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菠菜熱激轉(zhuǎn)錄因子Hsf家族全基因組分析及SoHsfA1基因功能分析

發(fā)布時(shí)間:2024-05-20 02:29
  菠菜(Spinacia oleracea L.)是我國(guó)重要的綠葉蔬菜之一,耐寒性強(qiáng),但不耐高溫,溫度高于25℃時(shí),植株出現(xiàn)長(zhǎng)勢(shì)弱、產(chǎn)量低、品質(zhì)差、硝酸鹽積累等問題。熱激轉(zhuǎn)錄因子(Heart shock transcription factors,Hsfs)是熱激反應(yīng)的主要調(diào)節(jié)因子,參與調(diào)控?zé)峒p傷下的保護(hù)蛋白—熱激蛋白(Heat shock proteins,Hsps)的表達(dá)。因此,研究熱激轉(zhuǎn)錄因子基因家族對(duì)研究菠菜熱脅迫響應(yīng)機(jī)制至關(guān)重要。以菠菜轉(zhuǎn)錄組和基因組的測(cè)序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),本研究分析并鑒定了菠菜Hsf家族的特性和功能,為全面分析菠菜熱脅迫的響應(yīng)機(jī)制奠定基礎(chǔ),為菠菜耐熱分子育種的發(fā)展提供理論依據(jù)。本研究完成了菠菜全基因組熱激轉(zhuǎn)錄因子基因家族的鑒定,并克隆了全部SoHsfs的CDS全長(zhǎng);根據(jù)其結(jié)構(gòu)域的特征,將SoHsfs家族分為A、B、C三類;構(gòu)建菠菜、擬南芥(Arabidopsis thaliana)和與菠菜同屬莧科藜亞科的甜菜(Beta vulgaris)Hsfs系統(tǒng)發(fā)育樹,預(yù)測(cè)分析了SoHsfs亞家族成員和功能;利用qRT-PCR方法分析了該家族耐熱候選基因SoHsfA1高溫脅迫...

【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.1植物Hsf基本結(jié)構(gòu)

圖1.1植物Hsf基本結(jié)構(gòu)

上海師范大學(xué)碩士學(xué)位論文1.緒論HsfB(除HsfB5)的NLS包含高度保守的四肽阻遏基序(repressordomain,RD)—LFGV—[50-52]。在植物某些Hsf的C端區(qū)域中還存在一個(gè)富含亮氨酸的疏水NES區(qū)域。正是NLS和NES的協(xié)同作....


圖1.2HSF-HSP-HSBP1熱脅迫協(xié)同響應(yīng)機(jī)制[97]

圖1.2HSF-HSP-HSBP1熱脅迫協(xié)同響應(yīng)機(jī)制[97]

3.植物Hsf基因家族響應(yīng)熱脅迫的調(diào)控機(jī)制植物Hsf在參與熱脅迫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及耐熱性的產(chǎn)生過程中的作用概括體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面[36]:(1)植物耐熱基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中最有特點(diǎn)的是調(diào)控編碼熱激蛋白的熱激轉(zhuǎn)錄因子,可與熱激蛋白上游的順式作用元件結(jié)合,從而啟動(dòng)下游熱激蛋白和相關(guān)基因....


圖2.2菠菜Hsf熱激轉(zhuǎn)錄因子家族DBD保守結(jié)構(gòu)域多序列比對(duì)分析

圖2.2菠菜Hsf熱激轉(zhuǎn)錄因子家族DBD保守結(jié)構(gòu)域多序列比對(duì)分析

分析結(jié)果顯示,該結(jié)構(gòu)域由94-102個(gè)氨基酸組成,包含3個(gè)α螺旋和4個(gè)β折疊(圖2.2),且除SoHsf12外,其他成員中編碼該結(jié)構(gòu)域的部分氨基酸殘基完全一致,這種進(jìn)化中高度保守可能是使Hsf能夠識(shí)別并與熱激蛋白Hsp(Heartshockprot....


圖2.3菠菜Hsf熱激轉(zhuǎn)錄因子家族OD保守結(jié)構(gòu)域多序列比對(duì)分析

圖2.3菠菜Hsf熱激轉(zhuǎn)錄因子家族OD保守結(jié)構(gòu)域多序列比對(duì)分析

分析表明,并非全部的菠菜Hsf中都具有NES結(jié)構(gòu)域,、SoHsf2、SoHsf3、SoHsf4、SoHsf8、SoHsf10、SoHsf11、SoHsf14其中SoHsf1的NES區(qū)緊鄰HR-A/B區(qū)的羧基末端,而其它SoHsfs的HR-A/B結(jié)構(gòu)域羧....



本文編號(hào):3978822

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