一株菌的聚酮合成酶基因驗(yàn)證及其鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-04-14 23:44
采用土壤微生物稀釋平板法分離技術(shù),從煙草根際土壤分離到一株活體純培養(yǎng)物,將其編號(hào)為ZMD1。ZMD1菌株與2種病原的拮抗試驗(yàn)均顯示出一定的抗菌活性;通過聚酮合成酶(PKS)基因的兼并引物對(duì)ZMD1進(jìn)行了克隆驗(yàn)證,測(cè)序結(jié)果與其他物種的PKS基因序列具有較高的相似性,故將ZMD1初步定性為產(chǎn)聚酮合成酶活性菌株。綜合ZMD1菌株的一般形態(tài)特征、生理生化特征和菌株的16S rDNA保守序列特征分析,初步將ZMD1確定為鏈霉菌屬(Streptomyces)菌株,暫命名為Streptomyces sp.ZMD1。ZMD1可作為煙草病害生防菌劑、土壤保育菌劑和專用菌肥等開發(fā)的良好備用材料。
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(07)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
ZMD1的N-J系統(tǒng)發(fā)育樹
采用紙片法考察ZMD1菌株對(duì)金黃色葡萄球菌和煙草黑脛病病原的抗菌活性。試驗(yàn)結(jié)果表明,ZMD1菌株對(duì)金黃色葡萄球菌和煙草黑脛病病原具有明顯的抑菌圈(圖1a、b),說明其存在拮抗病原菌的活性物質(zhì)。故初步推斷ZMD1可能具有聚酮合成酶活性。2.2 ZMD1的PKS基因克隆驗(yàn)證
以ZMD1菌株的基因組DNA為模板,分別采用PKS-Ⅰ和PKS-Ⅱ的兼并引物進(jìn)行PKS基因的PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示,PKS-Ⅰ(圖2a)和PKS-Ⅱ(圖2b)均能擴(kuò)增出清晰的目標(biāo)產(chǎn)物條帶。將PCR產(chǎn)物進(jìn)行克隆測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與GenBank中已知PKS序列進(jìn)行比對(duì),測(cè)序獲得的PKS-Ⅰ和PKS-Ⅱ與其他種PKS序列的相似度都超過95%,故確定ZMD1菌株含有PKS基因功能。2.3 ZMD1菌株的鑒定
本文編號(hào):3138237
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(07)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
ZMD1的N-J系統(tǒng)發(fā)育樹
采用紙片法考察ZMD1菌株對(duì)金黃色葡萄球菌和煙草黑脛病病原的抗菌活性。試驗(yàn)結(jié)果表明,ZMD1菌株對(duì)金黃色葡萄球菌和煙草黑脛病病原具有明顯的抑菌圈(圖1a、b),說明其存在拮抗病原菌的活性物質(zhì)。故初步推斷ZMD1可能具有聚酮合成酶活性。2.2 ZMD1的PKS基因克隆驗(yàn)證
以ZMD1菌株的基因組DNA為模板,分別采用PKS-Ⅰ和PKS-Ⅱ的兼并引物進(jìn)行PKS基因的PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示,PKS-Ⅰ(圖2a)和PKS-Ⅱ(圖2b)均能擴(kuò)增出清晰的目標(biāo)產(chǎn)物條帶。將PCR產(chǎn)物進(jìn)行克隆測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與GenBank中已知PKS序列進(jìn)行比對(duì),測(cè)序獲得的PKS-Ⅰ和PKS-Ⅱ與其他種PKS序列的相似度都超過95%,故確定ZMD1菌株含有PKS基因功能。2.3 ZMD1菌株的鑒定
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