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我國不同地區(qū)辣椒疫霉群體遺傳結(jié)構(gòu)和抗藥性分析

發(fā)布時(shí)間:2024-05-20 05:44
  由辣椒疫霉(Phytophthora capsici Leonian)引起的植物疫病是毀滅性的植物病害,嚴(yán)重影響著全世界蔬菜等農(nóng)作物的產(chǎn)量和品質(zhì)。辣椒疫霉群體遺傳結(jié)構(gòu)和對(duì)殺菌劑的敏感性變化直接影響著病害的發(fā)生與流行。為有效防治植物疫病,本論文對(duì)來自全國6大地區(qū)(華東、華北、西南、西北、東北和華南)以及美國(1個(gè))的55個(gè)辣椒疫霉菌株進(jìn)行了遺傳多樣性和對(duì)殺菌劑當(dāng)家品種的抗性分析,獲得如下的研究結(jié)果:1、利用直接配對(duì)法測定了55個(gè)辣椒疫霉菌株的交配型。結(jié)果顯示,我國不同地區(qū)菌株交配型為A1或A2,這兩種交配型在我國各地區(qū)都有分布。除華南地區(qū)只有A2交配型以外,其他地區(qū)A1和A2交配型的比例接近1:1。2、利用7對(duì)SSR引物(Pcap1、Pcap3、Pcap、Pcap5、Pcap6、Pcap7和 Pcap8)分析了辣椒疫霉群體的遺傳多樣性。①首先建立了SSR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測過程中一種基于熒光測序技術(shù)的高通量低成本分析技術(shù)TP-M13-SSR。②基于該技術(shù),利用這7對(duì)SSR引物檢測出21個(gè)等位基因,平均每個(gè)位點(diǎn)檢測出3個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)至少可以檢測出2個(gè)等位基因。χ2卡方檢驗(yàn)表明在7個(gè)SSR位點(diǎn)...

【文章頁數(shù)】:62 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1?TP-IVn3-SSR技術(shù)的原理??A,5’端帶有尾己序列的上游引物,即TP-M13引物;B,下游引物;C,帶有巧光標(biāo)記的馬己引物

圖1?TP-IVn3-SSR技術(shù)的原理??A,5’端帶有尾己序列的上游引物,即TP-M13引物;B,下游引物;C,帶有巧光標(biāo)記的馬己引物

最終實(shí)現(xiàn)了?SS民技術(shù)與巧光自動(dòng)檢測技術(shù)的完美結(jié)合,形成了一套低成本的基于巧??光測序技術(shù)的TP-M13-SSR檢測體系。與常規(guī)PCR體系不同,TP-M13-SS民在PC民擴(kuò)增??中需要3條引物,其原理見圖1。PC艮反應(yīng)時(shí),引物A和B首先與DNA模板結(jié)合進(jìn)行特??異性擴(kuò)增,獲得含....


圖4本研究中辣椒疫霉苗襪交酷型分布情況??

圖4本研究中辣椒疫霉苗襪交酷型分布情況??

圖3代表性茜株SDl的ITS和YPT基因序列及化對(duì)結(jié)果??3交配型??交配型的測定結(jié)果(表1,圖4)表明,被測的54個(gè)辣椒疫霉菌中,30株為A1交配型,??發(fā)生頻率為54.55%;?25株為A2交配型,發(fā)生頻率為45.45%。除華南地區(qū)只有一個(gè)茵株??用于分析外(A2交配型),其....


圖5代表性苗株基因絕DNA電泳結(jié)果

圖5代表性苗株基因絕DNA電泳結(jié)果

4.1提取的基因組DNA??利用卵茜快速提。模危恋姆椒ǎǎ保埃叮┇@得了所有供試菌株的基因組DNA,通過瓊脂糖??凝膠電泳檢測DNA的質(zhì)量和濃度。結(jié)果表明(圖5),獲得的所有菌株的DNA電泳條帶清??晰,只有1條帶,條帶亮度都在150?ngW上,說明提取的DNA質(zhì)好量足,可W用于....


圖6凝膠電泳和TP-M13-SSR檢測SSR位點(diǎn)《態(tài)性的比較??A,Pcap3引物對(duì)菌揉PC700902擴(kuò)增后的結(jié)果檢測;B,Pcap4引物對(duì)幽株LN1擴(kuò)增后的結(jié)果檢測

圖6凝膠電泳和TP-M13-SSR檢測SSR位點(diǎn)《態(tài)性的比較??A,Pcap3引物對(duì)菌揉PC700902擴(kuò)增后的結(jié)果檢測;B,Pcap4引物對(duì)幽株LN1擴(kuò)增后的結(jié)果檢測

利用7對(duì)SSR引物對(duì)5S個(gè)辣椒疫霉菌株進(jìn)行擴(kuò)增,可獲得不同材料在不同位點(diǎn)的基??因片段大小。本研究利用巧光標(biāo)巧PCR盧物和測序儀讀取片段太小,建立了替代瓊脂鱗凝??膠電泳的TP-M13-SSR方法。通過比較傳統(tǒng)的DNA電泳與TP-M13-SS民的結(jié)果(圖6),??我們發(fā)現(xiàn)利巧TP....



本文編號(hào):3979038

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