砂蘚抗高溫相關(guān)基因RcDAPDC的克隆及表達分析
發(fā)布時間:2021-12-18 01:15
二氨基庚二酸脫羧酶(diaminnopimelate decarboxylase, DAPDC)是合成賴氨酸的關(guān)鍵酶,在生物體的生命活動及非生物脅迫應(yīng)答過程中發(fā)揮重要作用。本研究在砂蘚(Racomitrium canescens)高溫脅迫蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)一個表達量上調(diào)的DAPDC蛋白質(zhì),將其命名為RcDAPDC,并對編碼此的基因全長CDS序列進行了克隆,還對此基因進行了基本的生物信息學分析,同時對砂蘚在60℃高溫脅迫、脫水和復水條件下的表達變化進行了分析。RcDAPDC基因CDS全長1 521 bp,編碼蛋白質(zhì)的氨基酸數(shù)為506,相對分子質(zhì)量為55.9 kD,理論等電點為5.83,不穩(wěn)定指數(shù)為36.91,是一個穩(wěn)定蛋白,親水性的平均值(GRAVY)為-0.169,預測該蛋白質(zhì)為親水性蛋白,不具有跨膜結(jié)構(gòu)域。實時熒光定量PCR結(jié)果顯示,RcDAPDC基因在60℃高溫處理1 h時表達量最高;RcDAPDC基因在干旱和復水過程中呈現(xiàn)差異性表達,推測RcDAPDC不僅可能參與砂蘚的抗高溫脅迫反應(yīng),而且還可能參與砂蘚的干旱脅迫響應(yīng)和復水過程。本研究對進一步研究砂蘚RcDAPDC基因的生物學功能...
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(24)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
RcDAPDC的親疏水性預測
RcDAPDC的三級結(jié)構(gòu)預測
RcDAPDC的系統(tǒng)進化分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]砂蘚抗旱相關(guān)基因RcSOD的克隆及表達分析[J]. 沙偉,蔣卓君,張梅娟,馬天意. 基因組學與應(yīng)用生物學. 2019(05)
[2]砂蘚抗旱相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子基因RcbZIP1的克隆與表達分析[J]. 信雨萌,沙偉,張梅娟,孟靈軍,馬天意. 基因組學與應(yīng)用生物學. 2018(07)
[3]高溫脅迫對毛尖紫萼蘚生理生化特性的影響[J]. 王曼,沙偉,張梅娟,朱巍巍,信雨萌. 基因組學與應(yīng)用生物學. 2015(06)
[4]砂蘚MYB轉(zhuǎn)錄因子基因RcMYB的克隆及表達分析[J]. 沙偉,索荔,張梅娟,張春蕾,周伯. 基因組學與應(yīng)用生物學. 2015(04)
[5]干旱脅迫對三種蘚類植物生理特性的影響[J]. 國春暉,沙偉,李孝凱. 北方園藝. 2014(09)
[6]多蒴灰蘚(苔蘚植物門:蘚綱)對短期極端溫度的生理響應(yīng)(英文)[J]. 沈蕾,郭水良,楊武,曹同,Janice M.Glime. 植物研究. 2011(01)
[7]高溫和干旱脅迫對鱗葉蘚游離脯氨酸和可溶性糖含量的影響[J]. 張顯強,羅在柒,唐金剛,盧文蕓,乙引. 廣西植物. 2004(06)
[8]賴氨酸工業(yè)生產(chǎn)菌的研究進展[J]. 龍萬凱. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2003(09)
[9]兩種匍燈蘚屬植物夏季和冬季光合特性的比較研究[J]. 劉應(yīng)迪,陳軍,張麗娟,曹同. 應(yīng)用生態(tài)學報. 2001(01)
碩士論文
[1]蘚類植物適應(yīng)環(huán)境的形態(tài)結(jié)構(gòu)及生理學機制[D]. 楊武.浙江師范大學 2008
[2]鹽單胞菌分離、鑒定及其二氨基庚二酸脫羧酶基因克隆與表達[D]. 周韜.廈門大學 2007
[3]高溫脅迫對蘋果生理效應(yīng)及耐熱性誘導的研究[D]. 龐勇.西北農(nóng)林科技大學 2004
本文編號:3541330
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(24)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
RcDAPDC的親疏水性預測
RcDAPDC的三級結(jié)構(gòu)預測
RcDAPDC的系統(tǒng)進化分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]砂蘚抗旱相關(guān)基因RcSOD的克隆及表達分析[J]. 沙偉,蔣卓君,張梅娟,馬天意. 基因組學與應(yīng)用生物學. 2019(05)
[2]砂蘚抗旱相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子基因RcbZIP1的克隆與表達分析[J]. 信雨萌,沙偉,張梅娟,孟靈軍,馬天意. 基因組學與應(yīng)用生物學. 2018(07)
[3]高溫脅迫對毛尖紫萼蘚生理生化特性的影響[J]. 王曼,沙偉,張梅娟,朱巍巍,信雨萌. 基因組學與應(yīng)用生物學. 2015(06)
[4]砂蘚MYB轉(zhuǎn)錄因子基因RcMYB的克隆及表達分析[J]. 沙偉,索荔,張梅娟,張春蕾,周伯. 基因組學與應(yīng)用生物學. 2015(04)
[5]干旱脅迫對三種蘚類植物生理特性的影響[J]. 國春暉,沙偉,李孝凱. 北方園藝. 2014(09)
[6]多蒴灰蘚(苔蘚植物門:蘚綱)對短期極端溫度的生理響應(yīng)(英文)[J]. 沈蕾,郭水良,楊武,曹同,Janice M.Glime. 植物研究. 2011(01)
[7]高溫和干旱脅迫對鱗葉蘚游離脯氨酸和可溶性糖含量的影響[J]. 張顯強,羅在柒,唐金剛,盧文蕓,乙引. 廣西植物. 2004(06)
[8]賴氨酸工業(yè)生產(chǎn)菌的研究進展[J]. 龍萬凱. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2003(09)
[9]兩種匍燈蘚屬植物夏季和冬季光合特性的比較研究[J]. 劉應(yīng)迪,陳軍,張麗娟,曹同. 應(yīng)用生態(tài)學報. 2001(01)
碩士論文
[1]蘚類植物適應(yīng)環(huán)境的形態(tài)結(jié)構(gòu)及生理學機制[D]. 楊武.浙江師范大學 2008
[2]鹽單胞菌分離、鑒定及其二氨基庚二酸脫羧酶基因克隆與表達[D]. 周韜.廈門大學 2007
[3]高溫脅迫對蘋果生理效應(yīng)及耐熱性誘導的研究[D]. 龐勇.西北農(nóng)林科技大學 2004
本文編號:3541330
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