擬南芥中AtR8 lncRNA功能及作用機(jī)制初探
發(fā)布時(shí)間:2021-05-21 14:13
非編碼RNA(non-coding RNA)不翻譯成蛋白質(zhì),它們通過轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后及翻譯水平調(diào)控靶基因表達(dá),在生物體生長發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用。大于200個(gè)核苷酸長度的為長非編碼RNA(long non-coding RNA,IncRNA),它們以調(diào)節(jié)因子形式,在植物開花、雄性不育、營養(yǎng)代謝、生物和非生物脅迫等過程中起著重要作用。AtR8lncRNA(259 nt)是 2012 年于擬南芥(Arabidopsisthaliana)中發(fā)現(xiàn)的一個(gè) RNA 聚合酶IⅢ轉(zhuǎn)錄的lncRNA,種子萌發(fā)期其于擬南芥根尖端大量表達(dá),并響應(yīng)ABA、NaCl、GA3、SA、Mannitol等應(yīng)激環(huán)境;其同源物存在于結(jié)球甘藍(lán)(Brassica oleracea L.var capitat L.)和白菜(Brassica rapa ar pekinensis)等十字花科蕓薹屬植物中。目前,AtR8 lncRNA的詳細(xì)功能及作用機(jī)制尚不清楚。本研究表明,正常條件下,atr8 突變體導(dǎo)致種子干癟、長角果發(fā)育不完全、蓮座葉邊緣鋸齒狀、成熟植株纖細(xì)矮小、種子萌發(fā)率大幅度降低,這些表型在AtR8 lncRNA過表達(dá)(At...
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 長非編碼RNA
1.2 植物中已知功能性lncRNA
1.3 植物種子萌發(fā)生理及其相關(guān)非編碼RNA的研究
1.3.1 種子的休眠與萌發(fā)
1.3.2 種子休眠與萌發(fā)相關(guān)的非編碼RNA
1.4 植物谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶家族
1.4.1 谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶
1.4.2 植物谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶研究進(jìn)展
1.5 研究目的意義
2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 植物培養(yǎng)基制備
2.1.3 擬南芥培養(yǎng)
2.2 儀器設(shè)備
2.3 生化實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 植物RNA提取
2.3.2 植物基因組DNA的提取
2.3.3 整體原位雜交
2.3.4 Northern雜交
2.3.5 實(shí)時(shí)熒光定量(RT-qPCR)
3 擬南芥中AtR8 lncRNA功能及作用機(jī)制初探
3.1 AtR8 lncRNA染色體位置分析
3.2 GSTU7表達(dá)特性分析
3.3 gstu7突變體篩選
3.4 擬南芥生長發(fā)育過程中AtR8 lncRNA與GSTU7功能分析
3.5 ABA應(yīng)激條件下,AtR8 lncRNA與GSTU7功能分析
3.6 正常和ABA應(yīng)激條件下,AtR8 lncRNA和GSTU7影響基因表達(dá)分析
3.7 本章小結(jié)
4 結(jié)球甘藍(lán)中AtR8 lncRNA同源物,BoNR8 lncRNA功能及作用機(jī)制初探
4.1 正常條件下,BoNR8 lncRNA過表達(dá)影響了擬南芥發(fā)育
4.2 BoNR8 lncRNA過表達(dá)降低了擬南芥萌發(fā)種子對(duì)高鹽的抗性
4.3 BoNR8 lncRNA過表達(dá)降低了擬南芥萌發(fā)種子對(duì)高濃度ABA的敏感性
4.4 BoNR8 lncRNA改變了擬南芥中ABA響應(yīng)基因的表達(dá)
4.5 本章小結(jié)
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
附件
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]十字花科植物種子低分子RNA提取方法比較[J]. 劉春曉,黃小慶,劉自廣,彭疑芳,李丹丹,張曉旭,李爽,湯川泰,吳娟. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019(03)
[2]脫落酸調(diào)控種子休眠和萌發(fā)的分子機(jī)制[J]. 伍靜輝,謝楚萍,田長恩,周玉萍. 植物學(xué)報(bào). 2018(04)
[3]植物長鏈非編碼RNA進(jìn)展分析[J]. 高成香,鄧粉妮,沈法富. 分子植物育種. 2018(03)
[4]miRNA在植物種子發(fā)育過程中的作用[J]. 龔淑敏,丁艷菲,朱誠. 遺傳. 2015(06)
[5]植物長鏈非編碼RNA研究進(jìn)展[J]. 黃小慶,李丹丹,吳娟. 遺傳. 2015(04)
[6]種子的休眠與萌發(fā)[J]. 劉寧. 生物學(xué)通報(bào). 2014(10)
[7]谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶的研究進(jìn)展[J]. 陳秀華,王臻昱,李先平,朱延明,劉麗,陳威,陳勤. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(01)
[8]植物激素對(duì)種子休眠和萌發(fā)調(diào)控機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 楊榮超,張海軍,王倩,郭仰東. 草地學(xué)報(bào). 2012(01)
[9]谷胱甘肽過氧化物酶和谷胱甘肽轉(zhuǎn)硫酶研究進(jìn)展[J]. 馬森. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2008(10)
[10]Arabidopsis RAV1 is down-regulated by brassinosteroid and may act as a negative regulator during plant development[J]. Yu Xin HU~*, Yong Hong WANG~*, Xin Fang LIU, Jia Yang LI~(**) Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China.. Cell Research. 2004(01)
碩士論文
[1]紫花苜蓿MsGSTU8基因的克隆及其功能研究[D]. 張雪.哈爾濱師范大學(xué) 2017
本文編號(hào):3199848
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 長非編碼RNA
1.2 植物中已知功能性lncRNA
1.3 植物種子萌發(fā)生理及其相關(guān)非編碼RNA的研究
1.3.1 種子的休眠與萌發(fā)
1.3.2 種子休眠與萌發(fā)相關(guān)的非編碼RNA
1.4 植物谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶家族
1.4.1 谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶
1.4.2 植物谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶研究進(jìn)展
1.5 研究目的意義
2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 植物培養(yǎng)基制備
2.1.3 擬南芥培養(yǎng)
2.2 儀器設(shè)備
2.3 生化實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 植物RNA提取
2.3.2 植物基因組DNA的提取
2.3.3 整體原位雜交
2.3.4 Northern雜交
2.3.5 實(shí)時(shí)熒光定量(RT-qPCR)
3 擬南芥中AtR8 lncRNA功能及作用機(jī)制初探
3.1 AtR8 lncRNA染色體位置分析
3.2 GSTU7表達(dá)特性分析
3.3 gstu7突變體篩選
3.4 擬南芥生長發(fā)育過程中AtR8 lncRNA與GSTU7功能分析
3.5 ABA應(yīng)激條件下,AtR8 lncRNA與GSTU7功能分析
3.6 正常和ABA應(yīng)激條件下,AtR8 lncRNA和GSTU7影響基因表達(dá)分析
3.7 本章小結(jié)
4 結(jié)球甘藍(lán)中AtR8 lncRNA同源物,BoNR8 lncRNA功能及作用機(jī)制初探
4.1 正常條件下,BoNR8 lncRNA過表達(dá)影響了擬南芥發(fā)育
4.2 BoNR8 lncRNA過表達(dá)降低了擬南芥萌發(fā)種子對(duì)高鹽的抗性
4.3 BoNR8 lncRNA過表達(dá)降低了擬南芥萌發(fā)種子對(duì)高濃度ABA的敏感性
4.4 BoNR8 lncRNA改變了擬南芥中ABA響應(yīng)基因的表達(dá)
4.5 本章小結(jié)
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
附件
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]十字花科植物種子低分子RNA提取方法比較[J]. 劉春曉,黃小慶,劉自廣,彭疑芳,李丹丹,張曉旭,李爽,湯川泰,吳娟. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019(03)
[2]脫落酸調(diào)控種子休眠和萌發(fā)的分子機(jī)制[J]. 伍靜輝,謝楚萍,田長恩,周玉萍. 植物學(xué)報(bào). 2018(04)
[3]植物長鏈非編碼RNA進(jìn)展分析[J]. 高成香,鄧粉妮,沈法富. 分子植物育種. 2018(03)
[4]miRNA在植物種子發(fā)育過程中的作用[J]. 龔淑敏,丁艷菲,朱誠. 遺傳. 2015(06)
[5]植物長鏈非編碼RNA研究進(jìn)展[J]. 黃小慶,李丹丹,吳娟. 遺傳. 2015(04)
[6]種子的休眠與萌發(fā)[J]. 劉寧. 生物學(xué)通報(bào). 2014(10)
[7]谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶的研究進(jìn)展[J]. 陳秀華,王臻昱,李先平,朱延明,劉麗,陳威,陳勤. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(01)
[8]植物激素對(duì)種子休眠和萌發(fā)調(diào)控機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 楊榮超,張海軍,王倩,郭仰東. 草地學(xué)報(bào). 2012(01)
[9]谷胱甘肽過氧化物酶和谷胱甘肽轉(zhuǎn)硫酶研究進(jìn)展[J]. 馬森. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2008(10)
[10]Arabidopsis RAV1 is down-regulated by brassinosteroid and may act as a negative regulator during plant development[J]. Yu Xin HU~*, Yong Hong WANG~*, Xin Fang LIU, Jia Yang LI~(**) Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China.. Cell Research. 2004(01)
碩士論文
[1]紫花苜蓿MsGSTU8基因的克隆及其功能研究[D]. 張雪.哈爾濱師范大學(xué) 2017
本文編號(hào):3199848
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