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兩種來自鵝膏菌屬的野生菌分子鑒定

發(fā)布時(shí)間:2020-05-25 13:40
【摘要】:鵝膏菌在真菌界屬于擔(dān)子菌門擔(dān)子菌綱傘菌目鵝膏菌科鵝膏菌屬。全世界被接受的約有600種,其中我國已經(jīng)有約120多種鵝膏菌被報(bào)道。鵝膏菌中既有可食鵝膏菌,如橙蓋鵝膏Amanita caesarea,卵蓋鵝膏Amanita ovoidea;又有劇毒鵝膏菌,如黃綠毒鵝膏Amanita phalloides,豹斑鵝膏Amanita pantherina。鵝膏菌的多數(shù)物種與維管植物形成外生菌根關(guān)系(EM),在生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮著重要作用。鵝膏菌的分類學(xué)從傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定逐漸轉(zhuǎn)向了分子生物學(xué)鑒定,真菌基因片段的鑒定也從最開始的核糖體脫氧核糖核酸(rDNA)轉(zhuǎn)到利用新型的蛋白標(biāo)記基因(RPB2、β-tubulin、EFI-α)進(jìn)行分析。隨著技術(shù)的不斷發(fā)展人們對鵝膏菌的分類和認(rèn)知迅速增加,鵝膏菌的物種多樣性、系統(tǒng)地理學(xué)和群體遺傳學(xué)也都在不斷更新,鵝膏毒素在藥物研發(fā)、生物治療和轉(zhuǎn)錄機(jī)制等不同研究領(lǐng)域的應(yīng)用也在不斷拓展。本文以四川雅江和山西左權(quán)兩株野生鵝膏菌作為研究材料,利用CTAB法提取基因組DNA,然后利用PCR擴(kuò)增ITS、LSU、RPB2、β-tubulin和EFI-α等序列相應(yīng)區(qū)段,連接到T載體上進(jìn)行測序。利用GenBank核酸數(shù)據(jù)庫對測序得到的不同序列進(jìn)行同源比對,并從GenBank檢索獲取相似序列,與測序得到的不同序列分別做系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果揭示四川雅江野生鵝膏菌單以常用的ITS和LSU序列分析為指標(biāo)進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)該野生菌為肉桂鵝膏菌(Amanita cinnamomescens),而以RPB2、β-tubulin和EFI-α進(jìn)行序列分析鑒定,認(rèn)為該菌株為紅黃鵝膏黃褐變種(Amanita hemibapha var.ochracea),綜合ITS、LSU、RPB2、β-tubulin和EFI-α序列分析和聯(lián)合矩陣分析將四川雅江鵝膏菌鑒定為紅黃鵝膏黃褐變種(Amanita hemibapha var.ochracea),同理通過ITS、LSU、RPB2和EFI-α將山西左權(quán)鵝膏菌鑒定為擬橙蓋鵝膏菌(Amanita caesareoides)。最后通過抑芽法分析兩種鵝膏菌中的肽類毒素,結(jié)果顯示兩種鵝膏菌都不含肽類毒素,是無毒鵝膏菌,可以食用。
【圖文】:

底層,樣本,真菌,鵝膏菌


此前人們一直認(rèn)為真菌在起源于大約 4 億年前的陸地,最近 Bengtson 等非 2.4-Gyr-Ongeluk 組的玄武巖熔巖中(如圖 2.1)發(fā)現(xiàn)了和真菌結(jié)構(gòu)特化石,約有 24 億年的歷史,為真菌進(jìn)化提出最新的證據(jù)[1-2]。關(guān)于真問題也引起了許多猜測,2017 年 Hawksworth D L 和 Robert Lücking 得菌多樣性的最新估計(jì),真菌數(shù)量大約有 220 萬至 380 萬,目前有 12 萬接受,也就是只有 8%的真菌被認(rèn)識,最壞的情況只有 3%的真菌被認(rèn)識早在 6000 年前就開始利用真菌,西方也有 3500 年的歷史,但對于真菌研究卻在近 200 年左右。關(guān)于鵝膏菌的研究在真菌分類學(xué)的開始就受到的注意,但是由于缺乏化石的記錄,鵝膏菌屬的起源時(shí)間和地點(diǎn)仍然不],隨著分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,在過去的 20 年,,就有約 220 個(gè)新的分類群,新品種和新形式)被報(bào)道[5]。本章就是在常用的核糖體標(biāo)記基因的基新型蛋白標(biāo)記基因,對采自山西左權(quán)一株野生鵝膏菌進(jìn)行鑒定。

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第二章 山西左權(quán)鵝膏菌的分類鑒定相似序列通過軟件 ClustalW(DNA Star 程序)sion5.1)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹中的最大似然法構(gòu)建系自展值(bootstrap)為 1000 次,最終得到的 b于 70%可能是進(jìn)化樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)有問題。體 ITS、LSU、RPB2 和 EFI-α基因擴(kuò)增因組 DNA 為模板,對其 ITS、LSU、RPB2 和 EFI均能擴(kuò)增出唯一的條帶,如圖 2.2 可見,ITS 序列序列長度在 750-1000 bp 之間,RPB2 序列長度在度在 500-750 bp 之間,與預(yù)期結(jié)果一樣。
【學(xué)位授予單位】:山西大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:Q949.32

【相似文獻(xiàn)】

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3 渠文思;石家祺;石亞偉;;基于ITS和LSU序列對一株野生鵝膏菌的分類鑒定[J];山西農(nóng)業(yè)科學(xué);2018年12期

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本文編號:2680234

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