擬穴青蟹細(xì)絲蛋白C的分子克隆及抗原表位分析
發(fā)布時間:2021-06-14 11:54
蟹類水產(chǎn)品的消費(fèi)量逐年遞增,隨之引發(fā)的過敏反應(yīng)廣受關(guān)注。細(xì)絲蛋白C(filamin C,FLN c)是擬穴青蟹(Scylla paramamosain)肌肉中的新型過敏原,有關(guān)該過敏原的基因序列、理化特性、抗原表位等尚不清楚。因此針對FLN c基因序列及抗原表位的研究有利于解決甲殼類動物FLN c交叉反應(yīng)引起的過敏疾病診斷難題。本研究以擬穴青蟹FLN c為研究對象,利用巢式聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)及互補(bǔ)脫氧核糖核酸末端快速擴(kuò)增技術(shù)獲得FLN c的基因序列,該基因開放閱讀框共2544個堿基,編碼847個氨基酸殘基,核苷酸序列登錄號為MK747241.1,填補(bǔ)了甲殼類水產(chǎn)品FLN c基因序列的空白。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,FLN c含有9個結(jié)構(gòu)域,其三級結(jié)構(gòu)呈免疫球蛋白樣折疊,具有典型的細(xì)絲蛋白家族特征;系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,細(xì)絲蛋白家族在進(jìn)化中呈現(xiàn)高度保守性。另外,基于三種生物信息學(xué)在線分析及軟件預(yù)測得到FLN c的28個線性表位,并將本實(shí)驗(yàn)室前期經(jīng)噬菌體淘選獲得的模擬表位肽段與青蟹FLN c基因序列進(jìn)行比對,共匹配得到22個表位肽段,比對分析最終明確了擬穴青蟹FLN c的11個線性表位。進(jìn)一步...
【文章來源】:集美大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
主要符號表
第1章 引言
1.1 食物過敏與食物過敏原
1.1.1 食物過敏現(xiàn)狀
1.1.2 食物過敏反應(yīng)機(jī)制
1.1.3 食物過敏原與組分診斷
1.2 水產(chǎn)食物過敏原
1.2.1 魚類過敏原
1.2.2 軟體貝類過敏原
1.2.3 甲殼類過敏原
1.2.4 水產(chǎn)食物過敏原的免疫交叉反應(yīng)
1.3 水產(chǎn)食物過敏原抗原表位
1.3.1 抗原表位的分類與研究方法
1.3.2 水產(chǎn)食物過敏原的抗原表位
1.4 本研究的目的與意義
第2章 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 原材料
2.1.2 甲殼類過敏患者血清
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.1.4 主要試劑
2.1.5 主要溶液配制
2.2 方法
2.2.1 擬穴青蟹FLN c的純化及鑒定
2.2.2 擬穴青蟹FLN c的多克隆抗體制備
2.2.3 擬穴青蟹FLN c的分子克隆
2.2.4 擬穴青蟹FLN c的生物信息學(xué)分析
2.2.5 擬穴青蟹FLN c的重組表達(dá)
2.2.6 擬穴青蟹nFLN c與 rFLN c的性質(zhì)比較
2.2.7 甲殼類及軟體類FLN c的免疫交叉反應(yīng)分析
2.2.8 統(tǒng)計分析
第3章 結(jié)果與分析
3.1 擬穴青蟹FLN c的純化鑒定及抗體制備
3.1.1 FLN c的純化及質(zhì)譜鑒定
3.1.2 FLN c的 Native-PAGE及雙向電泳分析
3.1.3 FLN c的 PAS染色分析
3.1.4 FLN c多克隆抗體制備及效價分析
3.2 擬穴青蟹FLN c的分子克隆及生物信息學(xué)分析
3.2.1 FLN c的分子克隆
3.2.2 FLN c的氨基酸序列分析
3.2.3 FLN c的二級結(jié)構(gòu)及結(jié)構(gòu)域分析
3.2.4 FLN c的三級結(jié)構(gòu)分析
3.2.5 細(xì)絲蛋白家族系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
3.2.6 FLN c的抗原表位分析
3.3 擬穴青蟹FLN c的重組表達(dá)
3.3.1 載體構(gòu)建及重組表達(dá)
3.3.2 重組蛋白的純化及鑒定
3.4 擬穴青蟹n FLN c與 rFLN c的比較分析
3.4.1 理化特性的比較分析
3.4.2 二級結(jié)構(gòu)及表面疏水性的比較分析
3.4.3 免疫結(jié)合活性的比較分析
3.5 擬穴青蟹FLN c的結(jié)構(gòu)域重組蛋白表達(dá)及表位區(qū)域分析
3.5.1 FLN c不同結(jié)構(gòu)域的載體構(gòu)建及原核表達(dá)
3.5.2 FLN c不同結(jié)構(gòu)域重組蛋白的純化及鑒定
3.5.3 FLN c不同結(jié)構(gòu)域重組蛋白的免疫結(jié)合活性分析
3.6 甲殼類及軟體類FLN c的免疫交叉反應(yīng)分析
3.6.1 甲殼類及軟體類FLN c的 IgG結(jié)合活性分析
3.6.2 甲殼類及軟體類FLN c的 IgE結(jié)合活性分析
3.6.3 甲殼類及軟體類FLN c的抑制性Western blot分析
第4章 討論
4.1 擬穴青蟹FLN c的分子克隆及生物信息學(xué)分析
4.2 擬穴青蟹nFLN c與 rFLN c的性質(zhì)比較
4.3 擬穴青蟹FLN c的抗原表位區(qū)域分析
4.4 甲殼類及軟體類FLN c的免疫交叉反應(yīng)分析
第5章 結(jié)論與展望
5.1 結(jié)論
5.2 展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
在學(xué)期間科研成果情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人角質(zhì)細(xì)胞生長因子2真核表達(dá)載體的構(gòu)建及功能驗(yàn)證[J]. 劉娟,趙思源,徐小潔,楊超,張魯囡,劉佳,孫萬軍. 生物技術(shù)通訊. 2019(01)
[2]河南華溪蟹生殖調(diào)控分子VASA的原核表達(dá)、抗體制備及免疫鑒定[J]. 杜曉琳,王蘭,孫敏. 水產(chǎn)學(xué)報. 2018(08)
[3]人IgE重鏈恒定區(qū)2~4區(qū)蛋白的真核表達(dá)、純化及其相互作用分子捕獲[J]. 黃慧慧,王哲彥,楊正根,李珍,王萍,董文其. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2018(03)
[4]菲律賓蛤仔過敏原原肌球蛋白的鑒定與分子克隆[J]. 呂良濤,藺海鑫,高卿,林洪,李振興. 食品安全質(zhì)量檢測學(xué)報. 2015(11)
[5]水產(chǎn)食物過敏原及其抗原表位的研究進(jìn)展[J]. 張永霞,楊陽,蔡秋鳳,孫樂常,曹敏杰,劉光明. 中國漁業(yè)質(zhì)量與標(biāo)準(zhǔn). 2015(05)
[6]凡納濱對蝦過敏原精氨酸激酶的質(zhì)譜鑒定及其免疫交叉反應(yīng)研究[J]. 孫一帆,黃建芳,向軍儉,王彩霞,陳成楓. 食品科學(xué). 2015(01)
[7]融合標(biāo)簽在蛋白質(zhì)可溶性表達(dá)中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 吳珊珊,朱蕓,陳珊珊,何冰芳. 化工進(jìn)展. 2014(04)
[8]生物信息學(xué)技術(shù)在食物過敏原表位預(yù)測中的應(yīng)用[J]. 龍偉,李欣,高金燕,陳紅兵. 食品科學(xué). 2014(03)
[9]蝦夷扇貝過敏原tropomyosin的克隆表達(dá)、純化及免疫學(xué)鑒定[J]. 劉志剛,鄔玉蘭,吳淑勤,石存斌,夏皓玉,陳麗斐. 水生生物學(xué)報. 2010(05)
[10]方斑東風(fēng)螺過敏原的分離、鑒定與純化[J]. 吳序櫟,張劍文,劉志剛. 免疫學(xué)雜志. 2009(02)
博士論文
[1]擬穴青蟹(Scylla paramamosain)肌漿蛋白過敏原的致敏性研究[D]. 楊陽.集美大學(xué) 2018
本文編號:3229776
【文章來源】:集美大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
主要符號表
第1章 引言
1.1 食物過敏與食物過敏原
1.1.1 食物過敏現(xiàn)狀
1.1.2 食物過敏反應(yīng)機(jī)制
1.1.3 食物過敏原與組分診斷
1.2 水產(chǎn)食物過敏原
1.2.1 魚類過敏原
1.2.2 軟體貝類過敏原
1.2.3 甲殼類過敏原
1.2.4 水產(chǎn)食物過敏原的免疫交叉反應(yīng)
1.3 水產(chǎn)食物過敏原抗原表位
1.3.1 抗原表位的分類與研究方法
1.3.2 水產(chǎn)食物過敏原的抗原表位
1.4 本研究的目的與意義
第2章 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 原材料
2.1.2 甲殼類過敏患者血清
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.1.4 主要試劑
2.1.5 主要溶液配制
2.2 方法
2.2.1 擬穴青蟹FLN c的純化及鑒定
2.2.2 擬穴青蟹FLN c的多克隆抗體制備
2.2.3 擬穴青蟹FLN c的分子克隆
2.2.4 擬穴青蟹FLN c的生物信息學(xué)分析
2.2.5 擬穴青蟹FLN c的重組表達(dá)
2.2.6 擬穴青蟹nFLN c與 rFLN c的性質(zhì)比較
2.2.7 甲殼類及軟體類FLN c的免疫交叉反應(yīng)分析
2.2.8 統(tǒng)計分析
第3章 結(jié)果與分析
3.1 擬穴青蟹FLN c的純化鑒定及抗體制備
3.1.1 FLN c的純化及質(zhì)譜鑒定
3.1.2 FLN c的 Native-PAGE及雙向電泳分析
3.1.3 FLN c的 PAS染色分析
3.1.4 FLN c多克隆抗體制備及效價分析
3.2 擬穴青蟹FLN c的分子克隆及生物信息學(xué)分析
3.2.1 FLN c的分子克隆
3.2.2 FLN c的氨基酸序列分析
3.2.3 FLN c的二級結(jié)構(gòu)及結(jié)構(gòu)域分析
3.2.4 FLN c的三級結(jié)構(gòu)分析
3.2.5 細(xì)絲蛋白家族系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
3.2.6 FLN c的抗原表位分析
3.3 擬穴青蟹FLN c的重組表達(dá)
3.3.1 載體構(gòu)建及重組表達(dá)
3.3.2 重組蛋白的純化及鑒定
3.4 擬穴青蟹n FLN c與 rFLN c的比較分析
3.4.1 理化特性的比較分析
3.4.2 二級結(jié)構(gòu)及表面疏水性的比較分析
3.4.3 免疫結(jié)合活性的比較分析
3.5 擬穴青蟹FLN c的結(jié)構(gòu)域重組蛋白表達(dá)及表位區(qū)域分析
3.5.1 FLN c不同結(jié)構(gòu)域的載體構(gòu)建及原核表達(dá)
3.5.2 FLN c不同結(jié)構(gòu)域重組蛋白的純化及鑒定
3.5.3 FLN c不同結(jié)構(gòu)域重組蛋白的免疫結(jié)合活性分析
3.6 甲殼類及軟體類FLN c的免疫交叉反應(yīng)分析
3.6.1 甲殼類及軟體類FLN c的 IgG結(jié)合活性分析
3.6.2 甲殼類及軟體類FLN c的 IgE結(jié)合活性分析
3.6.3 甲殼類及軟體類FLN c的抑制性Western blot分析
第4章 討論
4.1 擬穴青蟹FLN c的分子克隆及生物信息學(xué)分析
4.2 擬穴青蟹nFLN c與 rFLN c的性質(zhì)比較
4.3 擬穴青蟹FLN c的抗原表位區(qū)域分析
4.4 甲殼類及軟體類FLN c的免疫交叉反應(yīng)分析
第5章 結(jié)論與展望
5.1 結(jié)論
5.2 展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
在學(xué)期間科研成果情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人角質(zhì)細(xì)胞生長因子2真核表達(dá)載體的構(gòu)建及功能驗(yàn)證[J]. 劉娟,趙思源,徐小潔,楊超,張魯囡,劉佳,孫萬軍. 生物技術(shù)通訊. 2019(01)
[2]河南華溪蟹生殖調(diào)控分子VASA的原核表達(dá)、抗體制備及免疫鑒定[J]. 杜曉琳,王蘭,孫敏. 水產(chǎn)學(xué)報. 2018(08)
[3]人IgE重鏈恒定區(qū)2~4區(qū)蛋白的真核表達(dá)、純化及其相互作用分子捕獲[J]. 黃慧慧,王哲彥,楊正根,李珍,王萍,董文其. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2018(03)
[4]菲律賓蛤仔過敏原原肌球蛋白的鑒定與分子克隆[J]. 呂良濤,藺海鑫,高卿,林洪,李振興. 食品安全質(zhì)量檢測學(xué)報. 2015(11)
[5]水產(chǎn)食物過敏原及其抗原表位的研究進(jìn)展[J]. 張永霞,楊陽,蔡秋鳳,孫樂常,曹敏杰,劉光明. 中國漁業(yè)質(zhì)量與標(biāo)準(zhǔn). 2015(05)
[6]凡納濱對蝦過敏原精氨酸激酶的質(zhì)譜鑒定及其免疫交叉反應(yīng)研究[J]. 孫一帆,黃建芳,向軍儉,王彩霞,陳成楓. 食品科學(xué). 2015(01)
[7]融合標(biāo)簽在蛋白質(zhì)可溶性表達(dá)中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 吳珊珊,朱蕓,陳珊珊,何冰芳. 化工進(jìn)展. 2014(04)
[8]生物信息學(xué)技術(shù)在食物過敏原表位預(yù)測中的應(yīng)用[J]. 龍偉,李欣,高金燕,陳紅兵. 食品科學(xué). 2014(03)
[9]蝦夷扇貝過敏原tropomyosin的克隆表達(dá)、純化及免疫學(xué)鑒定[J]. 劉志剛,鄔玉蘭,吳淑勤,石存斌,夏皓玉,陳麗斐. 水生生物學(xué)報. 2010(05)
[10]方斑東風(fēng)螺過敏原的分離、鑒定與純化[J]. 吳序櫟,張劍文,劉志剛. 免疫學(xué)雜志. 2009(02)
博士論文
[1]擬穴青蟹(Scylla paramamosain)肌漿蛋白過敏原的致敏性研究[D]. 楊陽.集美大學(xué) 2018
本文編號:3229776
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