中華鱉il21和il22 cDNA的克隆及急性冷脅迫對部分細胞因子表達的影響
發(fā)布時間:2022-01-02 02:56
為了研究急性冷脅迫對中華鱉部分細胞因子表達的影響,本論文首先采用cDNA末端快速擴增技術克隆了中華鱉il21和il22的cDNA并進行了生物信息學分析,其次對il21和il22進行了組織表達模式分析,并從體外以LPS、ConA和poly I:C等免疫刺激劑刺激中華鱉脾臟原代細胞后,檢測了il21和il22的表達情況,最后研究了中華鱉在急性冷脅迫以及嗜水氣單胞菌脅迫的條件下,脾臟和腸道中的il1β、tnfα、il8、il21、il22和il23a等細胞因子在mRNA水平的應答情況。實驗結果如下:1.中華鱉il21和il22 cDNA克隆及生物信息學分析克隆得到的中華鱉il21基因cDNA長為874 bp,ORF長為408 bp,編碼135個氨基酸。二級結構主要包括α螺旋、延伸鏈、無規(guī)則卷曲和β轉角,三級結構包括信號肽和IL15結構域(IL15家族成員)。系統(tǒng)進化分析表明其與鳥類首先聚類,其次為哺乳類。中華鱉il22 cDNA長度為2263 bp,ORF長度為624 bp,編碼207個氨基酸,二級結構也主要包括α螺旋、延伸鏈、無規(guī)則卷曲和β轉角,三級結構包括信號肽、跨膜結構域和IL22結構...
【文章來源】:山西大學山西省
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
中華鱉il21ORF的PCR擴增驗證100
中華鱉 il21 和 il22 cDNA 的克隆及急性冷脅迫對部分細胞因子表達的影響線示起始密碼子或終止密碼子,實線框示信號肽,刪除線示核心結構域 IL15,雙下不穩(wěn)定信號Fig 2.2 Protein and cDNA sequences of Chinese soft-shelled turtle il21 underlined line indicates the starting codon or stopping codon. The solid frame shows the ide. The deleted line shows the core domain IL15. The double underlined line shows the unsignal
圖 2.3 幾種脊椎動物 il21 基因的共線性關系圖Fig 2.3 Schematic diagram of the il21 homologs in several selected vertebrate speciesGenBank Accession Number: Homo sapiens, NM_021803; Mus musculus, AY428162; Gallus galluNM_001024835; Danio rerio, NM_001128574; Xenopus tropicalis, NM_0011270592.1.2 中華鱉 il21 基因結構分析與共線性關系分析通過搜索 Ensembl 數(shù)據(jù)庫中中華鱉等脊椎動物的基因組序列及注釋,并結合隆得到的中華鱉 il21 基因的 cDNA 序列,我們獲得了中華鱉和其他部分脊椎物種 il基因的結構圖(圖 2.4)。中華鱉 il21 cDNA 對應的基因組序列全長為 5917 bp,含 5 個外顯子、4 個內(nèi)含子,與其他物種一樣(斑馬魚除外,有 6 個外顯子,5 個含子)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中華鱉fut2基因的克隆及其組織表達模式分析[J]. 邢瀟,宋如昕. 山西農(nóng)業(yè)科學. 2018(06)
[2]Interleukin-22 contributes to liver regeneration in mice with concanavalin A-induced hepatitis after hepatectomy[J]. Ya-Min Zhang,Zi-Rong Liu,Zi-Lin Cui,Chao Yang,Long Yang,Yang Li,Zhong-Yang Shen. World Journal of Gastroenterology. 2016(06)
[3]趨化因子及受體在結直腸癌中的研究進展[J]. 王粹,胡冬至,柳建中. 中國腫瘤臨床. 2013(12)
[4]為什么近年有些教材將鳥類歸入“爬行綱”[J]. 鄭光美. 生物學通報. 2010(11)
[5]Interleukin-21 triggers effector cell responses in the gut[J]. Daniela De Nitto,Massimiliano Sarra,Francesco Pallone,Giovanni Monteleone. World Journal of Gastroenterology. 2010(29)
[6]中華鱉種質資源的研究現(xiàn)狀及保護、利用對策[J]. 黃麗英,何中央,丁詩華,張海琪. 寧波大學學報(理工版). 2005(02)
[7]中華鱉粘液性腸炎病與出血性腸炎病的流行病學[J]. 向靜,江為民,蔡建軍,趙志堅. 內(nèi)陸水產(chǎn). 2003(10)
[8]聚肌胞(polyI:C)抗腫瘤作用和免疫調(diào)節(jié)作用[J]. 張秀國,吳德政. 癌癥. 1991(03)
碩士論文
[1]中華鱉il6的cDNA克隆及其在急性低溫脅迫和細菌免疫應答中的表達變化情況[D]. 宋如昕.山西大學 2017
本文編號:3563328
【文章來源】:山西大學山西省
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
中華鱉il21ORF的PCR擴增驗證100
中華鱉 il21 和 il22 cDNA 的克隆及急性冷脅迫對部分細胞因子表達的影響線示起始密碼子或終止密碼子,實線框示信號肽,刪除線示核心結構域 IL15,雙下不穩(wěn)定信號Fig 2.2 Protein and cDNA sequences of Chinese soft-shelled turtle il21 underlined line indicates the starting codon or stopping codon. The solid frame shows the ide. The deleted line shows the core domain IL15. The double underlined line shows the unsignal
圖 2.3 幾種脊椎動物 il21 基因的共線性關系圖Fig 2.3 Schematic diagram of the il21 homologs in several selected vertebrate speciesGenBank Accession Number: Homo sapiens, NM_021803; Mus musculus, AY428162; Gallus galluNM_001024835; Danio rerio, NM_001128574; Xenopus tropicalis, NM_0011270592.1.2 中華鱉 il21 基因結構分析與共線性關系分析通過搜索 Ensembl 數(shù)據(jù)庫中中華鱉等脊椎動物的基因組序列及注釋,并結合隆得到的中華鱉 il21 基因的 cDNA 序列,我們獲得了中華鱉和其他部分脊椎物種 il基因的結構圖(圖 2.4)。中華鱉 il21 cDNA 對應的基因組序列全長為 5917 bp,含 5 個外顯子、4 個內(nèi)含子,與其他物種一樣(斑馬魚除外,有 6 個外顯子,5 個含子)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中華鱉fut2基因的克隆及其組織表達模式分析[J]. 邢瀟,宋如昕. 山西農(nóng)業(yè)科學. 2018(06)
[2]Interleukin-22 contributes to liver regeneration in mice with concanavalin A-induced hepatitis after hepatectomy[J]. Ya-Min Zhang,Zi-Rong Liu,Zi-Lin Cui,Chao Yang,Long Yang,Yang Li,Zhong-Yang Shen. World Journal of Gastroenterology. 2016(06)
[3]趨化因子及受體在結直腸癌中的研究進展[J]. 王粹,胡冬至,柳建中. 中國腫瘤臨床. 2013(12)
[4]為什么近年有些教材將鳥類歸入“爬行綱”[J]. 鄭光美. 生物學通報. 2010(11)
[5]Interleukin-21 triggers effector cell responses in the gut[J]. Daniela De Nitto,Massimiliano Sarra,Francesco Pallone,Giovanni Monteleone. World Journal of Gastroenterology. 2010(29)
[6]中華鱉種質資源的研究現(xiàn)狀及保護、利用對策[J]. 黃麗英,何中央,丁詩華,張海琪. 寧波大學學報(理工版). 2005(02)
[7]中華鱉粘液性腸炎病與出血性腸炎病的流行病學[J]. 向靜,江為民,蔡建軍,趙志堅. 內(nèi)陸水產(chǎn). 2003(10)
[8]聚肌胞(polyI:C)抗腫瘤作用和免疫調(diào)節(jié)作用[J]. 張秀國,吳德政. 癌癥. 1991(03)
碩士論文
[1]中華鱉il6的cDNA克隆及其在急性低溫脅迫和細菌免疫應答中的表達變化情況[D]. 宋如昕.山西大學 2017
本文編號:3563328
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