珍稀瀕危植物獨葉草SCoT-PCR反應體系的建立與優(yōu)化
發(fā)布時間:2021-09-23 21:33
采用正交設計法對影響珍稀瀕危植物獨葉草SCoT-PCR反應體系的主要因素進行優(yōu)化,建立最佳的獨葉草SCoT-PCR反應體系,并利用36份種質(zhì)進行了驗證。結果表明:在獨葉草SCoT-PCR的最優(yōu)反應體系(25 μL)中:Mg2+為1.5 μL、dNTPs為1.50 μL、Taq酶為0.3 μL、Primer為1.2 μL、DNA為3.0 μL。建立的SCoT-PCR反應體系可用于該植物的遺傳多樣性和居群結構研究。
【文章來源】:種子. 2020,39(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
部分樣品基因組DNA的電泳結果
獨葉草SCoT-PCR體系優(yōu)化的擴增結果
反應體系的穩(wěn)定性影響到后續(xù)實驗。因此,對優(yōu)化的體系進行驗證有其必要。實驗結果(圖4)表明:在優(yōu)化而得的體系中,36份獨葉草樣品均能擴增出數(shù)量不同、清晰適中、分散性好的條帶,而且條帶的多態(tài)性豐富。擴增條帶數(shù)大多為2~4條,片段大小大多介于750~2 000 bp之間。這表明,試驗所建立的獨葉草SCoT-PCR最佳反應體系的效果好、穩(wěn)定性高,可用于后續(xù)的種質(zhì)資源遺傳多樣性評價,親緣關系和遺傳結構等方面的研究。圖4 最佳反應體系的驗證
【參考文獻】:
期刊論文
[1]彩葉芋SCoT反應體系的建立與優(yōu)化[J]. 王俏君,李瑞,歐曉梅,何雪,李想,李名揚,眭順照. 分子植物育種. 2018(17)
[2]辣木SCoT-PCR反應體系建立和引物篩選[J]. 林藝華,鄭濤,蔡坤秀,林宗鏗. 分子植物育種. 2018(13)
[3]基于SCoT標記的山西五角楓遺傳多樣性分析[J]. 張若晨,陳東莉,王良民. 北方園藝. 2018(12)
[4]美花石斛SSR-PCR體系的優(yōu)化研究[J]. 張文龍,石春杰. 種子. 2018(04)
[5]貴州金蕎麥種質(zhì)資源遺傳多樣性ISSR研究[J]. 鄧蓉,王安娜,張定紅,向清華. 種子. 2018(01)
[6]基于SSR標記的貴州野生白三葉遺傳多樣性分析[J]. 李莉,吳永潔,王元素. 種子. 2017(11)
[7]瀕危植物獨葉草的研究進展[J]. 謝計平. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2017(06)
[8]粉枝莓SCoT分子標記的PCR反應體系建立[J]. 袁雷,劉瑜,鐘政昌,解博,曹東星. 北方園藝. 2017(03)
[9]枸杞種質(zhì)遺傳多樣性SCoT分析[J]. 楊輝,周旋,王學琴,康磊,梅杰,楊劍. 北方園藝. 2017(02)
[10]基于MaxEnt瀕危植物獨葉草的中國潛在適生分布區(qū)預測[J]. 徐軍,曹博,白成科. 生態(tài)學雜志. 2015(12)
博士論文
[1]太白山獨葉草的小尺度分布成因及其克隆結構、遺傳多樣性研究[D]. 張晨光.西北大學 2018
碩士論文
[1]珍稀瀕危藥用植物獨葉草組織培養(yǎng)與內(nèi)生菌分離研究[D]. 姬文帥.陜西師范大學 2010
[2]太白山北坡資源斑塊與獨葉草種群分布耦合研究[D]. 劉喆.西北大學 2008
[3]瀕危植物獨葉草(毛茛科)的傳粉生物學及繁育系統(tǒng)研究[D]. 賀海霞.陜西師范大學 2006
[4]瀕危植物獨葉草種群生殖生態(tài)學研究[D]. 李紅.西北農(nóng)林科技大學 2001
本文編號:3406454
【文章來源】:種子. 2020,39(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
部分樣品基因組DNA的電泳結果
獨葉草SCoT-PCR體系優(yōu)化的擴增結果
反應體系的穩(wěn)定性影響到后續(xù)實驗。因此,對優(yōu)化的體系進行驗證有其必要。實驗結果(圖4)表明:在優(yōu)化而得的體系中,36份獨葉草樣品均能擴增出數(shù)量不同、清晰適中、分散性好的條帶,而且條帶的多態(tài)性豐富。擴增條帶數(shù)大多為2~4條,片段大小大多介于750~2 000 bp之間。這表明,試驗所建立的獨葉草SCoT-PCR最佳反應體系的效果好、穩(wěn)定性高,可用于后續(xù)的種質(zhì)資源遺傳多樣性評價,親緣關系和遺傳結構等方面的研究。圖4 最佳反應體系的驗證
【參考文獻】:
期刊論文
[1]彩葉芋SCoT反應體系的建立與優(yōu)化[J]. 王俏君,李瑞,歐曉梅,何雪,李想,李名揚,眭順照. 分子植物育種. 2018(17)
[2]辣木SCoT-PCR反應體系建立和引物篩選[J]. 林藝華,鄭濤,蔡坤秀,林宗鏗. 分子植物育種. 2018(13)
[3]基于SCoT標記的山西五角楓遺傳多樣性分析[J]. 張若晨,陳東莉,王良民. 北方園藝. 2018(12)
[4]美花石斛SSR-PCR體系的優(yōu)化研究[J]. 張文龍,石春杰. 種子. 2018(04)
[5]貴州金蕎麥種質(zhì)資源遺傳多樣性ISSR研究[J]. 鄧蓉,王安娜,張定紅,向清華. 種子. 2018(01)
[6]基于SSR標記的貴州野生白三葉遺傳多樣性分析[J]. 李莉,吳永潔,王元素. 種子. 2017(11)
[7]瀕危植物獨葉草的研究進展[J]. 謝計平. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2017(06)
[8]粉枝莓SCoT分子標記的PCR反應體系建立[J]. 袁雷,劉瑜,鐘政昌,解博,曹東星. 北方園藝. 2017(03)
[9]枸杞種質(zhì)遺傳多樣性SCoT分析[J]. 楊輝,周旋,王學琴,康磊,梅杰,楊劍. 北方園藝. 2017(02)
[10]基于MaxEnt瀕危植物獨葉草的中國潛在適生分布區(qū)預測[J]. 徐軍,曹博,白成科. 生態(tài)學雜志. 2015(12)
博士論文
[1]太白山獨葉草的小尺度分布成因及其克隆結構、遺傳多樣性研究[D]. 張晨光.西北大學 2018
碩士論文
[1]珍稀瀕危藥用植物獨葉草組織培養(yǎng)與內(nèi)生菌分離研究[D]. 姬文帥.陜西師范大學 2010
[2]太白山北坡資源斑塊與獨葉草種群分布耦合研究[D]. 劉喆.西北大學 2008
[3]瀕危植物獨葉草(毛茛科)的傳粉生物學及繁育系統(tǒng)研究[D]. 賀海霞.陜西師范大學 2006
[4]瀕危植物獨葉草種群生殖生態(tài)學研究[D]. 李紅.西北農(nóng)林科技大學 2001
本文編號:3406454
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