雨生紅球藻HaeDGAT2-3的分子克隆和生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2021-11-27 13:16
雨生紅球藻被認(rèn)為是天然蝦青素的理想來源,蝦青素主要儲存于富含蝦青素酯和三酰甘油(TAGs)的油體中,而二酰甘油;D(zhuǎn)移酶(DGAT)作為三酰甘油及蝦青素酯生物合成的限速酶,在雨生紅球藻中尚未見報道。試驗通過同源克隆與RACE擴增技術(shù)相結(jié)合的方法獲得了2型二酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶(DGAT2-3)的c DNA序列全長,其中,HaeDGAT2-3序列編碼區(qū)全長為1 149 bp,共編碼383個氨基酸;BLASTp分析結(jié)果顯示,Hae DGAT2-3與衣藻來源的DGAT2相似性達(dá)到54.02%;保守功能域分析表明,Hae DGAT2-3蛋白包含DGAT2家族典型的LPLAT超基因家族;多序列比對及系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果表明,Hae DGAT2-3蛋白中包括7個保守的功能基序,說明其可能屬于DGAT2家族。研究首次從雨生紅球藻中克隆得到編碼DGAT2的基因序列,生物信息學(xué)分析結(jié)果對進(jìn)一步了解雨生紅球藻蝦青素酯化機制具有重要意義。
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(05)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 試驗材料
1.1.1 試驗藻種及培養(yǎng)條件
1.1.2 試驗設(shè)備
1.2 試驗方法
1.2.1 總RNA的提取及c DNA的獲得
1.2.2 同源克隆及RACE擴增
1.3 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 總RNA的提取和基因克隆結(jié)果分析
2.2 雨生紅球藻HaeDGAT2-3蛋白cDNA序列分析
2.3 雨生紅球藻HaeDGAT2-3蛋白理化性質(zhì)分析
2.4 雨生紅球藻HaeDGAT2-3蛋白的高級結(jié)構(gòu)分析
2.5 雨生紅球藻HaeDGAT2-3多序列比對分析
2.6 雨生紅球藻HaeDGAT2-3的系統(tǒng)進(jìn)化分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]雨生紅球藻UVR8的基因克隆和生物信息學(xué)分析[J]. 張宏江,杭偉,馬浩天,王曉丹,李潤植,崔紅利. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2019(09)
[2]續(xù)隨子二酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶2基因(ElDGAT2)克隆與功能分析[J]. 任國鵬,葛麗萍,孫超超,劉寶玲,李潤植. 植物生理學(xué)報. 2019(08)
[3]不同培養(yǎng)模式對雨生紅球藻細(xì)胞綠色生長以及蝦青素積累的影響研究[J]. 李林品,張勇,吳秋瑾,王興勇. 科技風(fēng). 2019(25)
[4]紫蘇PfDGAT1酵母功能互補分析[J]. 王計平,周雅莉,任文燕,安茜,段露露,郝月茹,李潤植. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2019(05)
[5]紫蘇二酰甘油;D(zhuǎn)移酶基因(PfDGAT1)鑒定及表達(dá)分析[J]. 周雅莉,任文燕,郝月茹,安茜,段露露,李潤植,王計平. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(05)
[6]籽粒莧優(yōu)質(zhì)貯藏蛋白AhAMA1基因功能分析[J]. 趙熙寧,張飛,岳敏,安茜,宋亞楠,季春麗,崔紅利,李潤植. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(05)
[7]微藻生物技術(shù) 助力功能農(nóng)業(yè)[J]. 李潤植,季春麗,崔紅利. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(03)
[8]雨生紅球藻PHOT的基因克隆和生物信息學(xué)分析[J]. 崔紅利,陳軍,王林萍,胡章立,秦松. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(12)
[9]微藻多糖生物活性研究進(jìn)展[J]. 陳瑋,劉啟順,李曙光,趙小明,彭強,高振,胡建恩,杜昱光. 中國海洋藥物. 2012(03)
[10]二;视王;D(zhuǎn)移酶(DGAT)研究進(jìn)展[J]. 唐桂英,柳展基,單雷. 中國油料作物學(xué)報. 2010(02)
本文編號:3522366
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(05)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 試驗材料
1.1.1 試驗藻種及培養(yǎng)條件
1.1.2 試驗設(shè)備
1.2 試驗方法
1.2.1 總RNA的提取及c DNA的獲得
1.2.2 同源克隆及RACE擴增
1.3 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 總RNA的提取和基因克隆結(jié)果分析
2.2 雨生紅球藻HaeDGAT2-3蛋白cDNA序列分析
2.3 雨生紅球藻HaeDGAT2-3蛋白理化性質(zhì)分析
2.4 雨生紅球藻HaeDGAT2-3蛋白的高級結(jié)構(gòu)分析
2.5 雨生紅球藻HaeDGAT2-3多序列比對分析
2.6 雨生紅球藻HaeDGAT2-3的系統(tǒng)進(jìn)化分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]雨生紅球藻UVR8的基因克隆和生物信息學(xué)分析[J]. 張宏江,杭偉,馬浩天,王曉丹,李潤植,崔紅利. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2019(09)
[2]續(xù)隨子二酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶2基因(ElDGAT2)克隆與功能分析[J]. 任國鵬,葛麗萍,孫超超,劉寶玲,李潤植. 植物生理學(xué)報. 2019(08)
[3]不同培養(yǎng)模式對雨生紅球藻細(xì)胞綠色生長以及蝦青素積累的影響研究[J]. 李林品,張勇,吳秋瑾,王興勇. 科技風(fēng). 2019(25)
[4]紫蘇PfDGAT1酵母功能互補分析[J]. 王計平,周雅莉,任文燕,安茜,段露露,郝月茹,李潤植. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2019(05)
[5]紫蘇二酰甘油;D(zhuǎn)移酶基因(PfDGAT1)鑒定及表達(dá)分析[J]. 周雅莉,任文燕,郝月茹,安茜,段露露,李潤植,王計平. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(05)
[6]籽粒莧優(yōu)質(zhì)貯藏蛋白AhAMA1基因功能分析[J]. 趙熙寧,張飛,岳敏,安茜,宋亞楠,季春麗,崔紅利,李潤植. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(05)
[7]微藻生物技術(shù) 助力功能農(nóng)業(yè)[J]. 李潤植,季春麗,崔紅利. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(03)
[8]雨生紅球藻PHOT的基因克隆和生物信息學(xué)分析[J]. 崔紅利,陳軍,王林萍,胡章立,秦松. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(12)
[9]微藻多糖生物活性研究進(jìn)展[J]. 陳瑋,劉啟順,李曙光,趙小明,彭強,高振,胡建恩,杜昱光. 中國海洋藥物. 2012(03)
[10]二;视王;D(zhuǎn)移酶(DGAT)研究進(jìn)展[J]. 唐桂英,柳展基,單雷. 中國油料作物學(xué)報. 2010(02)
本文編號:3522366
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