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柔性區(qū)域順式肽鍵發(fā)生率影響蛋白質熱穩(wěn)定性的研究

發(fā)布時間:2021-03-16 10:50
  蛋白質的熱穩(wěn)定性不僅與氫鍵、二硫鍵、離子鍵、疏水作用等分子間的相互作用和其周圍環(huán)境有關,還涉及到蛋白質的折疊與解折疊過程,而影響蛋白質折疊與解折疊過程的重要因素之一是蛋白質的剛性與柔性區(qū)域的結構,因此增強蛋白質柔性區(qū)域的剛性有可能阻礙升溫過程造成的蛋白質解折疊的過程,從而提高蛋白質對溫度的耐受性。組成蛋白質的肽鍵類型分為順式肽鍵和反式肽鍵,順式肽鍵呈現出天然的彎折結構,可能在蛋白質內部應力減弱或消失時維持其結構的穩(wěn)定性。研究發(fā)現天然的蛋白質雖然在大多數情況下呈現出反式構象,但是理化、生物、遺傳等因素可能會導致蛋白質生物合成過程中發(fā)生氨基酸替換,從而導致蛋白質中肽鍵的順反異構改變。另外,蛋白質順反異構的過程不是一個靜態(tài)的過程,而動態(tài)過程難以觀測,目前缺乏科學的方法測定順反異構對蛋白質熱穩(wěn)定性的影響。結合上述理論研究,可以推測在蛋白質的柔性區(qū)域中引入順式肽鍵可能提高蛋白質的熱穩(wěn)定性,這一推論尚且缺乏證據證明;趯Φ鞍踪|順反異構過程的研究,本論文提出了順式肽鍵發(fā)生率(ICPB)的概念,并用順式肽鍵發(fā)生率來描述蛋白質順反異構動態(tài)過程的結果。研究表明ICPB通常取決于蛋白質翻譯后修飾、分子伴侶... 

【文章來源】:西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數】:82 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

柔性區(qū)域順式肽鍵發(fā)生率影響蛋白質熱穩(wěn)定性的研究


氫鍵的作用機制[18]

柔性區(qū)域順式肽鍵發(fā)生率影響蛋白質熱穩(wěn)定性的研究


肽鍵結合的兩種構象[140]

柔性區(qū)域順式肽鍵發(fā)生率影響蛋白質熱穩(wěn)定性的研究


N-;-脯氨酸片段的順反異構化[174]

【參考文獻】:
期刊論文
[1]利用脯氨酸效應提高短乳桿菌谷氨酸脫羧酶的熱穩(wěn)定性[J]. 方卉,呂常江,花雨嬌,胡升,趙偉睿,方文姬,宋奎,黃俊,梅樂和.  生物工程學報. 2019(04)
[2]米根霉α-淀粉酶熱穩(wěn)定性的理性設計[J]. 楊倩,湯斌,李松.  生物工程學報. 2018(07)
[3]氨基酸殘基在蛋白質熱穩(wěn)定性機制中的研究進展[J]. 易弋,韋陽道,鄧春,伍時華.  廣西科技大學學報. 2015(04)
[4]通過蛋白質序列比對探討細菌的熱適應機制[J]. 張健,張琳,王維.  安徽農業(yè)科學. 2011(21)
[5]磷酸化對多肽中Xaa-Pro片段肽脯酰胺鍵順反異構的影響研究(英文)[J]. 朱振泰,孫命,郭燕婷,李艷梅.  生物化學與生物物理進展. 2007(06)
[6]嗜熱與嗜常溫微生物的蛋白質氨基酸組成比較[J]. 盧柏松,王國力,黃培堂.  微生物學報. 1998(01)

博士論文
[1]蛋白質分子結合折疊與構象轉變的分子動力學模擬研究[D]. 尚旭.吉林大學 2018
[2]涉及結合的生物分子構象轉變的理論研究[D]. 劉飛.吉林大學 2017
[3]蛋白質折疊/解折疊研究[D]. 譚翠燕.中國科學院研究生院(上海生命科學研究院) 2007



本文編號:3085923

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