在人類基因組草圖完成之際,一批科學(xué)家迅速集結(jié)于國(guó)際人類蛋白質(zhì)組組織（HUPO）旗下,啟動(dòng)"人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃（HPP）"。近20年來,以鑒定和定量復(fù)雜體系中基因組編碼全套蛋白質(zhì)為核心的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)獲得了空前發(fā)展。在這篇文章中,我們將回顧HPP的發(fā)展歷程和我國(guó)在蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域的最新進(jìn)展,并簡(jiǎn)略討論"蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動(dòng)的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)"的發(fā)展趨勢(shì)和應(yīng)用前景。 

【文章來源】：中國(guó)基礎(chǔ)科學(xué). 2020,22(04)

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

HUPO的人類蛋白質(zhì)組項(xiàng)目的結(jié)構(gòu)示意圖

基于染色體的C-HPP是HPP的一個(gè)組成部分。它的科學(xué)使命是繪制和注釋由每個(gè)染色體編碼的預(yù)測(cè)人類蛋白質(zhì)組[7],它側(cè)重于以無偏的方式采集數(shù)據(jù),根據(jù)蛋白質(zhì)編碼基因在所有人類染色體中的位置進(jìn)行分類和國(guó)際分工(如人類染色體1-22,X和Y及線粒體基因組,見圖2)。這種方法的一個(gè)基本原理是基因定位可能影響表達(dá),并與蛋白質(zhì)組學(xué)、生物學(xué)和疾病的發(fā)生相關(guān)。C-HPP的一個(gè)重要目標(biāo)是正確定義每個(gè)染色體上開放閱讀框編碼的典型蛋白的數(shù)量。當(dāng)在高可信度蛋白質(zhì)證據(jù)(PE)下鑒定時(shí),這些蛋白質(zhì)被稱為PE1蛋白,那些蛋白在PE1水平上沒有被明確鑒定,但有其他證據(jù)的蛋白質(zhì)稱為PE2-4“缺失蛋白質(zhì)”(PE2,檢測(cè)到基因的轉(zhuǎn)錄本,但沒有足夠的翻譯證據(jù);PE3,來自相關(guān)物種的證據(jù)表明該基因編碼蛋白質(zhì);PE4,基因預(yù)測(cè)顯示該基因編碼蛋白質(zhì)可能性較大,但沒有其他證據(jù)歸類為PE1-3)[8]。在過去的10年中,對(duì)預(yù)測(cè)的人類蛋白質(zhì)組的翻譯進(jìn)行可靠的檢測(cè)已經(jīng)取得了巨大的進(jìn)展(見圖3)。到2020年,90%以上的PE1-4蛋白已經(jīng)被檢測(cè)到。然而,很明顯,近年來進(jìn)展緩慢,人們認(rèn)識(shí)到,目前“缺失”的 1,899 個(gè)PE2-4蛋白的檢測(cè)將越來越困難。

C-HPP的一個(gè)重要目標(biāo)是正確定義每個(gè)染色體上開放閱讀框編碼的典型蛋白的數(shù)量。當(dāng)在高可信度蛋白質(zhì)證據(jù)(PE)下鑒定時(shí),這些蛋白質(zhì)被稱為PE1蛋白,那些蛋白在PE1水平上沒有被明確鑒定,但有其他證據(jù)的蛋白質(zhì)稱為PE2-4“缺失蛋白質(zhì)”(PE2,檢測(cè)到基因的轉(zhuǎn)錄本,但沒有足夠的翻譯證據(jù);PE3,來自相關(guān)物種的證據(jù)表明該基因編碼蛋白質(zhì);PE4,基因預(yù)測(cè)顯示該基因編碼蛋白質(zhì)可能性較大,但沒有其他證據(jù)歸類為PE1-3)[8]。在過去的10年中,對(duì)預(yù)測(cè)的人類蛋白質(zhì)組的翻譯進(jìn)行可靠的檢測(cè)已經(jīng)取得了巨大的進(jìn)展(見圖3)。到2020年,90%以上的PE1-4蛋白已經(jīng)被檢測(cè)到。然而,很明顯,近年來進(jìn)展緩慢,人們認(rèn)識(shí)到,目前“缺失”的 1,899 個(gè)PE2-4蛋白的檢測(cè)將越來越困難。2.2 B/D-HPP


本文編號(hào)：3461188