梨谷氨酸受體家族分析及PbrGLR3.3的功能驗(yàn)證
發(fā)布時間:2024-05-10 05:22
谷氨酸類受體基因(GLRs)是一種結(jié)構(gòu)域高度保守的離子通道家族,在調(diào)控植物信號轉(zhuǎn)導(dǎo)方面起重要的作用。植物中谷氨酸類受體基因的研究大多集中在模式植物中,木本植物則較少研究;诶婊蚪M測序的數(shù)據(jù)信息,本研究以梨等薔薇科植物特別是梨為主要研究材料,對谷氨酸類受體基因家族進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,并以梨花粉為材料初步驗(yàn)證了梨中GLR3.3調(diào)控花粉管生長發(fā)育的功能。其主要研究結(jié)果如下:1.谷氨酸類受體基因GLR1和GLR2亞家族屬于姐妹亞家族,在木本植物形成層發(fā)育過程中起著重要作用。擬南芥中共有20個GLR基因,其中以At3G04110、At5G27100和At2G17260蛋白序列為參考,在各薔薇科物種數(shù)據(jù)庫內(nèi)比對,收集到梨34個GLRs基因,梅34個GLRs基因,草莓36個GLRs基因,桃40個GLRs基因,共144個GLRs基因。根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)薔薇科植物GLR基因主要分為四個亞家族(GLR1,GLR2,GLR3和GLR4)。對這些基因進(jìn)行進(jìn)化、共線性和擴(kuò)張模式分析,發(fā)現(xiàn)GLR1&GLR2亞家族在木本植物中大量擴(kuò)張。以梨的韌皮部、形成層和木質(zhì)部為實(shí)驗(yàn)材料,結(jié)合熒光定量數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)G...
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTARCT
縮略詞
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 谷氨酸受體的分類和結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
1.1 谷氨酸受體的分類特點(diǎn)
1.2 谷氨酸受體的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
2 植物中谷氨酸受體基因的研究進(jìn)展
2.1 植物中谷氨酸受體基因的鑒定和表達(dá)分析
2.1.1 擬南芥中AtGLRs基因的鑒定和表達(dá)分析
2.1.2 番茄中SlGLRs基因的鑒定和表達(dá)分析
2.1.3 蘋果中MdGLRs基因的鑒定和表達(dá)分析
2.2 植物中谷氨酸受體的功能分析
2.2.1 谷氨酸受體基因在根中的研究進(jìn)展
2.2.2 谷氨酸受體基因在葉中的研究進(jìn)展
2.2.3 谷氨酸受體基因在花粉中的研究進(jìn)展
2.2.4 谷氨酸受體基因在種子中的研究進(jìn)展
2.2.5 谷氨酸受體基因在其他方面的功能研究
3 本研究目的和意義
第二章 薔薇科谷氨酸受體家族生物信息學(xué)分析
1 材料和方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 化學(xué)試劑
1.3 生物信息學(xué)分析
1.3.1 序列的收集與鑒定
1.3.2 蛋白序列和內(nèi)含子序列系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
1.3.3 染色體定位和基因結(jié)構(gòu)分析
1.3.4 基因復(fù)制模式和共線性分析
1.3.5 dn/ds的計算
1.4 RNA的提取
1.5 熒光定量PCR
1.5.1 RNA的消化和反轉(zhuǎn)錄
1.5.2 熒光定量引物的設(shè)計
1.5.3 熒光定量
2 結(jié)果與分析
2.1 薔薇科GLR家族生物信息學(xué)分析
2.1.1 薔薇科GLR家族基因的鑒定和分析
2.1.2 薔薇科GLR基因的進(jìn)化過程
2.2 GLR1&GLR2亞家族生物信息學(xué)分析
2.2.1 植物中GLR1&GLR2屬于姐妹分化枝
2.2.2 植物GLR1&2基因在串聯(lián)復(fù)制過程中結(jié)構(gòu)域大量丟失
2.2.3 選擇壓力在GLR1&2亞家族中所起的作用
2.2.4 GLR1&2基因在喬木類物種的擴(kuò)張
2.3 GLR1&2基因在形成層中大量表達(dá)
3 討論
3.1 植物GLR1&2亞家族的特點(diǎn)
3.2 植物GLR1&2基因參與形成層的發(fā)育過程
第三章 梨谷氨酸受體家族生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 化學(xué)試劑
1.3 生物信息學(xué)分析
1.3.1 基因結(jié)構(gòu)分析
1.3.2 序列比對
1.3.3 進(jìn)化時間計算
1.4 總RNA的提取
1.5 熒光定量
2 結(jié)果與分析
2.1 梨GLRs第三亞家族生物信息學(xué)分析
2.1.1 梨GLRs的鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析
2.1.2 梨GLR3的進(jìn)化時間分析
2.1.3 梨GLR3基因結(jié)構(gòu)分析
2.2 梨GLR3組織定位分析
3 討論
第四章 PbrGLR3.3基因的克隆和功能分析
1 材料和方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 花粉試驗(yàn)
1.2.1 花粉的離體培養(yǎng)
1.2.2 花粉的處理
1.2.3 花粉的觀察和數(shù)據(jù)處理
1.2.4 花粉中反義寡核甘酸技術(shù)的應(yīng)用
1.2.5 花粉管內(nèi)鈣離子濃度變化的測定
1.3 總RNA的提取
1.4 熒光定量
1.5 載體的構(gòu)建
1.5.1 大腸桿菌感受態(tài)的制備
1.5.2 農(nóng)桿菌感受態(tài)的制備
1.5.3 PbrGLR3.3基因的克隆
1.5.4 亞細(xì)胞定位載體的構(gòu)建
1.5.5 質(zhì)粒小量提取法和大量提取法
1.6 亞細(xì)胞定位
1.6.1 擬南芥原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化法
1.6.2 煙草葉片瞬時轉(zhuǎn)化法
2 結(jié)果與分析
2.1 PbrGLR3.3在花粉萌發(fā)和生長過程中起著重要作用
2.2 PbrGLR3.3的克隆與亞細(xì)胞定位
2.3 D-Ser促進(jìn)花粉管生長
2.4 PbrGLR3.3能調(diào)控胞內(nèi)鈣離子濃度
3 討論
全文結(jié)論和創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
在校期間發(fā)表論文情況
致謝
本文編號:3968754
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【學(xué)位級別】:碩士
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第一章 文獻(xiàn)綜述
1 谷氨酸受體的分類和結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
1.1 谷氨酸受體的分類特點(diǎn)
1.2 谷氨酸受體的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
2 植物中谷氨酸受體基因的研究進(jìn)展
2.1 植物中谷氨酸受體基因的鑒定和表達(dá)分析
2.1.1 擬南芥中AtGLRs基因的鑒定和表達(dá)分析
2.1.2 番茄中SlGLRs基因的鑒定和表達(dá)分析
2.1.3 蘋果中MdGLRs基因的鑒定和表達(dá)分析
2.2 植物中谷氨酸受體的功能分析
2.2.1 谷氨酸受體基因在根中的研究進(jìn)展
2.2.2 谷氨酸受體基因在葉中的研究進(jìn)展
2.2.3 谷氨酸受體基因在花粉中的研究進(jìn)展
2.2.4 谷氨酸受體基因在種子中的研究進(jìn)展
2.2.5 谷氨酸受體基因在其他方面的功能研究
3 本研究目的和意義
第二章 薔薇科谷氨酸受體家族生物信息學(xué)分析
1 材料和方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 化學(xué)試劑
1.3 生物信息學(xué)分析
1.3.1 序列的收集與鑒定
1.3.2 蛋白序列和內(nèi)含子序列系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
1.3.3 染色體定位和基因結(jié)構(gòu)分析
1.3.4 基因復(fù)制模式和共線性分析
1.3.5 dn/ds的計算
1.4 RNA的提取
1.5 熒光定量PCR
1.5.1 RNA的消化和反轉(zhuǎn)錄
1.5.2 熒光定量引物的設(shè)計
1.5.3 熒光定量
2 結(jié)果與分析
2.1 薔薇科GLR家族生物信息學(xué)分析
2.1.1 薔薇科GLR家族基因的鑒定和分析
2.1.2 薔薇科GLR基因的進(jìn)化過程
2.2 GLR1&GLR2亞家族生物信息學(xué)分析
2.2.1 植物中GLR1&GLR2屬于姐妹分化枝
2.2.2 植物GLR1&2基因在串聯(lián)復(fù)制過程中結(jié)構(gòu)域大量丟失
2.2.3 選擇壓力在GLR1&2亞家族中所起的作用
2.2.4 GLR1&2基因在喬木類物種的擴(kuò)張
2.3 GLR1&2基因在形成層中大量表達(dá)
3 討論
3.1 植物GLR1&2亞家族的特點(diǎn)
3.2 植物GLR1&2基因參與形成層的發(fā)育過程
第三章 梨谷氨酸受體家族生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 化學(xué)試劑
1.3 生物信息學(xué)分析
1.3.1 基因結(jié)構(gòu)分析
1.3.2 序列比對
1.3.3 進(jìn)化時間計算
1.4 總RNA的提取
1.5 熒光定量
2 結(jié)果與分析
2.1 梨GLRs第三亞家族生物信息學(xué)分析
2.1.1 梨GLRs的鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析
2.1.2 梨GLR3的進(jìn)化時間分析
2.1.3 梨GLR3基因結(jié)構(gòu)分析
2.2 梨GLR3組織定位分析
3 討論
第四章 PbrGLR3.3基因的克隆和功能分析
1 材料和方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 花粉試驗(yàn)
1.2.1 花粉的離體培養(yǎng)
1.2.2 花粉的處理
1.2.3 花粉的觀察和數(shù)據(jù)處理
1.2.4 花粉中反義寡核甘酸技術(shù)的應(yīng)用
1.2.5 花粉管內(nèi)鈣離子濃度變化的測定
1.3 總RNA的提取
1.4 熒光定量
1.5 載體的構(gòu)建
1.5.1 大腸桿菌感受態(tài)的制備
1.5.2 農(nóng)桿菌感受態(tài)的制備
1.5.3 PbrGLR3.3基因的克隆
1.5.4 亞細(xì)胞定位載體的構(gòu)建
1.5.5 質(zhì)粒小量提取法和大量提取法
1.6 亞細(xì)胞定位
1.6.1 擬南芥原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化法
1.6.2 煙草葉片瞬時轉(zhuǎn)化法
2 結(jié)果與分析
2.1 PbrGLR3.3在花粉萌發(fā)和生長過程中起著重要作用
2.2 PbrGLR3.3的克隆與亞細(xì)胞定位
2.3 D-Ser促進(jìn)花粉管生長
2.4 PbrGLR3.3能調(diào)控胞內(nèi)鈣離子濃度
3 討論
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參考文獻(xiàn)
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本文編號:3968754
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