pH對(duì)釀酒酵母轉(zhuǎn)錄組的影響
發(fā)布時(shí)間:2021-03-26 06:15
為研究不同pH對(duì)釀酒酵母基因表達(dá)的影響,選用了 Pach培養(yǎng)基和麥芽汁培養(yǎng)基,在5L的發(fā)酵罐中分別在pH3.0、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、8.0、9.0條件下進(jìn)行有氧培養(yǎng),通過(guò)測(cè)序分析了不同pH條件下釀酒酵母的轉(zhuǎn)錄組。結(jié)果表明:在Pach培養(yǎng)基中,pH3.0與其它pH間差異表達(dá)的基因有 1416、1363、2026、3324、1925、3025、3159、3626、3104個(gè)。在 GO 數(shù)據(jù)庫(kù)分別注釋到 1654、1817、1544、1993、2259、2162、1619、2392、2113 個(gè)功能。在 KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)定位到 485、532、712、1217、795、1171、955、899、1111個(gè)代謝途徑;在麥芽汁培養(yǎng)基中,pH3.0與其它pH間差異表達(dá)的基因有 1658、1824、1547、2003、2268、2169、1621、2405、2118 個(gè)。在 GO 數(shù)據(jù)庫(kù)分別注釋到 1654、1817、1544、1993、2259、2162、1619、2392、211 3 個(gè)功能。在 KEGG 數(shù)據(jù)庫(kù)中定位到 612、673、575、695、830、...
【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:48 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1生長(zhǎng)曲線??Fig.?1?growth?curve??
?內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文?11_??麥芽汁培養(yǎng)基??1400?:?5!差異基因總數(shù)?1注釋到GO的數(shù)目?4注釋到KEGG的數(shù)目??1200?g三??1000?g=?|=?H?二?{二?丨?|?=??<c?800?p?li?P?P?P養(yǎng)三謹(jǐn)至量巨??1?-?It?I?P?A?P?P?P?I?II??:il。欤欤剩欤妫悖欤?ill??^?^?^?^?^?^??圖3上調(diào)基因數(shù)目??Fig.?3?Number?of?up-regulated?differentially?expressed?genes??3.2.4下調(diào)基因數(shù)目統(tǒng)計(jì)??將條件為pH3.0的樣品與其它pH條件下的樣品進(jìn)行差異表達(dá)分析,通過(guò)篩癬??統(tǒng)計(jì)得到下調(diào)基因的數(shù)目并將注釋到GO、KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中,數(shù)目統(tǒng)計(jì)結(jié)果如圖4所??示,在Pach培養(yǎng)基中,下調(diào)的差異基因總數(shù)是12189個(gè),在GO上注釋到的功能數(shù)??12152個(gè),在KEGG上注釋到的途徑共3521個(gè)。在麥芽汁培養(yǎng)基中,下調(diào)的差異基??因總數(shù)是8422個(gè),在GO上注釋到的功能數(shù)8402個(gè),在KEGG上注釋到的途徑共??3149?個(gè)。??Pach培養(yǎng)基??2500?:?*差異基因總數(shù)=■注釋到GO的數(shù)目注釋到KEGG的數(shù)目??蠢?IS?I—?P?I?P?!?P?P??:I?Jy?11?Jy?11II??/?/■?/■?/■?/■?/??/■?/■??/?/?/?/?/?/?/?/?/??
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本文編號(hào):3101111
【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1生長(zhǎng)曲線??Fig.?1?growth?curve??
?內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文?11_??麥芽汁培養(yǎng)基??1400?:?5!差異基因總數(shù)?1注釋到GO的數(shù)目?4注釋到KEGG的數(shù)目??1200?g三??1000?g=?|=?H?二?{二?丨?|?=??<c?800?p?li?P?P?P養(yǎng)三謹(jǐn)至量巨??1?-?It?I?P?A?P?P?P?I?II??:il。欤欤剩欤妫悖欤?ill??^?^?^?^?^?^??圖3上調(diào)基因數(shù)目??Fig.?3?Number?of?up-regulated?differentially?expressed?genes??3.2.4下調(diào)基因數(shù)目統(tǒng)計(jì)??將條件為pH3.0的樣品與其它pH條件下的樣品進(jìn)行差異表達(dá)分析,通過(guò)篩癬??統(tǒng)計(jì)得到下調(diào)基因的數(shù)目并將注釋到GO、KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中,數(shù)目統(tǒng)計(jì)結(jié)果如圖4所??示,在Pach培養(yǎng)基中,下調(diào)的差異基因總數(shù)是12189個(gè),在GO上注釋到的功能數(shù)??12152個(gè),在KEGG上注釋到的途徑共3521個(gè)。在麥芽汁培養(yǎng)基中,下調(diào)的差異基??因總數(shù)是8422個(gè),在GO上注釋到的功能數(shù)8402個(gè),在KEGG上注釋到的途徑共??3149?個(gè)。??Pach培養(yǎng)基??2500?:?*差異基因總數(shù)=■注釋到GO的數(shù)目注釋到KEGG的數(shù)目??蠢?IS?I—?P?I?P?!?P?P??:I?Jy?11?Jy?11II??/?/■?/■?/■?/■?/??/■?/■??/?/?/?/?/?/?/?/?/??
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本文編號(hào):3101111
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