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豆科植物dxr基因密碼子偏好性分析

發(fā)布時間:2021-11-21 21:39
  1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原異構(gòu)酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase,DXR)是MEP途徑的關(guān)鍵酶之一,參與植物萜類與蒽醌等化合物的生物合成。萜類與蒽醌類化合物在較多豆科植物中存在,研究豆科植物dxr基因的密碼子偏好性,對以dxr基因?yàn)榘悬c(diǎn)的分子調(diào)控具有重要指導(dǎo)意義。運(yùn)用Codon W、CHIPS、CUSP和CAI等程序分析豆科植物drx基因密碼子的偏好性,并用豆科植物決明的dxr基因?qū)Ψ治鼋Y(jié)果的可靠性進(jìn)行驗(yàn)證。研究成果顯示,以A或U結(jié)尾的密碼子在dxr基因的密碼子中表現(xiàn)出較強(qiáng)的偏好性。相比于煙草,擬南芥更適合作為研究dxr基因功能的模式植物。比較豆科植物dxr基因與大腸桿菌及酵母基因組密碼子偏好性,發(fā)現(xiàn)酵母的差異明顯低于大腸桿菌,表明對于豆科植物dxr基因來說,酵母表達(dá)系統(tǒng)比大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)更好。但是要使豆科植物dxr基因在酵母表達(dá)系統(tǒng)中具有高表達(dá)效率,仍需對其密碼子進(jìn)行優(yōu)化。 

【文章來源】:生物學(xué)雜志. 2020,37(01)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

豆科植物dxr基因密碼子偏好性分析


13種植物dxr基因的聚類樹狀圖

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3510294

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