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星星草PutACBP1基因的克隆及其功能分析

發(fā)布時間:2020-10-21 20:38
   ;o酶A結(jié)合蛋白(Acyl-CoA-bindingproteins,ACBPs)是一類脂類載體蛋白,具有結(jié)合和運輸脂類物質(zhì)的功能,在植物生長發(fā)育和逆境(低溫、氧化、干旱和重金屬)應(yīng)答調(diào)控過程中發(fā)揮了重要作用。但其在植物鹽堿脅迫應(yīng)答中的作用未見報道。星星草(Puccinellia tenuiflora 是一種單子葉禾本科鹽生植物,是研究植物鹽堿應(yīng)答機制的理想模式植物。本研究,利用分子遺傳學(xué)技術(shù)從星星草中克隆到PutACBP1基因,其開放閱讀框為981 bp,編碼326個氨基酸。PutACBPl是ACBP家族Class II亞族的成員之一,含有一個ACB結(jié)構(gòu)域和Ankyrin結(jié)構(gòu)域。熒光定量PCR分析表明,PutACBP1基因在星星草根、莖、葉、葉鞘、花、穗和種子均有表達(dá),在葉中的表達(dá)量最高,在莖中表達(dá)量最低。在逆境(200 mmol/L NaCl、100 mmol/L NaHCO3、75 mmol/L Na2C03 脅迫、160 μmol/L CdCl2、10 mmol/L H2O2 和 4℃)脅迫時,根和葉中的PutACBP1都受誘導(dǎo)表達(dá)。這暗示著PutACBP1可能參與了鹽堿、氧化、重金屬和低溫脅迫的應(yīng)答過程。煙草(Nicotiana tabacum L.)葉片細(xì)胞和擬南芥(Arabidopsis thaliana)葉片細(xì)胞中定位分析表明,正常條件下PutACBP1定位于在細(xì)胞質(zhì)。通過PutACBP1基因原核表達(dá)體系,誘導(dǎo)并純化到(His)6-PutACBP1融合蛋白,利用磷脂結(jié)合實驗初步證實了 PutACBP1具有與磷脂酰膽堿(Phosphatidylcholine,PC)結(jié)合的能力。通過構(gòu)建pBI121-PutACBP1重組質(zhì)粒,并利用農(nóng)桿菌侵染法分別獲得PutACBP1過表達(dá)擬南芥植株。對轉(zhuǎn)PutACBP1基因擬南芥植株的耐鹽性分析表明,在100 mmol/L和125 mmol/L NaCl脅迫下,過表達(dá)PutACBP1基因擬南芥的根長和鮮重都優(yōu)于野生型擬南芥。擬南芥同源基因AtACBP2突變體植株(SALK-023077)的耐鹽性分析表明,在100 mmol/L和125 mmol/L NaCl脅迫下,突變體擬南芥植株的根長和鮮重都低于野生型擬南芥。綜上所述,在逆境應(yīng)答過程中,PutACBP1對于植物鹽脅迫應(yīng)答具有正調(diào)控作用。同時PutACBP1可能通過與磷脂酰膽堿結(jié)合調(diào)控其運輸?shù)劫|(zhì)膜,參與植物的脂類代謝。這些結(jié)果為深入研究星星草PuACBP1基因鹽堿應(yīng)答分子調(diào)控機理提供了新的證據(jù)。
【學(xué)位單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:Q943.2
【部分圖文】:

測序,基因,星星草,酶切鑒定


1.?PwMC及Pi基因cDNA全長擴増??以星星草葉片cDNA為模板,用PutACBPl-F、PutACBPl-R引物進(jìn)行PCR擴增,得??到1000?bp左右的片段(圖3-1)。經(jīng)過連接與轉(zhuǎn)化,得到重組質(zhì)粒,經(jīng)過雙酶切鑒定后??進(jìn)行測序(圖3-2)。測序結(jié)果所示,ORF包括981?bp,編碼326個氨基酸(圖3-3)。??M?1??2000bp??looobp?mrn_^imh^??■??圖3-1?Pi/MCSW基因全長cDNA的PCR擴增??M:Marker?DL2000;?l.PCR?擴增的?PutACBPl?基因全長??Fig.?3-1?PCR?product?of?PutACBPl?full?length?cDNA??M:Marker?DL2000;?1.?PCR?product?of?PutACBPl??M,?1?2?3?4?M2??…「?'翻??3000bpHuK<?壩??2〇〇〇hpfe-?」Ml)hP??議?;?I:'?:;?I??圖?3-2?酶切鑒定?pEASY-Blunt-P?MC^W??Mi:Marker?DL5000;?M2:Marker?DL2000;?1-4.PCR?擴增的?尸7?基因

氨基酸序列,蛋白結(jié)構(gòu)


961?TTCATGAACCTGGCTAACTGA??321?F?\!?N?LAN*??圖3-3?PwMCMJ基因及其編碼的氨基酸序列??Fig.3-3?ORF?of?PutACBPl?and?the?amino?acid?sequence??2.?基因全長的核苷酸序列分析??利用protparam軟件分析,cDNA基因全長981b?bp,含有326個氨基酸殘基的蛋白??質(zhì),PutACBPl蛋白分子式為C2845H47iiN981O1160S296,蛋白分子量為80709.34Da,理論等??電點為5.01。不穩(wěn)定系數(shù)為51.16,屬于不穩(wěn)定蛋白。利用軟件SMART(http://smart.embl-??heidelberg.de/)分析表明該蛋白質(zhì)含有一個ACB結(jié)構(gòu)域和一個ANK結(jié)構(gòu)域(圖3-4A)。??利用軟件TMHMM?(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)對該蛋白質(zhì)預(yù)測跨膜結(jié)構(gòu)

東北林業(yè)大學(xué),碩士學(xué)位論文,氮基,序列比對


?東北林業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文???10?20?30?40?50?0?70?80?SO??.|?|?|?|?|?|?-?■?■?■?I???.?■?-?|?I?....?I?|?I?-???■?.?I?....?I?....?I?....?I?....?I?....?I??
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本文編號:2850571

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