柑橘CAMTA基因家族的鑒定與功能的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-25 14:57
柑橘是重要的經(jīng)濟(jì)型水果作物之一,在全世界范圍內(nèi)廣泛種植。我國(guó)柑橘栽培歷史悠久,種類繁多,是世界柑橘生產(chǎn)與消費(fèi)大國(guó)。在南方地區(qū)柑橘產(chǎn)業(yè)已成為農(nóng)民增收致富的支柱產(chǎn)業(yè),對(duì)于當(dāng)?shù)亟?jīng)濟(jì)有著重要的推動(dòng)作用。近年來,我國(guó)柑橘產(chǎn)業(yè)雖然取得了巨大的發(fā)展,但各種生物和非生物逆境嚴(yán)重影響其產(chǎn)量與品質(zhì)。因此,培育抗逆性強(qiáng)的柑橘品種至關(guān)重要。然而,常規(guī)育種存在多種局限和困難,難以在短時(shí)間內(nèi)獲得良好的抗性品種。利用基因工程技術(shù)將一些重要的抗性基因轉(zhuǎn)入柑橘是獲得抗性品種最為高效和快捷的途徑。這就要求深入挖掘和利用柑橘抗性相關(guān)功能基因。CAMTA(calmodulin-binding transcription activator)轉(zhuǎn)錄因子是一類鈣調(diào)素結(jié)合蛋白,廣泛存在于多細(xì)胞真核生物中,在植物逆境脅迫應(yīng)答過程中發(fā)揮著十分重要的作用。然而,在柑橘中迄今未見有對(duì)這個(gè)家族的系統(tǒng)報(bào)道。本文基于克里曼丁和甜橙基因組(http://www.phytozome.net),首次對(duì)柑橘CAMTA成員進(jìn)行了系統(tǒng)鑒定,分析了各成員的基因結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系及其在不同組織和逆境處理下的表達(dá)模式等。構(gòu)建CitCAMTA8和CitCAMTA9過...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
植物CAMTA參與激素和環(huán)境脅迫調(diào)控的網(wǎng)絡(luò)圖
普通煙草(Nicotiana tabacum)有13個(gè)(Kakar Kaleem U等,2018),菜豆(Phaseolusvulgaris L.)有8個(gè)(Büyük lker等,2019)。為了了解各植物CAMTA成員之間的遺傳進(jìn)化關(guān)系,利用不同植物的CAMTA成員構(gòu)建了NJ進(jìn)化樹(圖1-3)。結(jié)果表明,所有CAMTAs大致聚類形成6個(gè)分支(不同的顏色標(biāo)記),在不同分支中均含有來自不同植物的CAMTA成員,表明單子葉和雙子葉植物的CAMTA起源同祖先,并在進(jìn)化過程中非常保守。圖 1-3 不同植物中 CAMTAs 的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系Figure 1-3 Phylogenetic relationships of CAMTAs in different plants擬南芥CAMTA3是功能研究的最深入的成員,其通過直接調(diào)控EDS1、NDR1和EIN3基因的表達(dá),既參與SA介導(dǎo)的抗病信號(hào)途徑,也參與乙烯信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑。在進(jìn)化樹中油菜BnaA04g12770D和BnaC04g34700D與AtCAMTA3有最近的遺傳距
第 3 章 柑橘 CAMTA 的鑒定與生物信息學(xué)分析有典型的 CaMBD 結(jié)構(gòu)域。此外,CitCAMTA2、3、5、和 6 都包含 CG-1 結(jié)構(gòu)域、TIG 結(jié)構(gòu)域、ANK 重復(fù)序列以及 IQ 基序;CitCAMTA4 和 7 都含有 CG-1 結(jié)構(gòu)域;CitCAMTA8 擁有一個(gè) IQ 基序;然而,CitCAMTA9 卻不含其它蛋白結(jié)構(gòu)域。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國(guó)柑橘生產(chǎn)現(xiàn)狀及未來發(fā)展預(yù)測(cè)[J]. 沈兆敏. 果農(nóng)之友. 2019(02)
[2]轉(zhuǎn)香樟CcCBFs煙草的抗逆性分析[J]. 王建格,周嬋,張佳佳,朱逢玲,焦曉琳,杜麗. 園藝學(xué)報(bào). 2018(10)
[3]水楊酸介導(dǎo)植物抗病的研究進(jìn)展[J]. 汪尚,徐鷺芹,張亞仙,曾后清,杜立群. 植物生理學(xué)報(bào). 2016(05)
[4]紫花苜蓿NAC類轉(zhuǎn)錄因子基因MsNAC2的克隆及其功能分析[J]. 申玉華,徐振軍,唐立紅,楊曉坡,黃文婕,武小斌,張文波. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(15)
[5]植物鈣調(diào)素結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子CAMTA/SR功能的研究進(jìn)展[J]. 曾后清,王國(guó)平,王慧中,林金星,杜立群. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(05)
[6]基于芯片數(shù)據(jù)的煙草qRT-PCR內(nèi)參基因鑒定與驗(yàn)證[J]. 王燃,許亞龍,李澤鋒,盧鵬,孟利軍,曹培健. 煙草科技. 2015(02)
[7]植物應(yīng)答低溫脅迫的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究進(jìn)展[J]. 劉輝,李德軍,鄧治. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(18)
[8]植物具IQ基序的鈣調(diào)素結(jié)合蛋白的研究進(jìn)展[J]. 田長(zhǎng)恩,周玉萍. 植物學(xué)報(bào). 2013(04)
[9]Salicylic Acid and its Function in Plant Immunity[J]. Chuanfu An and Zhonglin Mou Department of Microbiology and Cell Science,University of Florida,Gainesville,FL 32611,USA. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(06)
[10]植物非生物脅迫應(yīng)答的分子機(jī)制[J]. 楊獻(xiàn)光,梁衛(wèi)紅,齊志廣,馬聞師,沈銀柱. 麥類作物學(xué)報(bào). 2006(06)
博士論文
[1]分裂源激活蛋白二激酶、鈣調(diào)蛋白結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子、NADPH氧化酶和腺苷同型半胱氨酸水解酶在番茄抗病抗逆反應(yīng)中的功能研究[D]. 李小輝.浙江大學(xué) 2014
[2]小麥TaASR1基因克隆及抗逆功能研究[D]. 胡偉.華中科技大學(xué) 2013
碩士論文
[1]TaCAMTA4在小麥與葉銹菌互作過程中的功能研究及其調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 牛笑南.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]番茄SR/CAMTA轉(zhuǎn)錄因子家族基因SlSR4的克隆與功能研究[D]. 褚桂花.重慶大學(xué) 2015
[3]油菜CAMTA1參與冷脅迫應(yīng)答的功能研究[D]. 王晴晴.華中師范大學(xué) 2013
本文編號(hào):3099871
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
植物CAMTA參與激素和環(huán)境脅迫調(diào)控的網(wǎng)絡(luò)圖
普通煙草(Nicotiana tabacum)有13個(gè)(Kakar Kaleem U等,2018),菜豆(Phaseolusvulgaris L.)有8個(gè)(Büyük lker等,2019)。為了了解各植物CAMTA成員之間的遺傳進(jìn)化關(guān)系,利用不同植物的CAMTA成員構(gòu)建了NJ進(jìn)化樹(圖1-3)。結(jié)果表明,所有CAMTAs大致聚類形成6個(gè)分支(不同的顏色標(biāo)記),在不同分支中均含有來自不同植物的CAMTA成員,表明單子葉和雙子葉植物的CAMTA起源同祖先,并在進(jìn)化過程中非常保守。圖 1-3 不同植物中 CAMTAs 的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系Figure 1-3 Phylogenetic relationships of CAMTAs in different plants擬南芥CAMTA3是功能研究的最深入的成員,其通過直接調(diào)控EDS1、NDR1和EIN3基因的表達(dá),既參與SA介導(dǎo)的抗病信號(hào)途徑,也參與乙烯信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑。在進(jìn)化樹中油菜BnaA04g12770D和BnaC04g34700D與AtCAMTA3有最近的遺傳距
第 3 章 柑橘 CAMTA 的鑒定與生物信息學(xué)分析有典型的 CaMBD 結(jié)構(gòu)域。此外,CitCAMTA2、3、5、和 6 都包含 CG-1 結(jié)構(gòu)域、TIG 結(jié)構(gòu)域、ANK 重復(fù)序列以及 IQ 基序;CitCAMTA4 和 7 都含有 CG-1 結(jié)構(gòu)域;CitCAMTA8 擁有一個(gè) IQ 基序;然而,CitCAMTA9 卻不含其它蛋白結(jié)構(gòu)域。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國(guó)柑橘生產(chǎn)現(xiàn)狀及未來發(fā)展預(yù)測(cè)[J]. 沈兆敏. 果農(nóng)之友. 2019(02)
[2]轉(zhuǎn)香樟CcCBFs煙草的抗逆性分析[J]. 王建格,周嬋,張佳佳,朱逢玲,焦曉琳,杜麗. 園藝學(xué)報(bào). 2018(10)
[3]水楊酸介導(dǎo)植物抗病的研究進(jìn)展[J]. 汪尚,徐鷺芹,張亞仙,曾后清,杜立群. 植物生理學(xué)報(bào). 2016(05)
[4]紫花苜蓿NAC類轉(zhuǎn)錄因子基因MsNAC2的克隆及其功能分析[J]. 申玉華,徐振軍,唐立紅,楊曉坡,黃文婕,武小斌,張文波. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(15)
[5]植物鈣調(diào)素結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子CAMTA/SR功能的研究進(jìn)展[J]. 曾后清,王國(guó)平,王慧中,林金星,杜立群. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(05)
[6]基于芯片數(shù)據(jù)的煙草qRT-PCR內(nèi)參基因鑒定與驗(yàn)證[J]. 王燃,許亞龍,李澤鋒,盧鵬,孟利軍,曹培健. 煙草科技. 2015(02)
[7]植物應(yīng)答低溫脅迫的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究進(jìn)展[J]. 劉輝,李德軍,鄧治. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(18)
[8]植物具IQ基序的鈣調(diào)素結(jié)合蛋白的研究進(jìn)展[J]. 田長(zhǎng)恩,周玉萍. 植物學(xué)報(bào). 2013(04)
[9]Salicylic Acid and its Function in Plant Immunity[J]. Chuanfu An and Zhonglin Mou Department of Microbiology and Cell Science,University of Florida,Gainesville,FL 32611,USA. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(06)
[10]植物非生物脅迫應(yīng)答的分子機(jī)制[J]. 楊獻(xiàn)光,梁衛(wèi)紅,齊志廣,馬聞師,沈銀柱. 麥類作物學(xué)報(bào). 2006(06)
博士論文
[1]分裂源激活蛋白二激酶、鈣調(diào)蛋白結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子、NADPH氧化酶和腺苷同型半胱氨酸水解酶在番茄抗病抗逆反應(yīng)中的功能研究[D]. 李小輝.浙江大學(xué) 2014
[2]小麥TaASR1基因克隆及抗逆功能研究[D]. 胡偉.華中科技大學(xué) 2013
碩士論文
[1]TaCAMTA4在小麥與葉銹菌互作過程中的功能研究及其調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 牛笑南.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]番茄SR/CAMTA轉(zhuǎn)錄因子家族基因SlSR4的克隆與功能研究[D]. 褚桂花.重慶大學(xué) 2015
[3]油菜CAMTA1參與冷脅迫應(yīng)答的功能研究[D]. 王晴晴.華中師范大學(xué) 2013
本文編號(hào):3099871
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3099871.html
最近更新
教材專著