MORC（Microrchidia）基因是一類高度保守的核蛋白編碼基因,它作為一種新型的表觀調(diào)控因子,參與了植物轉(zhuǎn)錄水平的基因沉默和免疫防御調(diào)控過(guò)程。通常,MORC蛋白的N端含有一個(gè)保守的GHKL-type（Gyrase，Hsp90，Histidine kinase，MutL）ATPase模塊,它能夠影響基因的表達(dá)調(diào)控過(guò)程。目前,MORC蛋白在動(dòng)物和植物中均已鑒定出,其中在人類和擬南芥中分別鑒定出了4個(gè)和7個(gè)典型的MORC家族成員。為了深入探究MORC基因家族的系統(tǒng)演化過(guò)程,本研究利用生物信息學(xué)和系統(tǒng)發(fā)生學(xué)等手段對(duì)動(dòng)植物中MORC基因家族的進(jìn)化歷史、分類關(guān)系和MORC蛋白的序列特征等進(jìn)行了全面的研究。本研究從27和60個(gè)代表性動(dòng)物和植物的基因組中分別鑒定出了83和356個(gè)MORC蛋白的候選基因。同時(shí),基于轉(zhuǎn)錄組的蛋白序列信息,還從56個(gè)非開(kāi)花植物中鑒定出了154個(gè)候選MORC蛋白序列。對(duì)這些MORC蛋白序列進(jìn)行保守motif的分析發(fā)現(xiàn),MORC蛋白的N端含有一段連續(xù)的保守motif組成,將其定義為MORC結(jié)構(gòu)域。MORC結(jié)構(gòu)域的序列保守,含有一些典型的蛋白序列二級(jí)結(jié)構(gòu)元件,可以作為MO... 

【文章來(lái)源】：福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁(yè)數(shù)】：66 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

部分物種中M之刀之C基因的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)和保守切

圖３－４?ＭＯＲＣ?

過(guò)大片段復(fù)制或全基因組復(fù)制的方式產(chǎn)生拷貝數(shù)的加倍，可以看出相對(duì)于近期發(fā)??生的復(fù)制事件，那些發(fā)生在較為古老的Ｙ事件中的物種之間的共線性關(guān)系則顯得??相對(duì)較差（見(jiàn)圖３－７），表明它們?cè)陂L(zhǎng)期的進(jìn)化過(guò)程中發(fā)生了一定的分化。同時(shí)，??在單子葉植物Ｇｒｏｕｐ?ＩＩ－ｃ分支中基因大多都有兩個(gè)及以上拷貝，表明??基因在單子葉植物中也發(fā)生了一定的擴(kuò)增，甚至可能經(jīng)歷了一次禾本科近??期發(fā)生的全基因組復(fù)制ｐ事件。??２４??


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