菌群的相似性和差異性,選擇主法將所研究的數(shù)據(jù)可視化,即通過一系列的特征值和特征向量主要排在前幾位的特征值;分為加權(quán)主坐標(biāo)分析(Weighted UniF主坐標(biāo)分析(Unweighted UniFrac PCoA)。通過 PCoA 可以觀差異,在 PCoA 圖(圖 1-4)中,每個(gè)符號(hào)代表一個(gè)樣本,類似中樹栽、設(shè)施栽培與林下栽培、野生霍山石斛在第一坐標(biāo)軸上分差的 18.0%;在第二坐標(biāo)軸上,野生霍山石斛與林下栽培霍山石方式的霍山石斛分開,PCo2 解釋總變差的 11.0%。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同樹齡銀杏葉內(nèi)生真菌的多樣性及群落結(jié)構(gòu)分析[J]. 楊琴,鄒凱,陳愛佳,郭雪,劉學(xué)端,梁伊麗. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(01)
[2]不同產(chǎn)地甘草內(nèi)生真菌多樣性及分離條件研究[J]. 陳靜,許貞,張雪,李妍芃,劉春生. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2019(02)
[3]刺五加內(nèi)生真菌分離鑒定及抗菌活性研究[J]. 劉悅,張爽,李佳賓,沈宏偉,崔紅花,王振月. 天然產(chǎn)物研究與開發(fā). 2019(01)
[4]霍山石斛多糖對(duì)小鼠的雙向免疫調(diào)節(jié)作用[J]. 徐海軍,方予,汪俊濤,王成苗,馮瑤瑤,梁麗萍. 免疫學(xué)雜志. 2018(08)
[5]霍山石斛對(duì)小鼠肝臟細(xì)胞色素P450酶表達(dá)和活性的影響[J]. 王長(zhǎng)鎖,王凱,孟欣,歐陽(yáng)臻,戴軍,陳乃富,韓邦興,魏淵. 中國(guó)中藥雜志. 2018(21)
[6]Root microbiota shift in rice correlates with resident time in the field and developmental stage[J]. Jingying Zhang,Na Zhang,Yong-Xin Liu,Xiaoning Zhang,Bin Hu,Yuan Qin,Haoran Xu,Hui Wang,Xiaoxuan Guo,Jingmei Qian,Wei Wang,Pengfan Zhang,Tao Jin,Chengcai Chu,Yang Bai. Science China(Life Sciences). 2018(06)
[7]丹參多酚酸鹽對(duì)陽(yáng)離子化牛血清白蛋白致膜性腎病大鼠的影響[J]. 陳素枝,陳文軍,張卓,宋瑞婧,檀金川. 中草藥. 2018(08)
[8]霍山石斛內(nèi)生真菌的分離及其及活性菌株的鑒定[J]. 閔長(zhǎng)莉,閔運(yùn)江,徐慧欣,汪學(xué)軍. 天然產(chǎn)物研究與開發(fā). 2018(06)
[9]不同生長(zhǎng)年限霍山石斛高效液相指紋圖譜研究[J]. 劉剛,俞年軍,韓榮春,謝冬梅,劉路路,彭代銀,何祥林,張淇軍. 中草藥. 2018(06)
[10]道地藥材品質(zhì)形成機(jī)制的組學(xué)研究思路[J]. 王程成,趙慧,嚴(yán)穎,石婧婧,陳舒妤,談夢(mèng)霞,陳佳麗,劉子修,陳翠花,鄒立思,劉訓(xùn)紅. 中國(guó)中藥雜志. 2018(11)
博士論文
[1]石斛屬藥用植物內(nèi)生真菌多樣性研究[D]. 胡克興.中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué) 2008
[2]石斛屬植物菌根生物學(xué)研究[D]. 侯曉強(qiáng).中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué) 2007
碩士論文
[1]寧夏枸杞根際微生物群落多樣性及叢枝菌根真菌對(duì)其耐鹽性的影響[D]. 肖龍敏.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]石斛種子內(nèi)生真菌及對(duì)石斛苗生長(zhǎng)和耐高溫的影響[D]. 盧敏.西南大學(xué) 2018
[3]大別山產(chǎn)四種石斛的分子生物學(xué)鑒定[D]. 劉楓.安徽中醫(yī)藥大學(xué) 2017
[4]不同栽培環(huán)境下霍山石斛內(nèi)生真菌生物多樣性的研究[D]. 郁陽(yáng).安徽中醫(yī)藥大學(xué) 2017
[5]鐵皮石斛內(nèi)生菌根真菌的篩選及其作用機(jī)理研究[D]. 楊鶴同.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[6]蘭花內(nèi)生菌對(duì)鐵皮石斛抗逆性的研究[D]. 張霞.南京林業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3572802
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