柔性區(qū)域順式肽鍵發(fā)生率影響蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-16 10:50
蛋白質(zhì)的熱穩(wěn)定性不僅與氫鍵、二硫鍵、離子鍵、疏水作用等分子間的相互作用和其周?chē)h(huán)境有關(guān),還涉及到蛋白質(zhì)的折疊與解折疊過(guò)程,而影響蛋白質(zhì)折疊與解折疊過(guò)程的重要因素之一是蛋白質(zhì)的剛性與柔性區(qū)域的結(jié)構(gòu),因此增強(qiáng)蛋白質(zhì)柔性區(qū)域的剛性有可能阻礙升溫過(guò)程造成的蛋白質(zhì)解折疊的過(guò)程,從而提高蛋白質(zhì)對(duì)溫度的耐受性。組成蛋白質(zhì)的肽鍵類型分為順式肽鍵和反式肽鍵,順式肽鍵呈現(xiàn)出天然的彎折結(jié)構(gòu),可能在蛋白質(zhì)內(nèi)部應(yīng)力減弱或消失時(shí)維持其結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。研究發(fā)現(xiàn)天然的蛋白質(zhì)雖然在大多數(shù)情況下呈現(xiàn)出反式構(gòu)象,但是理化、生物、遺傳等因素可能會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)生物合成過(guò)程中發(fā)生氨基酸替換,從而導(dǎo)致蛋白質(zhì)中肽鍵的順?lè)串悩?gòu)改變。另外,蛋白質(zhì)順?lè)串悩?gòu)的過(guò)程不是一個(gè)靜態(tài)的過(guò)程,而動(dòng)態(tài)過(guò)程難以觀測(cè),目前缺乏科學(xué)的方法測(cè)定順?lè)串悩?gòu)對(duì)蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性的影響。結(jié)合上述理論研究,可以推測(cè)在蛋白質(zhì)的柔性區(qū)域中引入順式肽鍵可能提高蛋白質(zhì)的熱穩(wěn)定性,這一推論尚且缺乏證據(jù)證明;趯(duì)蛋白質(zhì)順?lè)串悩?gòu)過(guò)程的研究,本論文提出了順式肽鍵發(fā)生率(ICPB)的概念,并用順式肽鍵發(fā)生率來(lái)描述蛋白質(zhì)順?lè)串悩?gòu)動(dòng)態(tài)過(guò)程的結(jié)果。研究表明ICPB通常取決于蛋白質(zhì)翻譯后修飾、分子伴侶...
【文章來(lái)源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
氫鍵的作用機(jī)制[18]
肽鍵結(jié)合的兩種構(gòu)象[140]
N-酰基-脯氨酸片段的順?lè)串悩?gòu)化[174]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用脯氨酸效應(yīng)提高短乳桿菌谷氨酸脫羧酶的熱穩(wěn)定性[J]. 方卉,呂常江,花雨嬌,胡升,趙偉睿,方文姬,宋奎,黃俊,梅樂(lè)和. 生物工程學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]米根霉α-淀粉酶熱穩(wěn)定性的理性設(shè)計(jì)[J]. 楊倩,湯斌,李松. 生物工程學(xué)報(bào). 2018(07)
[3]氨基酸殘基在蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性機(jī)制中的研究進(jìn)展[J]. 易弋,韋陽(yáng)道,鄧春,伍時(shí)華. 廣西科技大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]通過(guò)蛋白質(zhì)序列比對(duì)探討細(xì)菌的熱適應(yīng)機(jī)制[J]. 張健,張琳,王維. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(21)
[5]磷酸化對(duì)多肽中Xaa-Pro片段肽脯酰胺鍵順?lè)串悩?gòu)的影響研究(英文)[J]. 朱振泰,孫命,郭燕婷,李艷梅. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2007(06)
[6]嗜熱與嗜常溫微生物的蛋白質(zhì)氨基酸組成比較[J]. 盧柏松,王國(guó)力,黃培堂. 微生物學(xué)報(bào). 1998(01)
博士論文
[1]蛋白質(zhì)分子結(jié)合折疊與構(gòu)象轉(zhuǎn)變的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D]. 尚旭.吉林大學(xué) 2018
[2]涉及結(jié)合的生物分子構(gòu)象轉(zhuǎn)變的理論研究[D]. 劉飛.吉林大學(xué) 2017
[3]蛋白質(zhì)折疊/解折疊研究[D]. 譚翠燕.中國(guó)科學(xué)院研究生院(上海生命科學(xué)研究院) 2007
本文編號(hào):3085923
【文章來(lái)源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
氫鍵的作用機(jī)制[18]
肽鍵結(jié)合的兩種構(gòu)象[140]
N-酰基-脯氨酸片段的順?lè)串悩?gòu)化[174]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用脯氨酸效應(yīng)提高短乳桿菌谷氨酸脫羧酶的熱穩(wěn)定性[J]. 方卉,呂常江,花雨嬌,胡升,趙偉睿,方文姬,宋奎,黃俊,梅樂(lè)和. 生物工程學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]米根霉α-淀粉酶熱穩(wěn)定性的理性設(shè)計(jì)[J]. 楊倩,湯斌,李松. 生物工程學(xué)報(bào). 2018(07)
[3]氨基酸殘基在蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性機(jī)制中的研究進(jìn)展[J]. 易弋,韋陽(yáng)道,鄧春,伍時(shí)華. 廣西科技大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]通過(guò)蛋白質(zhì)序列比對(duì)探討細(xì)菌的熱適應(yīng)機(jī)制[J]. 張健,張琳,王維. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(21)
[5]磷酸化對(duì)多肽中Xaa-Pro片段肽脯酰胺鍵順?lè)串悩?gòu)的影響研究(英文)[J]. 朱振泰,孫命,郭燕婷,李艷梅. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2007(06)
[6]嗜熱與嗜常溫微生物的蛋白質(zhì)氨基酸組成比較[J]. 盧柏松,王國(guó)力,黃培堂. 微生物學(xué)報(bào). 1998(01)
博士論文
[1]蛋白質(zhì)分子結(jié)合折疊與構(gòu)象轉(zhuǎn)變的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究[D]. 尚旭.吉林大學(xué) 2018
[2]涉及結(jié)合的生物分子構(gòu)象轉(zhuǎn)變的理論研究[D]. 劉飛.吉林大學(xué) 2017
[3]蛋白質(zhì)折疊/解折疊研究[D]. 譚翠燕.中國(guó)科學(xué)院研究生院(上海生命科學(xué)研究院) 2007
本文編號(hào):3085923
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