目前,對于西瓜枯萎病的防治主要依靠化學藥劑,但藥劑殘留嚴重,危害人類的健康,破壞全球環(huán)境。因此,加快西瓜枯萎病致病機理的研究是尋找有效防治方法的重要前提。效應子基因在病原菌侵染植物過程中起到關鍵的作用,對效應子基因進行初步功能研究,有助于在分子水平上了解病原菌的致病機制,為西瓜枯萎病菌的防治提供理論依據(jù)。本研究主要包括以下幾個方面:1.在對全基因組測序和重測序的基礎上,基于生物信息學分析結果,篩選出115個西瓜�；偷奶禺惢蚪M片段。對其中2個最長的基因組片段設計引物,經過常規(guī)PCR反應,篩選并鑒定出FOW-2F/FOW-2R、FOW-3F/FOW-3R、FOW-4F/FOW-4R和FOW-6F/FOW-6R引物,可快速檢測出西瓜枯萎病菌。結合西瓜枯萎病菌特異性引物和尖孢鐮刀菌通用引物,設計一個雙重PCR體系,可準確、快速檢測出FOW;2.在全基因組測序的基礎上,對基因組進行組裝和注釋。其中,FOW1的N50達到了2.16M。通過生物信息學分析,篩選出FOW1可能的分泌蛋白有137個。再用BLASTZ對FOW0、FOW1和FOW2進行比較基因組分析,鑒定出FOW1可能的效應子有27個。...

【文章頁數(shù)】：55 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2.1特異性引物擴增產物電泳檢測圖

FOW-6R/FOW-6F可從西瓜枯萎病菌中擴增出547bp的基因組片段，它們的PCR擴增產物的電泳圖如圖2.1所示1234567891011121314151617181234567891011121314....

圖2.2引物特異性鑒定電泳檢測圖

進行PCR擴增。瓊脂糖凝膠電泳結果如圖2.2所示，對于西瓜枯萎病菌的特異性引物，西瓜枯萎病菌可特異性的擴增出相同片段長度的條帶，而尖孢鐮刀菌其他�；秃屯鈬昃荒軘U增出條帶。而對于尖孢鐮刀菌通用引物W106R/W106S，西瓜枯萎病菌菌株和尖孢鐮刀菌其他專化型菌株可....

圖2.3雙重PCR體系電泳檢測圖

圖2.3雙重PCR體系電泳檢測圖Fig.2.3ThegelelectrophoresisofPCRproductsofMultiplex-PCRamplification1和25:Trans2KPlusDNAMarker；2-8：西瓜枯萎病菌....

圖3.1FOW1的家族基因分析

FOW258.312461.030.476我們對組裝的基因組進行了基因結構及功能的注釋，在FOW1中我們一共注釋了17，84基因，圖3.1中顯示的是預測基因的家族基因分析，我們列出了FOW1中數(shù)目最多的前30因家族。

本文編號：3969549