厲眼蕈蚊（Lycoriella ingenua）是一種雙翅目昆蟲(chóng),可以取食包括核盤(pán)菌在內(nèi)的真菌。前期研究表明厲眼蕈蚊與核盤(pán)菌低毒相關(guān)DNA病毒1（SsHADV-1）存在互惠性互作。SsHADV-1可以利用厲眼蕈蚊體內(nèi)復(fù)制,并利用其作為傳播介體;同時(shí)SsHADV-1抑制核盤(pán)菌合成對(duì)厲眼蕈蚊具有驅(qū)趨避作用的蘑菇醇和辛酮,吸引成蟲(chóng)前往產(chǎn)卵,幼蟲(chóng)在感染病毒的菌落上取食后可以提高成蟲(chóng)的懷卵量。為了研究這種互作機(jī)制,本研究比較了感染SsHADV-1前后厲眼蕈蚊幼蟲(chóng)和成蟲(chóng)轉(zhuǎn)錄組;同時(shí)還發(fā)現(xiàn)厲眼蕈蚊可以傳播其它真菌病毒。主要結(jié)果如下:以不攜帶SsHADV-1的厲眼蕈蚊為對(duì)照,攜帶病毒的厲眼蕈蚊在幼蟲(chóng)和成蟲(chóng)時(shí)期的差異表達(dá)基因分別為558個(gè)和819個(gè)。對(duì)顯著差異表達(dá)的基因進(jìn)行了GO功能分析和KEGG通路富集分析,發(fā)現(xiàn)SsHADV-1的感染主要影響了厲眼蕈蚊代謝以及生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)的基因和通路,成蟲(chóng)基因富集通路和幼蟲(chóng)時(shí)期相似。其中顯著性上調(diào)的基因富集到的通路有包括跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)、化合物綁定信號(hào)傳導(dǎo)、運(yùn)輸和分解代謝和免疫系統(tǒng)等。顯著性下調(diào)的基因富集到的有催化活性、綁定、水解酶、氧化還原酶活性、脂質(zhì)和氨基酸代謝和碳水化合... 

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攜帶和不攜帶SsHADV-1的厲眼蕈蚊在幼蟲(chóng)和成蟲(chóng)時(shí)期的總RNA樣品注：M：DL2000；泳道1-3，LDT8為幼蟲(chóng)時(shí)期厲眼蕈蚊取食攜帶SsHADV-1菌絲后總RNA的3組生物學(xué)重復(fù)；

華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士研究生學(xué)位（畢業(yè)）論文18圖2.2 攜帶和不攜帶SsHADV-1的厲眼蕈蚊在幼蟲(chóng)和成蟲(chóng)時(shí)期的總RNA樣品中SsHADV-1病毒的 RT-PCR 檢測(cè)注：M 為 DL2000，泳道 1 代表攜帶 SsHADV-1 和不攜帶 SsHADV-1 的厲眼蕈蚊在幼蟲(chóng)和成蟲(chóng)時(shí)樣品中病毒SsHADV-1 含量，泳道 2 代表厲眼蕈蚊內(nèi)參基因 COI 片段，泳道 3 代表水，LDT81-LDT83、LDT8VF1-LDT8VF3、ADT81-ADT83、ADT8VF1-ADT8VF3 分別為 3 組生物學(xué)重復(fù)Fig 2.2 RT-PCR detection of SsHADV-1 virus in total RNAsamples of larvae and adult L.ingenua with and without SsHADV-1-infectedM represents the DL2000 marker. Lane 1 represents the content of viral SsHADV-1 in the larvae and adult L. ingenuaof the SsHADV-1-infected and SsHADV-1-free, lane 2 represents the COI gene fragment of the L. ingenua, and lane 3represents water, LDT81 to LDT83, LDT8VF1 to LDT8VF3, ADT81 to ADT83, ADT8VF1 to ADT8VF3 are three setsof biological replicates.3.2 RNA-Seq 測(cè)序數(shù)據(jù)的拼接和注釋3.2.1 RNA 樣品測(cè)序準(zhǔn)確度高將獲得的原始數(shù)據(jù)通過(guò)過(guò)濾得到有效數(shù)據(jù)。Q20 和 Q30 表示測(cè)序質(zhì)量值大于等于 20 或 30 的堿基所占百分比，質(zhì)量值是 Q20 表示錯(cuò)誤識(shí)別的概率是 1%即正確率是 99%，質(zhì)量值是 Q30 表示錯(cuò)誤識(shí)別的概率是 0.1%，即正確率是 99.9%。根據(jù)數(shù)據(jù)可知各樣品中 Q20 均在 95%以上

華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士研究生學(xué)位（畢業(yè)）論文LDT8VF2 21932232 17256008 78 68%LDT8VF3 21782572 17300727 79 42%ping ratio=Mapped reads/All reads 基因表達(dá)水平相關(guān)性強(qiáng) 12 個(gè)樣本的表達(dá)量進(jìn)行 PCA 分析，圖 2.3 展示各生物學(xué)重復(fù)之間的數(shù)據(jù)結(jié)果發(fā)現(xiàn) ADT8VF3 離群較遠(yuǎn)，和 ADT8VF1 以及 ADT8VF2 的差異較大。析排除 ADT8VF3。而其它樣本生物學(xué)重復(fù)數(shù)據(jù)相關(guān)性顯著，聚類(lèi)結(jié)果較行后續(xù)分析。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]厲眼蕈蚊傳播核盤(pán)菌弱致病性相關(guān)DNA病毒1研究[D]. 劉四.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]SRBSDV和RRSV在介體飛虱體內(nèi)的侵染機(jī)理[D]. 賈東升.福建農(nóng)林大學(xué) 2013

碩士論文
[1]SsHADV-1影響核盤(pán)菌侵染油菜機(jī)制的解析[D]. 成淑芬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]葡萄根瘤蚜氣味結(jié)合蛋白和化學(xué)感受蛋白的鑒定與組織分布研究[D]. 張玥.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[3]利用RNA-seq技術(shù)解析核盤(pán)菌與DNA病毒SsHADV-1的互作機(jī)制[D]. 趙真珍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



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