目前,對(duì)于西瓜枯萎病的防治主要依靠化學(xué)藥劑,但藥劑殘留嚴(yán)重,危害人類的健康,破壞全球環(huán)境。因此,加快西瓜枯萎病致病機(jī)理的研究是尋找有效防治方法的重要前提。效應(yīng)子基因在病原菌侵染植物過程中起到關(guān)鍵的作用,對(duì)效應(yīng)子基因進(jìn)行初步功能研究,有助于在分子水平上了解病原菌的致病機(jī)制,為西瓜枯萎病菌的防治提供理論依據(jù)。本研究主要包括以下幾個(gè)方面:1.在對(duì)全基因組測(cè)序和重測(cè)序的基礎(chǔ)上,基于生物信息學(xué)分析結(jié)果,篩選出115個(gè)西瓜�；偷奶禺惢蚪M片段。對(duì)其中2個(gè)最長的基因組片段設(shè)計(jì)引物,經(jīng)過常規(guī)PCR反應(yīng),篩選并鑒定出FOW-2F/FOW-2R、FOW-3F/FOW-3R、FOW-4F/FOW-4R和FOW-6F/FOW-6R引物,可快速檢測(cè)出西瓜枯萎病菌。結(jié)合西瓜枯萎病菌特異性引物和尖孢鐮刀菌通用引物,設(shè)計(jì)一個(gè)雙重PCR體系,可準(zhǔn)確、快速檢測(cè)出FOW;2.在全基因組測(cè)序的基礎(chǔ)上,對(duì)基因組進(jìn)行組裝和注釋。其中,FOW1的N50達(dá)到了2.16M。通過生物信息學(xué)分析,篩選出FOW1可能的分泌蛋白有137個(gè)。再用BLASTZ對(duì)FOW0、FOW1和FOW2進(jìn)行比較基因組分析,鑒定出FOW1可能的效應(yīng)子有27個(gè)。...

【文章頁數(shù)】：55 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖2.1特異性引物擴(kuò)增產(chǎn)物電泳檢測(cè)圖

FOW-6R/FOW-6F可從西瓜枯萎病菌中擴(kuò)增出547bp的基因組片段，它們的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳圖如圖2.1所示1234567891011121314151617181234567891011121314....

圖2.2引物特異性鑒定電泳檢測(cè)圖

進(jìn)行PCR擴(kuò)增。瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果如圖2.2所示，對(duì)于西瓜枯萎病菌的特異性引物，西瓜枯萎病菌可特異性的擴(kuò)增出相同片段長度的條帶，而尖孢鐮刀菌其他�；秃屯鈬昃荒軘U(kuò)增出條帶。而對(duì)于尖孢鐮刀菌通用引物W106R/W106S，西瓜枯萎病菌菌株和尖孢鐮刀菌其他�；途昕�....

圖2.3雙重PCR體系電泳檢測(cè)圖

圖2.3雙重PCR體系電泳檢測(cè)圖Fig.2.3ThegelelectrophoresisofPCRproductsofMultiplex-PCRamplification1和25:Trans2KPlusDNAMarker；2-8：西瓜枯萎病菌....

圖3.1FOW1的家族基因分析

FOW258.312461.030.476我們對(duì)組裝的基因組進(jìn)行了基因結(jié)構(gòu)及功能的注釋，在FOW1中我們一共注釋了17，84基因，圖3.1中顯示的是預(yù)測(cè)基因的家族基因分析，我們列出了FOW1中數(shù)目最多的前30因家族。

本文編號(hào)：3969549