滇中高原湖泊是我國五大湖泊類型之一,其生境特殊,高海拔、低緯度,湖泊徑流少,且湖泊相互孤立,魚類區(qū)系簡單、物種分化強(qiáng)烈,是國內(nèi)外研究的熱點(diǎn)之一。目前,高原湖泊魚類生物多樣性監(jiān)測,主要采用人工捕撈和漁民訪查等方法,費(fèi)時費(fèi)力,尤其在瀕危魚類種群數(shù)量較低時,數(shù)據(jù)可靠性不高。環(huán)境DNA結(jié)合高通量條形碼技術(shù)可以對物種進(jìn)行快速鑒定。前人研究表明,環(huán)境DNA結(jié)合高通量條形碼技術(shù)可以用于水環(huán)境生物多樣性監(jiān)測,但該方法是否適用于高原湖泊這一特殊生境,目前還未見報(bào)道。環(huán)境DNA指的是生物體的DNA通過生物體分泌的毛屑、脫落細(xì)胞、排泄物、粘液等釋放到環(huán)境中的DNA片段。本研究以滇中高原的撫仙湖、星云湖、陽宗海、滇池為研究區(qū)域,利用環(huán)境DNA結(jié)合高通量條形碼技術(shù)研究魚類生物多樣性,探索該技術(shù)在高原湖泊特殊生境中的水生生物多樣性監(jiān)測的適用性。本研究的目標(biāo)包括:1)將環(huán)境DNA結(jié)合高通量條形碼技術(shù)用于滇中高原湖泊魚類生物多樣性監(jiān)測,并對流程進(jìn)行優(yōu)化;2)利用環(huán)境DNA技術(shù)的數(shù)據(jù),推斷四個高原湖泊的魚類生物多樣性,結(jié)合采樣路線來繪制物種分布圖,并與歷史文獻(xiàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較。本研究于2018年7月在撫仙湖、陽宗海、滇池和... 

【文章來源】：云南大學(xué)云南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：101 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 前言
    1.1 高原湖泊的魚類生物多樣性研究
        1.1.1 生物多樣性概述
        1.1.2 云南高原湖泊魚類生物多樣性面臨的威脅
        1.1.3 魚類生物多樣性研究的方法
    1.2 環(huán)境DNA技術(shù)
        1.2.1 環(huán)境DNA技術(shù)概述
        1.2.2 環(huán)境DNA技術(shù)在水生環(huán)境中的應(yīng)用
    1.3 DNA高通量條形碼技術(shù)
        1.3.1 DNA條形碼
        1.3.2 DNA高通量條形碼概述
        1.3.3 DNA高通量條形碼技術(shù)的應(yīng)用
    1.4 科學(xué)問題
    1.5 研究目的和意義
        1.5.1 研究目的
        1.5.2 研究意義
    1.6 技術(shù)路線
2 實(shí)驗(yàn)材料與研究方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)湖泊概況
    2.2 湖泊環(huán)境DNA樣品采樣
    2.3 實(shí)驗(yàn)研究方法
        2.3.1 環(huán)境DNA樣品的采集方法
        2.3.2 環(huán)境DNA提取
        2.3.3 環(huán)境DNA的定量
        2.3.4 環(huán)境DNA濃度稀釋
        2.3.5 環(huán)境DNA的PCR過程
        2.3.6 環(huán)境DNA的PCR產(chǎn)物混樣
        2.3.7 環(huán)境DNA技術(shù)的PCR產(chǎn)物純化
        2.3.8 環(huán)境DNA擴(kuò)增子建庫
    2.4 數(shù)據(jù)分析
        2.4.1 生物信息學(xué)分析
        2.4.2 4個湖泊的魚類多樣性分析
3 研究結(jié)果
    3.1 環(huán)境DNA技術(shù)的優(yōu)化
    3.2 4個湖泊環(huán)境DNA樣品的高通量測序結(jié)果
        3.2.1 環(huán)境DNA樣品的生物信息學(xué)分析結(jié)果
        3.2.2 測序樣本的注釋信息統(tǒng)計(jì)
    3.3 環(huán)境DNA技術(shù)對4個湖泊魚類的監(jiān)測
    3.4 環(huán)境DNA技術(shù)監(jiān)測與傳統(tǒng)監(jiān)測的比較
    3.5 環(huán)境DNA結(jié)合高通量條形碼評估4個湖泊的魚類多樣性
        3.5.1 土著魚類的監(jiān)測
        3.5.2 水質(zhì)對魚類多樣性的影響
        3.5.3 利用環(huán)境DNA高通量條形碼技術(shù)評估4個湖泊魚類豐度與分布
4 討論
    4.1 環(huán)境DNA技術(shù)的優(yōu)化
        4.1.1 環(huán)境DNA技術(shù)樣品采集優(yōu)化
        4.1.2 環(huán)境DNA技術(shù)PCR操作的優(yōu)化
        4.1.3 環(huán)境DNA技術(shù)引物優(yōu)化
    4.2 環(huán)境DNA技術(shù)的高通量測序
    4.3 環(huán)境DNA技術(shù)與傳統(tǒng)監(jiān)測技術(shù)的比較
    4.4 4個湖泊土著魚類
    4.5 環(huán)境DNA技術(shù)對滇中高原湖泊魚類多樣性監(jiān)測的適用性
5 結(jié)論
6 展望
附錄Ⅰ 環(huán)境DNA技術(shù)引物標(biāo)簽序列
附錄Ⅱ 環(huán)境DNA技術(shù)監(jiān)測到的魚類分類學(xué)信息統(tǒng)計(jì)表
附錄Ⅲ 環(huán)境DNA監(jiān)測到的魚類DNA序列
附錄Ⅳ 生物信息學(xué)分析腳本
參考文獻(xiàn)
碩士學(xué)位期間完成的科研成果
致謝



本文編號：3050424