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桃種間SSR、ITS鑒定及葉綠體基因組比較分析

發(fā)布時間:2025-02-09 10:48
  我國是桃的原產(chǎn)地,種質(zhì)資源豐富。隨著越來越多的桃近緣種資源融入到桃的育種計劃和大量外來品種的不斷涌入,如何快速、準確地鑒定桃種質(zhì)資源成為一個亟待解決的問題。同時,隨著新基因的不斷發(fā)掘,桃的遺傳轉(zhuǎn)化也需要桃基因組數(shù)據(jù)作為基礎(chǔ)。本研究主要包括三個部分:以國家桃種質(zhì)資源圃代表性種質(zhì)為基礎(chǔ),對現(xiàn)有桃SSR標記進行篩選,篩選出適用于桃種間鑒定的SSR引物組,并驗證這一引物組對未知種質(zhì)的鑒定效果以及對雜種基因型分析的適用性;采用克隆測序,分析桃五個種代表性種質(zhì)的序列特點和種間差異,并對ITS序列作為桃DNA條形碼的潛在可能性進行分析;對桃6個代表性種質(zhì)葉綠體基因組測序,對比分析6個種基因組特點和差異。主要研究結(jié)果如下:1.桃種間SSR鑒定及雜種基因型分析(1)以3個國家桃種質(zhì)資源圃20份代表性種質(zhì)為試驗材料,通過對覆蓋桃8個連鎖群的78個SSR標記進行篩選,篩選出18個SSR位點,這些位點可以用于高效區(qū)分光核桃、甘肅桃、山桃、新疆桃和毛桃5個種。(2)基于熒光標記引物PCR和毛細管電泳分離技術(shù),建立了桃5個種在18個SSR位點的等位基因數(shù)據(jù)庫。(3)通過對8份未知桃種質(zhì)材料的種間鑒定和‘毛桃×山桃’...

【文章頁數(shù)】:91 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1.1微衛(wèi)星的開發(fā)、分布、功能及應(yīng)用(Kaliaetal.,2011)

圖1.1微衛(wèi)星的開發(fā)、分布、功能及應(yīng)用(Kaliaetal.,2011)

因此,由2-3個核苷酸基元組成的微衛(wèi)星應(yīng)用較為廣泛,在植物中(AT)n較中(AC)n比較常見(Powelletal.,1996)。SSR位點兩側(cè)一般是相對保守的單拷貝于設(shè)計特異引物用于PCR擴增檢測其遺傳變異。微衛(wèi)星標記具有共顯性、多態(tài)性、重演性強、近緣種間保....


圖1.218S-26SrDNA的基本結(jié)構(gòu)(王建波等,1999)

圖1.218S-26SrDNA的基本結(jié)構(gòu)(王建波等,1999)

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文第一章引言結(jié)合s6pdh、trnSG和SSR標記揭示了李屬植物在馴化歷程中的進化歷史,為研究李屬植物近期進化提供了參考。雖然桃的SSR引物開發(fā)的較早、應(yīng)用廣泛(陳昌文等,2011;李雄偉等,2013;俞明亮等,2004;Lamber....


圖1.3葉綠體基因組結(jié)構(gòu)及應(yīng)用(Rogalskietal.,2015)

圖1.3葉綠體基因組結(jié)構(gòu)及應(yīng)用(Rogalskietal.,2015)

圖1.3葉綠體基因組結(jié)構(gòu)及應(yīng)用(Rogalskietal.,2015)Figure1.3Thestructureandapplicationsofchloroplastgenome1.5.3葉綠體基因組序列多樣性在真核細胞進化過程中,葉綠體和線粒體一樣....


圖2.120份樣品的3個SSR引物擴增產(chǎn)物聚丙烯酰胺凝膠電泳圖

圖2.120份樣品的3個SSR引物擴增產(chǎn)物聚丙烯酰胺凝膠電泳圖

圖2.120份樣品的3個SSR引物擴增產(chǎn)物聚丙烯酰胺凝膠電泳圖A:CPSCT026;B:UDP98-025;C:CPPCT30;M:DNA分子量參考標準;CK:以ddH2O代替DNA模板的空白對照;1-20:隸屬桃5個種的20份種質(zhì)....



本文編號:4032106

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