蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)必須要借助一個(gè)引導(dǎo)通道來(lái)完成,該引導(dǎo)通道稱為易位子(Sec)。Sec輔助新生肽插入到膜中或分泌到膜外的過(guò)程,是所有生物細(xì)胞中普遍存在且必不可少的。真核細(xì)胞中的易位子是Sec61,該分子是一個(gè)由α,β和γ三個(gè)亞基組成的三聚體,Sec61α亞基是由10個(gè)跨膜(transmembrane,TM)螺旋構(gòu)成的一個(gè)通道結(jié)構(gòu),其中TM2和TM7螺旋構(gòu)成了一個(gè)側(cè)門。在Sec61α通道中,如果新生肽是整合膜蛋白,則側(cè)門打開,允許其通過(guò)側(cè)門插入到膜中,否則側(cè)門不打開,新生肽被分泌到膜外。在插入過(guò)程中,Sec61α通道結(jié)構(gòu)的變化對(duì)新生肽的膜插入和維持膜的滲透性屏障至關(guān)重要。近些年來(lái),雖然對(duì)Sec61α通道結(jié)構(gòu)的研究已取得一些進(jìn)展,但對(duì)Sec61α通道構(gòu)象轉(zhuǎn)變過(guò)程中,結(jié)構(gòu)恢復(fù)能力,側(cè)門、孔環(huán)、栓塞間的聯(lián)動(dòng)機(jī)制仍不清楚。闡明Sec61α通道輔助蛋白質(zhì)插入膜過(guò)程的分子機(jī)制一直是生物化學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。由于實(shí)驗(yàn)手段所限,計(jì)算機(jī)模擬成為該領(lǐng)域研究的有力工具。此外,Sec61α輔助蛋白質(zhì)進(jìn)行膜插入過(guò)程需要很多相關(guān)分子共同完成,膜插入過(guò)程極其復(fù)雜,其時(shí)空尺度跨度很大,傳統(tǒng)的全原子模擬不能達(dá)到此過(guò)程所需的時(shí)空尺... 

【文章來(lái)源】：廣西民族大學(xué)廣西壯族自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】：68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

細(xì)胞膜的結(jié)構(gòu).

圖 1-2 載體蛋白和通道蛋白運(yùn)輸機(jī)制示意圖[4].1.1.1 離子通道和水通道目前發(fā)現(xiàn)的通道蛋白已經(jīng)有 100 多種。離子通道（ion channel）位于細(xì)胞膜上，是由

圖 1-3 TM 螺旋插入膜的過(guò)程示意圖[15].位的機(jī)制需要知道 Sec 結(jié)構(gòu)的詳細(xì)信息。Hanein[20]n[24]等人通過(guò)單顆粒電子顯微鏡獲得低分辨率分離的結(jié)合的復(fù)合物結(jié)構(gòu)。Breyton[25]等人根據(jù)二維晶體的電

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]介觀模擬研究溫度對(duì)DPPC磷脂雙層膜結(jié)構(gòu)的影響[J]. 尹倩倩,史新元,丁海歐,戴幸星,喬延江.  計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué). 2015(05)
[2]蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法簡(jiǎn)述[J]. 靳利霞,唐煥文.  自然雜志. 2001(04)

博士論文
[1]分子動(dòng)力學(xué)模擬在幾類重要蛋白研究中的應(yīng)用[D]. 吳云劍.吉林大學(xué) 2014
[2]一類非平衡分子動(dòng)力學(xué)模擬中優(yōu)化方法的研究[D]. 楊坤.大連理工大學(xué) 2009

碩士論文
[1]新型多肽基人工離子通道的設(shè)計(jì)、合成及性質(zhì)研究[D]. 譚思.河南師范大學(xué) 2017



本文編號(hào)：2901469