瀕危植物水青樹雷公山居群的小尺度空間遺傳結(jié)構(gòu)研究
發(fā)布時間:2021-11-13 09:35
植物空間遺傳結(jié)構(gòu)(SGS)是探討植物之間以及植物與環(huán)境之間相互作用規(guī)律的研究,對于評估瀕危植物種群發(fā)展的潛力和進化方向具有重要的意義。小尺度范圍SGS的形成最主要的影響因素是受限的基因流。本文以雷公山國家級自然保護區(qū)內(nèi)水青樹(Tetracentron sinense Oliv.)天然居群為研究對象,利用15對微衛(wèi)星(SSR)引物對其進行小尺度SGS和基因流分析,評估雷公山水青樹居群的進化發(fā)展?jié)摿?探討水青樹的致瀕機制,為居群進化方向的推斷和保護策略的制定提供理論依據(jù)和數(shù)據(jù)支持。主要研究結(jié)果如下:(1)遺傳多樣性研究15對SSR引物擴增結(jié)果顯示:雷公山水青樹居群在物種水平和斑塊水平上的等位基因數(shù)目(A)、有效等位基因數(shù)目(AE)、觀測雜合度(HO)和期望雜合度(HE)(斑塊水平為uHE)分別為4.067、2.769、0.483、0.598和3.667、2.498、0.487、0.564。結(jié)果表明,小尺度水青樹居群的遺傳多樣性在瀕危植物中居于中等水平。水青樹四個斑塊的遺傳多樣性水平有差異,產(chǎn)生了顯著的遺...
【文章來源】:西華師范大學四川省
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
居群和個體坐標圖
第三章結(jié)果與分析14第三章結(jié)果與分析3.1nSSR引物分析用15對引物對雷公山水青樹天然居群155個個體進行擴增,圖3-1是SSR97引物對部分個體擴增的效果圖。等位基因數(shù)(A)是反應遺傳變異大小的指標。由表3-1可看出,本研究共檢測到61個等位基因,每對引物等位基因數(shù)在2(SSR6、SSR62)~8(SSR97)之間,平均4.067;有效等位基因數(shù)(AE)在1.411(SSR69)~5.094(SSR97)之間,平均2.769。雜合度是指雜合子在被檢測的群體位點中的占比,本研究總體觀測雜合度(HO)為0.483,范圍在0.200(SSR69)~0.743(SSR69)之間。在微衛(wèi)星SSR標記中,期望雜合度(HE)是衡量遺傳多樣性主要的指標[89],雷公山水青樹物種水平總體期望雜合度0.598,范圍在0.296(SSR69)~0.815(SSR97)之間,觀測雜合度均小于期望雜合度,表明雷公山水青樹居群存在近親繁殖的現(xiàn)象。PIC值在0.324(SSR69)~0.784(SSR97)之間,總體為0.542,說明水青樹具有較豐富的遺傳變異。15對引物在155個個體中未出現(xiàn)零位點,適合本實驗的數(shù)據(jù)分析。圖3-1引物SSR97擴增的部分條帶Fig.3-1ThepolyacrylamidegelelectrophoresisofsamplesamplifiedbySSR97
Table 3-3 AMOVA analysis of four patches 方差來源Source 自由度d.f. 變異百分比% Percentage of molecular variance 遺傳分化系數(shù) Fst 基因流Nm P 斑塊間 Among patches 3 7.91% <0.001* 斑塊內(nèi) Within patches 306 92.09% <0.001* 總和 Total 309 100% 0.079 2.91 <0.001* Among Patches Percentages of molecular variance
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于水青樹葉表型性狀的核心種質(zhì)資源庫構(gòu)建策略[J]. 張歡,王東,段帆,李珊,甘小洪. 林業(yè)科學研究. 2019(02)
[2]廣東省中山市五桂山土沉香空間遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 劉盼盼,廖浩斌,蔣謙才,譚宗健,孫紅梅,王瑞江,曹洪麟,黃向旭,賴思茹,梁丹,王崢峰. 熱帶亞熱帶植物學報. 2019(01)
[3]利用ISSR分子標記構(gòu)建瀕危植物水青樹核心種質(zhì)[J]. 段帆,張歡,李珊,田忠瓊,甘小洪. 亞熱帶植物科學. 2018(02)
[4]雷公山地貌的發(fā)育控制因素及對自然地理環(huán)境影響研究[J]. 楊廷鋒,吳顯春,蔣煥洲. 寧夏農(nóng)林科技. 2018(03)
[5]森林片斷化對植物種群空間遺傳結(jié)構(gòu)的影響[J]. 徐剛標,郭小丹. 中南林業(yè)科技大學學報. 2017(10)
[6]喀斯特耐陰灌木淡黃金花茶的精細空間遺傳結(jié)構(gòu)與基因流[J]. 彭國清,唐紹清. 生態(tài)學報. 2017(21)
[7]植物種群小尺度空間遺傳結(jié)構(gòu)研究進展[J]. 王丹碧,赫佳,張云燕,施恩,耿其芳,王中生. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(10)
[8]瀕危植物水青樹葉的表型性狀變異[J]. 李珊,甘小洪,憨宏艷,許寧,侯正揚,陳楊,鄧曉娟. 林業(yè)科學研究. 2016(05)
[9]Fine-scale spatial genetic structure in predominantly selfing plants with limited seed dispersal:a rule or exception?[J]. Sergei Volis,Danara Ormanbekova,Irina Shulgina. Plant Diversity. 2016(02)
[10]光照及地面覆蓋物對水青樹種子萌發(fā)和幼苗初期生長的影響[J]. 許寧,憨宏艷,甘小洪. 植物資源與環(huán)境學報. 2015(03)
博士論文
[1]鵝掌楸群體空間遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 李博.南京林業(yè)大學 2013
碩士論文
[1]地果種群遺傳格局及其成因研究[D]. 付榮華.西華師范大學 2018
[2]瀕危植物水青樹的遺傳多樣性研究[D]. 李珊.西華師范大學 2017
[3]國產(chǎn)沉香屬植物遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 劉濤.南昌大學 2016
[4]特有瀕危植物瑯琊榆、醉翁榆種群動態(tài)及小尺度空間遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 赫佳.南京大學 2016
[5]淡黃金花茶精細空間遺傳結(jié)構(gòu)[D]. 彭國清.廣西師范大學 2016
[6]瀕危植物水青樹幼苗更新機制研究[D]. 許寧.西華師范大學 2016
[7]銀杏天目山“避難所”群體的小尺度遺傳結(jié)構(gòu)與基因流研究[D]. 謝春香.浙江大學 2014
[8]雷公山自然保護區(qū)的保護與苗族文化的傳承研究[D]. 張國洋.貴州師范大學 2008
[9]不同地方烏骨雞種群遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[D]. 李亮.四川農(nóng)業(yè)大學 2001
本文編號:3492785
【文章來源】:西華師范大學四川省
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
居群和個體坐標圖
第三章結(jié)果與分析14第三章結(jié)果與分析3.1nSSR引物分析用15對引物對雷公山水青樹天然居群155個個體進行擴增,圖3-1是SSR97引物對部分個體擴增的效果圖。等位基因數(shù)(A)是反應遺傳變異大小的指標。由表3-1可看出,本研究共檢測到61個等位基因,每對引物等位基因數(shù)在2(SSR6、SSR62)~8(SSR97)之間,平均4.067;有效等位基因數(shù)(AE)在1.411(SSR69)~5.094(SSR97)之間,平均2.769。雜合度是指雜合子在被檢測的群體位點中的占比,本研究總體觀測雜合度(HO)為0.483,范圍在0.200(SSR69)~0.743(SSR69)之間。在微衛(wèi)星SSR標記中,期望雜合度(HE)是衡量遺傳多樣性主要的指標[89],雷公山水青樹物種水平總體期望雜合度0.598,范圍在0.296(SSR69)~0.815(SSR97)之間,觀測雜合度均小于期望雜合度,表明雷公山水青樹居群存在近親繁殖的現(xiàn)象。PIC值在0.324(SSR69)~0.784(SSR97)之間,總體為0.542,說明水青樹具有較豐富的遺傳變異。15對引物在155個個體中未出現(xiàn)零位點,適合本實驗的數(shù)據(jù)分析。圖3-1引物SSR97擴增的部分條帶Fig.3-1ThepolyacrylamidegelelectrophoresisofsamplesamplifiedbySSR97
Table 3-3 AMOVA analysis of four patches 方差來源Source 自由度d.f. 變異百分比% Percentage of molecular variance 遺傳分化系數(shù) Fst 基因流Nm P 斑塊間 Among patches 3 7.91% <0.001* 斑塊內(nèi) Within patches 306 92.09% <0.001* 總和 Total 309 100% 0.079 2.91 <0.001* Among Patches Percentages of molecular variance
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于水青樹葉表型性狀的核心種質(zhì)資源庫構(gòu)建策略[J]. 張歡,王東,段帆,李珊,甘小洪. 林業(yè)科學研究. 2019(02)
[2]廣東省中山市五桂山土沉香空間遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 劉盼盼,廖浩斌,蔣謙才,譚宗健,孫紅梅,王瑞江,曹洪麟,黃向旭,賴思茹,梁丹,王崢峰. 熱帶亞熱帶植物學報. 2019(01)
[3]利用ISSR分子標記構(gòu)建瀕危植物水青樹核心種質(zhì)[J]. 段帆,張歡,李珊,田忠瓊,甘小洪. 亞熱帶植物科學. 2018(02)
[4]雷公山地貌的發(fā)育控制因素及對自然地理環(huán)境影響研究[J]. 楊廷鋒,吳顯春,蔣煥洲. 寧夏農(nóng)林科技. 2018(03)
[5]森林片斷化對植物種群空間遺傳結(jié)構(gòu)的影響[J]. 徐剛標,郭小丹. 中南林業(yè)科技大學學報. 2017(10)
[6]喀斯特耐陰灌木淡黃金花茶的精細空間遺傳結(jié)構(gòu)與基因流[J]. 彭國清,唐紹清. 生態(tài)學報. 2017(21)
[7]植物種群小尺度空間遺傳結(jié)構(gòu)研究進展[J]. 王丹碧,赫佳,張云燕,施恩,耿其芳,王中生. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(10)
[8]瀕危植物水青樹葉的表型性狀變異[J]. 李珊,甘小洪,憨宏艷,許寧,侯正揚,陳楊,鄧曉娟. 林業(yè)科學研究. 2016(05)
[9]Fine-scale spatial genetic structure in predominantly selfing plants with limited seed dispersal:a rule or exception?[J]. Sergei Volis,Danara Ormanbekova,Irina Shulgina. Plant Diversity. 2016(02)
[10]光照及地面覆蓋物對水青樹種子萌發(fā)和幼苗初期生長的影響[J]. 許寧,憨宏艷,甘小洪. 植物資源與環(huán)境學報. 2015(03)
博士論文
[1]鵝掌楸群體空間遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 李博.南京林業(yè)大學 2013
碩士論文
[1]地果種群遺傳格局及其成因研究[D]. 付榮華.西華師范大學 2018
[2]瀕危植物水青樹的遺傳多樣性研究[D]. 李珊.西華師范大學 2017
[3]國產(chǎn)沉香屬植物遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 劉濤.南昌大學 2016
[4]特有瀕危植物瑯琊榆、醉翁榆種群動態(tài)及小尺度空間遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 赫佳.南京大學 2016
[5]淡黃金花茶精細空間遺傳結(jié)構(gòu)[D]. 彭國清.廣西師范大學 2016
[6]瀕危植物水青樹幼苗更新機制研究[D]. 許寧.西華師范大學 2016
[7]銀杏天目山“避難所”群體的小尺度遺傳結(jié)構(gòu)與基因流研究[D]. 謝春香.浙江大學 2014
[8]雷公山自然保護區(qū)的保護與苗族文化的傳承研究[D]. 張國洋.貴州師范大學 2008
[9]不同地方烏骨雞種群遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[D]. 李亮.四川農(nóng)業(yè)大學 2001
本文編號:3492785
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