組蛋白H3K14乙;{(diào)控紫色紫孢菌生長和產(chǎn)孢的機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2020-08-10 19:09
【摘要】:紫色紫孢菌(Purpreocillium lavendulum)是目前已實(shí)現(xiàn)商品化的線蟲生防真菌。本研究以紫色紫孢菌Ku80敲除菌株為出發(fā)菌株,首先利用同源重組的方法對(duì)組蛋白H3K14位點(diǎn)進(jìn)行點(diǎn)突變,同時(shí)敲除修飾組蛋白H3K14乙;慕M蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶gcn5,之后對(duì)Ku8K敲除菌株和各突變株的生長和產(chǎn)孢進(jìn)行測定和比較,并結(jié)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和基因功能分析等方法研究組蛋白H3K14乙;{(diào)控紫色紫孢菌的生長和產(chǎn)孢的機(jī)制。通過以上研究可以初步闡明組蛋白修飾調(diào)控紫色紫孢菌產(chǎn)孢的分子機(jī)制。主要研究結(jié)果如下:1.獲得H3K14突變菌株首先獲得H3K14位點(diǎn)突變成R和Q的H3片段,然后酶切質(zhì)粒H3-3'-pPK2-sur-GFP,經(jīng)過In-fusion酶連接將突變片段連接到sur基因的另一端。將構(gòu)建好的突變載體通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化紫色紫孢菌Ku80菌株,用氯啼磺隆篩選轉(zhuǎn)化子,通過測序和Western blot的方法對(duì)轉(zhuǎn)化子進(jìn)行驗(yàn)證。2.獲得gcn5敲除菌株首先酶切質(zhì)粒pPK2-sur-GFP,然后經(jīng)過In-fusion酶連接將gcn5上下游同源片段連接到sur基因的兩端。將構(gòu)建好的敲除載體通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化紫色紫孢菌Ku80菌株,用氯嘧磺隆篩選轉(zhuǎn)化子,通過PCR等方法對(duì)轉(zhuǎn)化子進(jìn)行驗(yàn)證。3.突變株和敲除株的生長和產(chǎn)孢受到影響Ku80菌株的孢子形成能力相對(duì)高于突變株和敲除株。在所研究培養(yǎng)基上,除PDA培養(yǎng)基外,H3K14Q突變株和gcn5敲除株與Ku80菌株相比生長速度均降低。然而,在PDA培養(yǎng)基上,H3K14R突變株的生長速度相對(duì)高于Ku80菌株,并且在其它培養(yǎng)基上沒有顯著變化。4.各突變株和敲除株的轉(zhuǎn)錄組分析組蛋白的翻譯后修飾會(huì)影響染色質(zhì)的結(jié)構(gòu),從而會(huì)影響基因的表達(dá)[2]。不管是H3K14R突變株還是H3K14Q突變株,或者是gcn5敲除株,與Ku80菌株相比,組蛋白H3K14的乙酰化水平均處于異常狀態(tài)。這種非正常的乙酰化或者去乙;癄顟B(tài)將會(huì)影響紫色紫孢菌的一些生長和產(chǎn)孢相關(guān)基因,從而導(dǎo)致H3K14Q突變株和gcn5敲除株的生長和孢子形成能力的降低,以及H3K14R突變株產(chǎn)孢能力的降低。為了在不同菌株中發(fā)現(xiàn)這些受影響的生長和孢子形成相關(guān)基因,分析了上述的表型,確定樣品收集的時(shí)間點(diǎn),將Ku80菌株和各轉(zhuǎn)化子的樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析比較。對(duì)表型有明顯差異的菌株之間的差異基因進(jìn)行分析,找出依賴表觀遺傳修飾的代謝相關(guān)基因。本論文的主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn):真菌在營養(yǎng)匱乏的環(huán)境中停止生長并產(chǎn)孢是其重要的生存策略,從表觀遺傳調(diào)控的角度探討?zhàn)囸I誘導(dǎo)真菌生活史轉(zhuǎn)化的分子機(jī)理并未見報(bào)道,本研究從組蛋白H3K14突變體出發(fā),通過篩選PDA中營養(yǎng)脅迫的營養(yǎng)物質(zhì),結(jié)合轉(zhuǎn)錄組分析和突變體庫篩選等方法試圖闡明組蛋白H3K14介導(dǎo)的營養(yǎng)脅迫誘導(dǎo)產(chǎn)孢的分子機(jī)制,為全面理解真菌適應(yīng)環(huán)境脅迫調(diào)控生活史轉(zhuǎn)變的生存策略奠定理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:云南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:Q939
【圖文】:
組蛋白H3K14位點(diǎn)所受修飾Figurel一1ModificationofHist朋eH3K14Site資料來源:表觀遺傳修飾,ab.~官網(wǎng)
Figure邋1-2邋Differentially邋Expressed邋Genes邋Regulated邋by邋GCN5,29*逡逑文研究思路及內(nèi)容逡逑球農(nóng)業(yè)病害中,植物寄生線蟲己經(jīng)上升為第二大農(nóng)業(yè)病害。據(jù)統(tǒng)計(jì),全逡逑,由于植物寄生線蟲的破壞造成的年度經(jīng)濟(jì)損失超過1570億美元[34】,逡逑言,至2000年全國每年累計(jì)發(fā)生各種病蟲害的面積高達(dá)3億公頃,其中逡逑
第三章實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析逡逑第三章實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析逡逑.組蛋白H3K14的突變影響紫色紫孢菌的生長和產(chǎn)孢逡逑1含有Q/R突變位點(diǎn)的H3片段的獲得:逡逑用使用NEBchanger設(shè)計(jì)的H3K14的Q和R突變引物以及Q5點(diǎn)突變?cè)噭┖绣义希靛澹樱椋簦澹模椋颍澹悖簦澹溴澹停酰簦幔纾澹睿澹螅椋箦澹耍椋簦校茫义鍞U(kuò)增質(zhì)粒邋pEASY-Blunt邋Zero邋Cloning邋Kit,逡逑LD反應(yīng)后轉(zhuǎn)化大腸感受態(tài),挑取單菌落進(jìn)行測序得到突變的菌株。測序結(jié)果如逡逑3-1-1、2所示:逡逑
本文編號(hào):2788488
【學(xué)位授予單位】:云南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:Q939
【圖文】:
組蛋白H3K14位點(diǎn)所受修飾Figurel一1ModificationofHist朋eH3K14Site資料來源:表觀遺傳修飾,ab.~官網(wǎng)
Figure邋1-2邋Differentially邋Expressed邋Genes邋Regulated邋by邋GCN5,29*逡逑文研究思路及內(nèi)容逡逑球農(nóng)業(yè)病害中,植物寄生線蟲己經(jīng)上升為第二大農(nóng)業(yè)病害。據(jù)統(tǒng)計(jì),全逡逑,由于植物寄生線蟲的破壞造成的年度經(jīng)濟(jì)損失超過1570億美元[34】,逡逑言,至2000年全國每年累計(jì)發(fā)生各種病蟲害的面積高達(dá)3億公頃,其中逡逑
第三章實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析逡逑第三章實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析逡逑.組蛋白H3K14的突變影響紫色紫孢菌的生長和產(chǎn)孢逡逑1含有Q/R突變位點(diǎn)的H3片段的獲得:逡逑用使用NEBchanger設(shè)計(jì)的H3K14的Q和R突變引物以及Q5點(diǎn)突變?cè)噭┖绣义希靛澹樱椋簦澹模椋颍澹悖簦澹溴澹停酰簦幔纾澹睿澹螅椋箦澹耍椋簦校茫义鍞U(kuò)增質(zhì)粒邋pEASY-Blunt邋Zero邋Cloning邋Kit,逡逑LD反應(yīng)后轉(zhuǎn)化大腸感受態(tài),挑取單菌落進(jìn)行測序得到突變的菌株。測序結(jié)果如逡逑3-1-1、2所示:逡逑
【參考文獻(xiàn)】
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1 李芬;孔艷;張帥;馬瑜;胡巖巖;;組蛋白不同乙酰化位點(diǎn)突變對(duì)酵母細(xì)胞生長和Ssa3、Gal1基因表達(dá)的影響[J];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào);2010年09期
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本文編號(hào):2788488
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