短密木霉TriHy1基因重組蛋白對咪唑乙煙酸的降解作用
發(fā)布時間:2020-12-18 01:37
咪唑乙煙酸是我國雜草控制的重要農(nóng)藥之一,它是一種典型的長殘效除草劑。這種除草劑的缺點是它在土壤中會殘留很長一段時間,通常達2~3年,長的可達4年以上,難以降解。無論在輪作或是連作中使用咪唑乙煙酸,都很容易造成后茬作物的藥害,減少產(chǎn)量甚至絕產(chǎn)。木霉菌(Trichooerma)是目前最有效的生物防治真菌,近年它的防治效果和穩(wěn)定性得到了顯著提高,并且還對生物農(nóng)藥有防治效果。所以,篩選出具有抗化學(xué)農(nóng)藥的木霉菌,并對其降解農(nóng)藥的基因重組蛋白做降解效能評價,對于提高生物控制水平和減少環(huán)境污染是非常重要的。本試驗利用實驗室中已經(jīng)篩選出的大豆田環(huán)境下高效降解咪唑乙煙酸殘留的短密木霉菌種(T.brevicompactum),通過轉(zhuǎn)錄組測序,Unigene進行七大功能數(shù)據(jù)庫注釋(NR、NT、GO、KOG、KEGG、SwissPprot 和 InterPro),共有 7 個差異基因,分析出對降解咪唑乙煙酸有作用的目的基因,并成功克隆得到Triy1基因,編碼256個氨基酸,是疏水蛋白。通過BlastP預(yù)測其具有Hydrolase superfamily的保守區(qū)結(jié)構(gòu)域。熒光定量RT-qPCR方法分析,TriHH...
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2生物信息學(xué)注釋流程圖??
圖2月衡序列CO性釋瑰24CO翻
?7500?10000??Number?of?Genes??圖2-4?Nr序列GO注釋??Fig.2-4?GO?annotations?if?non-redundant?consenses?sequences???KOG?Function?Classification???Translation,?ribosomal?structure?and?biogenesis?862??1177??mechanisms?2325??Secondary?metabolites?biosynthesis,?transport?and?catabolism?684??RNA?processing?and?modification?1226??Replication,?recombination?repair?590??Posttranslationai?modification.?1854??Nucleotide?transport?and?metabolism?257??Nuclear?structure?387??Lipid?transport?and?metabolism?652??Intracellular?trafficking
本文編號:2923102
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2生物信息學(xué)注釋流程圖??
圖2月衡序列CO性釋瑰24CO翻
?7500?10000??Number?of?Genes??圖2-4?Nr序列GO注釋??Fig.2-4?GO?annotations?if?non-redundant?consenses?sequences???KOG?Function?Classification???Translation,?ribosomal?structure?and?biogenesis?862??1177??mechanisms?2325??Secondary?metabolites?biosynthesis,?transport?and?catabolism?684??RNA?processing?and?modification?1226??Replication,?recombination?repair?590??Posttranslationai?modification.?1854??Nucleotide?transport?and?metabolism?257??Nuclear?structure?387??Lipid?transport?and?metabolism?652??Intracellular?trafficking
本文編號:2923102
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