利瑪原甲藻微生物多樣性及次級(jí)代謝產(chǎn)物的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-09-04 11:08
原甲藻是典型的赤潮甲藻,對(duì)海洋生態(tài)環(huán)境有著重要的影響,因此一直引起人們的關(guān)注。同時(shí)它的代謝產(chǎn)物種類多樣且具有很好的生物活性,其代表產(chǎn)物岡田軟海綿酸(okadaic acid,OA)及其衍生物鰭藻毒素(dinophysistoxin-1,DTX-1)是導(dǎo)致腹瀉性貝毒(diarrheic shellfish poisoning,DSP)的主要組分,通過(guò)在海產(chǎn)品中的積累會(huì)直接影響到人們的健康,并且可能會(huì)導(dǎo)致癌癥的發(fā)生,然而它又具有一定的藥用價(jià)值,因此原甲藻代謝產(chǎn)物成為了海洋天然產(chǎn)物領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。為了后續(xù)研究微藻產(chǎn)毒與其共附生微生物間的關(guān)系,對(duì)利瑪原甲藻(Prorocentrum lima)PL11通過(guò)Illumina高通量測(cè)序技術(shù),分析了樣品中共附生微生物的物種多樣性和豐度信息。測(cè)序共獲得42065條序列,68個(gè)OTU;稀釋曲線表明測(cè)序深度足夠;多樣性指數(shù)Simpson值為0.097,Shannon值為2.807。PL11來(lái)源共附生菌包括5門,14綱,26目,38科及54屬。其中優(yōu)勢(shì)門(>5%)為3個(gè),包括變形菌門(Proteobacteria,75.5%)、擬桿菌門(Bacteri...
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
基于OTU的利瑪原甲藻(PL11)共附生菌群系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹
圖 2-3 利瑪原甲藻(PL11)共附生菌群屬水平的相對(duì)豐度分布圖-3 Relative abundance at genus lever of the bacterial community associated with P. lima (PL11) 利瑪原甲藻可培養(yǎng)共附生菌的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析從 P. lima PL11 培養(yǎng)物中分離出了 9 株細(xì)菌,用 MEGA6 建立的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化圖 2-5,通過(guò)序列同源性比對(duì)(表 2-4)以及系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹的結(jié)果顯示,這株分屬于 8 個(gè)屬,包括 Ochrobactrum sp.(2 株)及 Microbacterium sp.、riphagus sp. 、Ponticoccus sp.、Hoeflea sp.、Labrenzia sp.、Erythrobacter sp.、ngopyxis sp.各 1 株。02040Relativea相GenusMarivitaunclassified_HyphomonadaceaeRoseovariusnorank_OM190norank_HyphomonadaceaePhaeodactylibacterPyruvatibacternorank_Nannocystaceae
23圖 2-5 基于 16SrRNA 序列構(gòu)建的可培養(yǎng)共附生菌的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹Fig.2-5 Phylogenetic tree based on neighbor-joining analysis of 16SrRNA sequences
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]東海產(chǎn)麻痹性貝毒鏈狀亞歷山大藻共附生菌群多樣性研究[J]. 唐瑩瑩,喬玉寶,蔣志偉,張靜,張若男,田曉清,馬麗艷,張曉玲,陸亞男,樊成奇,楊橋. 海洋漁業(yè). 2018(06)
[2]基于高通量測(cè)序技術(shù)的美洲獾腸道微生物多樣性分析[J]. 王志永,吳曉陽(yáng),張永賓. 野生動(dòng)物學(xué)報(bào). 2018(04)
[3]東山島星座短腹海鞘共附生微生物多樣性研究[J]. 喬玉寶,田曉清,唐瑩瑩,樊成奇,馬麗艷,陸亞男. 海洋漁業(yè). 2018(03)
[4]PP2A對(duì)轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β1誘導(dǎo)的淋巴瘤細(xì)胞凋亡的影響[J]. 趙哲,劉莉,劉琨,姚平,汪茂榮. 華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2017(01)
[5]白苞裸蒴化學(xué)成分研究[J]. 張普照,蘇明聲,王雅琪,邵峰,楊明,張亞梅. 中草藥. 2016(19)
[6]鞘氨醇單胞菌USTB-05對(duì)微囊藻毒素的生物降解[J]. 徐慧敏,閆海,馬松,王華生,尹春華,劉曉璐. 中國(guó)環(huán)境科學(xué). 2014(05)
[7]慢原甲藻研究進(jìn)展[J]. 劉俏,龍麗娟. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(15)
[8]天然產(chǎn)物類藥物的合成生物學(xué)研究[J]. 黃偉,王健博,唐功利. 生命科學(xué). 2011(09)
[9]海洋毒素研究進(jìn)展[J]. 李勇,楊雁,史清文,董玫. 天然產(chǎn)物研究與開發(fā). 2011(03)
[10]腹瀉性貝類毒素的研究進(jìn)展[J]. 王偉. 農(nóng)家科技. 2011(04)
碩士論文
[1]利瑪原甲藻三個(gè)ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白全長(zhǎng)cDNA序列的獲取及其在不同環(huán)境條件下的表達(dá)分析[D]. 古松.暨南大學(xué) 2018
[2]基于傳統(tǒng)和高通量測(cè)序技術(shù)研究地膜對(duì)辣椒土壤特性及微生物多樣性的影響[D]. 劉岳飛.廣西大學(xué) 2018
[3]海洋細(xì)菌Ponticoccus sp. PD-2群體感應(yīng)系統(tǒng)及對(duì)抑藻功能的調(diào)控探究[D]. 遲雯丹.國(guó)家海洋局第一海洋研究所 2017
[4]塔瑪亞歷山大藻共生菌的物種多樣性及自產(chǎn)毒株篩選研究[D]. 劉巧紅.上海海洋大學(xué) 2016
[5]我國(guó)典型貝類增養(yǎng)殖海域藻毒素組成、分布狀況及貝類染毒特征分析[D]. 陳建華.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2013
[6]關(guān)鍵環(huán)境因子對(duì)利瑪原甲藻的生長(zhǎng)和產(chǎn)毒的影響研究[D]. 徐杏.中國(guó)海洋大學(xué) 2009
[7]不同氮源和磷源對(duì)利瑪原甲藻(Prorocentrum lima)生長(zhǎng)和產(chǎn)毒影響的研究[D]. 鐘娜.暨南大學(xué) 2007
[8]利瑪原甲藻產(chǎn)毒特征與化感作用的初步研究[D]. 李麗璇.暨南大學(xué) 2006
本文編號(hào):3383155
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
基于OTU的利瑪原甲藻(PL11)共附生菌群系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹
圖 2-3 利瑪原甲藻(PL11)共附生菌群屬水平的相對(duì)豐度分布圖-3 Relative abundance at genus lever of the bacterial community associated with P. lima (PL11) 利瑪原甲藻可培養(yǎng)共附生菌的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析從 P. lima PL11 培養(yǎng)物中分離出了 9 株細(xì)菌,用 MEGA6 建立的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化圖 2-5,通過(guò)序列同源性比對(duì)(表 2-4)以及系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹的結(jié)果顯示,這株分屬于 8 個(gè)屬,包括 Ochrobactrum sp.(2 株)及 Microbacterium sp.、riphagus sp. 、Ponticoccus sp.、Hoeflea sp.、Labrenzia sp.、Erythrobacter sp.、ngopyxis sp.各 1 株。02040Relativea相GenusMarivitaunclassified_HyphomonadaceaeRoseovariusnorank_OM190norank_HyphomonadaceaePhaeodactylibacterPyruvatibacternorank_Nannocystaceae
23圖 2-5 基于 16SrRNA 序列構(gòu)建的可培養(yǎng)共附生菌的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹Fig.2-5 Phylogenetic tree based on neighbor-joining analysis of 16SrRNA sequences
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]東海產(chǎn)麻痹性貝毒鏈狀亞歷山大藻共附生菌群多樣性研究[J]. 唐瑩瑩,喬玉寶,蔣志偉,張靜,張若男,田曉清,馬麗艷,張曉玲,陸亞男,樊成奇,楊橋. 海洋漁業(yè). 2018(06)
[2]基于高通量測(cè)序技術(shù)的美洲獾腸道微生物多樣性分析[J]. 王志永,吳曉陽(yáng),張永賓. 野生動(dòng)物學(xué)報(bào). 2018(04)
[3]東山島星座短腹海鞘共附生微生物多樣性研究[J]. 喬玉寶,田曉清,唐瑩瑩,樊成奇,馬麗艷,陸亞男. 海洋漁業(yè). 2018(03)
[4]PP2A對(duì)轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β1誘導(dǎo)的淋巴瘤細(xì)胞凋亡的影響[J]. 趙哲,劉莉,劉琨,姚平,汪茂榮. 華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2017(01)
[5]白苞裸蒴化學(xué)成分研究[J]. 張普照,蘇明聲,王雅琪,邵峰,楊明,張亞梅. 中草藥. 2016(19)
[6]鞘氨醇單胞菌USTB-05對(duì)微囊藻毒素的生物降解[J]. 徐慧敏,閆海,馬松,王華生,尹春華,劉曉璐. 中國(guó)環(huán)境科學(xué). 2014(05)
[7]慢原甲藻研究進(jìn)展[J]. 劉俏,龍麗娟. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(15)
[8]天然產(chǎn)物類藥物的合成生物學(xué)研究[J]. 黃偉,王健博,唐功利. 生命科學(xué). 2011(09)
[9]海洋毒素研究進(jìn)展[J]. 李勇,楊雁,史清文,董玫. 天然產(chǎn)物研究與開發(fā). 2011(03)
[10]腹瀉性貝類毒素的研究進(jìn)展[J]. 王偉. 農(nóng)家科技. 2011(04)
碩士論文
[1]利瑪原甲藻三個(gè)ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白全長(zhǎng)cDNA序列的獲取及其在不同環(huán)境條件下的表達(dá)分析[D]. 古松.暨南大學(xué) 2018
[2]基于傳統(tǒng)和高通量測(cè)序技術(shù)研究地膜對(duì)辣椒土壤特性及微生物多樣性的影響[D]. 劉岳飛.廣西大學(xué) 2018
[3]海洋細(xì)菌Ponticoccus sp. PD-2群體感應(yīng)系統(tǒng)及對(duì)抑藻功能的調(diào)控探究[D]. 遲雯丹.國(guó)家海洋局第一海洋研究所 2017
[4]塔瑪亞歷山大藻共生菌的物種多樣性及自產(chǎn)毒株篩選研究[D]. 劉巧紅.上海海洋大學(xué) 2016
[5]我國(guó)典型貝類增養(yǎng)殖海域藻毒素組成、分布狀況及貝類染毒特征分析[D]. 陳建華.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2013
[6]關(guān)鍵環(huán)境因子對(duì)利瑪原甲藻的生長(zhǎng)和產(chǎn)毒的影響研究[D]. 徐杏.中國(guó)海洋大學(xué) 2009
[7]不同氮源和磷源對(duì)利瑪原甲藻(Prorocentrum lima)生長(zhǎng)和產(chǎn)毒影響的研究[D]. 鐘娜.暨南大學(xué) 2007
[8]利瑪原甲藻產(chǎn)毒特征與化感作用的初步研究[D]. 李麗璇.暨南大學(xué) 2006
本文編號(hào):3383155
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