【摘要】：尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)屬鱸形目麗鯛科魚類,原產(chǎn)于非洲約旦,現(xiàn)已廣泛為許多國家和地區(qū)所引進。尼羅羅非魚已經(jīng)成為我國大陸引進魚類中養(yǎng)殖最成功的魚類,產(chǎn)量居世界第一。多年來尼羅羅非魚因為人工投放和養(yǎng)殖逃逸等原因在西江上游已形成自然群體。但是像尼羅羅非魚這樣的外來物種的到來必將對西江上游河流的生態(tài)圈造成巨大沖擊,土著魚類的生存環(huán)境受到威脅。因此對珠江水系西江上游野生尼羅羅非魚群體遺傳多樣性現(xiàn)狀進行評估顯得尤為重要。目前尚無關于珠江水系西江上游尼羅羅非魚群體變異及遺傳多樣性的研究報道。本研究通過DNA分子標記技術,對采集自珠江水系西江上游南盤江、北盤江和紅水河河流122條尼羅羅非魚樣本的mtDNA D-loop序列和rDNA ITS-1序列進行研究,探求西江上游尼羅羅非魚群體變異及遺傳多樣性現(xiàn)狀,以便為開展西江上游尼羅羅非魚群體的管理和利用提供理論依據(jù)。主要研究結果如下:1.尼羅羅非魚D-loop序列堿基組成和變異。本研究使用PCR擴增和DNA測序技術獲得了122條長度為879bp的西江上游野生尼羅羅非魚群體mtDNA D-loop序列,共定義單倍型18種。經(jīng)分析mtDNA D-loop序列中堿基A+T含量高于堿基C+G的含量,在3個群體尼羅羅非魚mtDNA D-loop序列中發(fā)現(xiàn)變異位點193個,變異類型包括轉換、顛換。其中北盤江種群變異位點數(shù)最多,達到143個;3個種群的堿基轉換位點數(shù)和堿基顛換位點數(shù)的比值都大于4,堿基變異未達到飽和。2.尼羅羅非魚D-loop序列遺傳多樣性和群體變異。尼羅羅非魚群體mtDNA D-loop序列的單倍型多樣性指數(shù)(Hd)、核苷酸多樣性指數(shù)(Pi)分別為0.9700和0.6439,群體遺傳多樣性豐富,普遍高于養(yǎng)殖尼羅羅非魚的遺傳多樣性。通過對3條河流尼羅羅非魚mtDNA D-loop序列遺傳分化指數(shù)(Fst)、遺傳距離(D)等相關數(shù)據(jù)進行分析,3條河流尼羅遺傳分化水平適中,少數(shù)單倍型已有一定程度的分化,存在著向不同譜系發(fā)展的趨勢。尼羅羅非魚群體大小歷史上相對穩(wěn)定,尚未出現(xiàn)明顯的擴張現(xiàn)象。3.尼羅羅非魚ITS-1序列堿基組成和變異。對珠江水系西江上游121條尼羅羅非魚rDNA ITS-1序列進行分析,共定義單倍型23種。結果顯示:3條河流尼羅羅非魚rDNA ITS-1序列存在長度多態(tài)性,有520bp、536bp和540bp三種長度的序列存在,其中520bp長度的序列數(shù)量最多,占總數(shù)的78.04%。rDNA ITS-1序列中堿基A、T、C、G的含量分別為14.4%、16.1%、38.8%、30.6%,堿基含量C+G顯著高于A+T的含量。在三個群體121條尼羅羅非魚個體的rDNA ITS-1序列中的發(fā)現(xiàn)變異點39個,堿基的變異率為7.5%。4.ITS-1序列遺傳多樣性和群體變異。珠江水系西江上游尼羅羅非魚rDNA ITS-1序列的單倍型多樣性指數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)分別為1.0000和0.0320,其中紅水河、北盤江群體具有較高的遺傳多樣性。通過對3條河流尼羅羅非魚rDNA ITS-1序列遺傳分化指數(shù)(Fst)、遺傳距離(D)等相關數(shù)據(jù)進行分析,3條河流尼羅羅非魚群體同樣存在著群體大小歷史上相對穩(wěn)定,未發(fā)生擴張,與mtDNA D-loop序列的研究結果一致。但在3個群體間遺傳分化,尼羅羅非魚ITS-1序列Fst值均小于0.05,群體間無分化,同時南盤江群體單倍型多樣指數(shù)較低這與mtDNA D-loop序列上的結果不一致,可能是因為mtDNA和rDNA遺傳方式的不同造成的。綜上所述,珠江水系西江上游野生尼羅羅非魚群體遺傳多樣性豐富,但群體間遺傳變異較小,未產(chǎn)生明顯的分化。該群體歷史上也未發(fā)生明顯的擴張現(xiàn)象,但存在著存在著向多譜系發(fā)展的趨勢。
【學位授予單位】：貴州大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2019
【分類號】：S917.4
【圖文】：

每條河流的尼羅羅非魚群體設置兩個采樣點，在每條河流上下游各設置一個采樣點，共計 6 個采樣點（圖2-1）。北盤江上游河流設為白層采樣點，下游河流為巖架采樣點；南盤江上游河流設為巴結采樣點，下游河流為八渡采樣點；紅水河上游河流設有紅水河鎮(zhèn)采樣點，下游河流設有天峨采樣點。各采樣點尼羅羅非魚樣本采集信息見表 2-1。

序列的遺傳多樣性指數(shù)；用MEGA6.0軟件計算mtDNA D-loop 序列的堿基組成，確定突變位點。采用 Kimura-2-Parameter 模型，通過 NCBI 中下載的麗鯛魚科真鯛（Pagrosomus major）（登錄號 AP002949.1）的 mtDNAD-loop 序列作為外群并用鄰接法構建 mtDNAD-loop 序列系統(tǒng)樹，使用 Network 軟件制作整個西江上游尼羅羅非魚 mtDNAD-loop 序列的單倍型網(wǎng)絡圖。2.結果2.1 D-loop 序列擴增結果珠江水系西江上游尼羅羅非魚 mtDNAD-loop 序列經(jīng) 1%瓊脂凝膠電泳檢驗后電泳圖見圖 2-2，獲得電泳條帶長度約為 980bp，并在比對剪切后通過 NCBI網(wǎng)站的 Blast 系統(tǒng)檢驗可以確定是目標序列。其電泳條帶明亮單一，未發(fā)現(xiàn)特異性條帶，可以排除雜帶 DNA 污染對本研究結果造成的影響。

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本文編號：2721712