細胞核是真核細胞內(nèi)最重要的細胞器,它是基因復(fù)制、RNA轉(zhuǎn)錄的中心,是細胞活動的控制中心。蛋白質(zhì)的功能與蛋白質(zhì)在細胞內(nèi)的位置密切相關(guān),因此,如何從大量蛋白質(zhì)中精確地識別出核定位蛋白非常重要。本文構(gòu)建了核定位蛋白和非核定位蛋白數(shù)據(jù)集,選取氨基酸序列N端單肽組分信息、蛋白質(zhì)骨架二肽組分信息、氨基酸指數(shù)信息、蛋白質(zhì)相互作用信息及基因本體注釋信息為特征信息,并對特征信息進行融合,利用支持向量機算法對構(gòu)建的數(shù)據(jù)集進行預(yù)測,在5-折交叉檢驗下總預(yù)測成功率達到89.11%。 

【文章來源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,41(01)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)集
    1.2 特征提取
        1.2.1蛋白質(zhì)相互作用信息
        1.2.2 氨基酸序列N端組分信息
        1.2.3 蛋白質(zhì)骨架信息
        1.2.4 氨基酸指數(shù)信息
        1.2.5 基因本體注釋信息
    1.3 支持向量機算法
    1.4 算法評價
2 結(jié)果與討論
    2.1 特征向量參數(shù)選取
    2.2 預(yù)測結(jié)果
        2.2.1 單特征預(yù)測結(jié)果
        2.2.2 融合特征預(yù)測結(jié)果
4 結(jié)論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于直接和間接PPI信息預(yù)測人類核蛋白亞核定位[J]. 王雷,王顏超,辛潤,徐嘉良,李前忠.  內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2014(05)
[2]一種基于GO分子功能信息的序列編碼輔助預(yù)測亞細胞定位方法[J]. 沈金城,張松,孫之榮.  科學(xué)通報. 2007(13)
[3]信號肽假說的提出及證實——1999年諾貝爾生理學(xué)醫(yī)學(xué)獎獲得者Günter Blobel簡介[J]. 葉方寅.  國外醫(yī)學(xué)(分子生物學(xué)分冊). 1999(06)



本文編號：3533646