原甲藻是典型的赤潮甲藻,對海洋生態(tài)環(huán)境有著重要的影響,因此一直引起人們的關(guān)注。同時它的代謝產(chǎn)物種類多樣且具有很好的生物活性,其代表產(chǎn)物岡田軟海綿酸（okadaic acid,OA）及其衍生物鰭藻毒素（dinophysistoxin-1,DTX-1）是導(dǎo)致腹瀉性貝毒（diarrheic shellfish poisoning,DSP）的主要組分,通過在海產(chǎn)品中的積累會直接影響到人們的健康,并且可能會導(dǎo)致癌癥的發(fā)生,然而它又具有一定的藥用價值,因此原甲藻代謝產(chǎn)物成為了海洋天然產(chǎn)物領(lǐng)域的研究熱點。為了后續(xù)研究微藻產(chǎn)毒與其共附生微生物間的關(guān)系,對利瑪原甲藻（Prorocentrum lima）PL11通過Illumina高通量測序技術(shù),分析了樣品中共附生微生物的物種多樣性和豐度信息。測序共獲得42065條序列,68個OTU;稀釋曲線表明測序深度足夠;多樣性指數(shù)Simpson值為0.097,Shannon值為2.807。PL11來源共附生菌包括5門,14綱,26目,38科及54屬。其中優(yōu)勢門（>5%）為3個,包括變形菌門（Proteobacteria,75.5%）、擬桿菌門（Bacteri... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：82 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

基于OTU的利瑪原甲藻（PL11）共附生菌群系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹

圖 2-3 利瑪原甲藻（PL11）共附生菌群屬水平的相對豐度分布圖-3 Relative abundance at genus lever of the bacterial community associated with P. lima (PL11) 利瑪原甲藻可培養(yǎng)共附生菌的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析從 P. lima PL11 培養(yǎng)物中分離出了 9 株細(xì)菌，用 MEGA6 建立的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化圖 2-5，通過序列同源性比對（表 2-4）以及系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹的結(jié)果顯示，這株分屬于 8 個屬，包括 Ochrobactrum sp.（2 株）及 Microbacterium sp.、riphagus sp. 、Ponticoccus sp.、Hoeflea sp.、Labrenzia sp.、Erythrobacter sp.、ngopyxis sp.各 1 株。02040Relativea相GenusMarivitaunclassified_HyphomonadaceaeRoseovariusnorank_OM190norank_HyphomonadaceaePhaeodactylibacterPyruvatibacternorank_Nannocystaceae

23圖 2-5 基于 16SrRNA 序列構(gòu)建的可培養(yǎng)共附生菌的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹Fig.2-5 Phylogenetic tree based on neighbor-joining analysis of 16SrRNA sequences

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]東海產(chǎn)麻痹性貝毒鏈狀亞歷山大藻共附生菌群多樣性研究[J]. 唐瑩瑩,喬玉寶,蔣志偉,張靜,張若男,田曉清,馬麗艷,張曉玲,陸亞男,樊成奇,楊橋.  海洋漁業(yè). 2018(06)
[2]基于高通量測序技術(shù)的美洲獾腸道微生物多樣性分析[J]. 王志永,吳曉陽,張永賓.  野生動物學(xué)報. 2018(04)
[3]東山島星座短腹海鞘共附生微生物多樣性研究[J]. 喬玉寶,田曉清,唐瑩瑩,樊成奇,馬麗艷,陸亞男.  海洋漁業(yè). 2018(03)
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碩士論文
[1]利瑪原甲藻三個ABC轉(zhuǎn)運蛋白全長cDNA序列的獲取及其在不同環(huán)境條件下的表達(dá)分析[D]. 古松.暨南大學(xué) 2018
[2]基于傳統(tǒng)和高通量測序技術(shù)研究地膜對辣椒土壤特性及微生物多樣性的影響[D]. 劉岳飛.廣西大學(xué) 2018
[3]海洋細(xì)菌Ponticoccus sp. PD-2群體感應(yīng)系統(tǒng)及對抑藻功能的調(diào)控探究[D]. 遲雯丹.國家海洋局第一海洋研究所 2017
[4]塔瑪亞歷山大藻共生菌的物種多樣性及自產(chǎn)毒株篩選研究[D]. 劉巧紅.上海海洋大學(xué) 2016
[5]我國典型貝類增養(yǎng)殖海域藻毒素組成、分布狀況及貝類染毒特征分析[D]. 陳建華.中國科學(xué)院研究生院（海洋研究所） 2013
[6]關(guān)鍵環(huán)境因子對利瑪原甲藻的生長和產(chǎn)毒的影響研究[D]. 徐杏.中國海洋大學(xué) 2009
[7]不同氮源和磷源對利瑪原甲藻（Prorocentrum lima）生長和產(chǎn)毒影響的研究[D]. 鐘娜.暨南大學(xué) 2007
[8]利瑪原甲藻產(chǎn)毒特征與化感作用的初步研究[D]. 李麗璇.暨南大學(xué) 2006



本文編號：3383155