基于轉錄組學分析miR-34b/c與miR-449對小鼠輸出小管結構與功能的影響
發(fā)布時間:2021-05-08 23:24
目的:研究miR-34b/c、miR-449在維持輸出小管正常結構與功能中發(fā)揮的作用,探索miR-34b/c-/-、miR-449-/-雙敲除小鼠不育的分子機制。方法:HE染色對小鼠輸出小管形態(tài)進行觀察;利用轉錄組測序技術對野生型小鼠和miR-34b/c-/-、miR-449-/-雙敲除小鼠輸出小管基因表達進行分析,從中篩選出miR-34b/c、miR-449可能的靶基因與差異表達基因進行聯合分析;qRT-PCR法驗證測序結果。結果:雙敲除小鼠輸出小管形態(tài)異常;與野生型小鼠相比,雙敲除小鼠輸出小管中參與纖毛等結構形成以及水、離子、蛋白質轉運等活動的基因表達顯著下降。結論:miR-34b/c、miR-449的缺失導致雙敲除小鼠輸出小管結構異常,輸出小管纖毛運動與重吸收功能障礙,導致雙敲除小鼠不育。
【文章來源】:中華男科學雜志. 2020,26(12)北大核心CSCD
【文章頁數】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 主要試劑與儀器
1.3 小鼠基因型鑒定
1.4 小鼠輸出小管HE染色
1.5 組織樣本采集
1.6 轉錄組測序及分析
1.6.1 基因文庫的構建與測序
1.6.2 測序數據分析
1.7 靶基因預測與分析
1.8 qRT-PCR驗證mRNA表達水平
1.9 統計學分析
2 結果
2.1 小鼠基因型鑒定
2.2 小鼠輸出小管形態(tài)學觀察
2.3 測序結果與分析
2.3.1 差異表達基因檢測
2.3.2 差異表達基因GO功能分析
2.3.3 DEG的KEGG通路分析
2.3.4 靶基因聯合分析
2.4 qRT-PCR驗證
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉錄組研究新技術:RNA-Seq及其應用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
本文編號:3176177
【文章來源】:中華男科學雜志. 2020,26(12)北大核心CSCD
【文章頁數】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 主要試劑與儀器
1.3 小鼠基因型鑒定
1.4 小鼠輸出小管HE染色
1.5 組織樣本采集
1.6 轉錄組測序及分析
1.6.1 基因文庫的構建與測序
1.6.2 測序數據分析
1.7 靶基因預測與分析
1.8 qRT-PCR驗證mRNA表達水平
1.9 統計學分析
2 結果
2.1 小鼠基因型鑒定
2.2 小鼠輸出小管形態(tài)學觀察
2.3 測序結果與分析
2.3.1 差異表達基因檢測
2.3.2 差異表達基因GO功能分析
2.3.3 DEG的KEGG通路分析
2.3.4 靶基因聯合分析
2.4 qRT-PCR驗證
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉錄組研究新技術:RNA-Seq及其應用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
本文編號:3176177
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