辣椒是世界范圍內(nèi)廣泛栽培的一種重要蔬菜兼經(jīng)濟作物。辣椒應(yīng)用基礎(chǔ)研究相對滯后,可用的分子標記數(shù)量有限。大規(guī)模分子標記的開發(fā)和高密度辣椒種內(nèi)完全連鎖遺傳圖譜的構(gòu)建對于辣椒現(xiàn)代育種具有重要的實際應(yīng)用價值。單倍體培養(yǎng)技術(shù)在辣椒育種中具有重要的應(yīng)用價值,小孢子培養(yǎng)是獲得辣椒單倍體的重要途徑,而部分基因型小孢子胚胎發(fā)生頻率過低成為制約該技術(shù)應(yīng)用的瓶頸。本研究基于辣椒基因組信息大規(guī)模開發(fā)分子標記,同時利用簡化基因組測序技術(shù)和RIL群體構(gòu)建了兩張高密度完全連鎖遺傳圖譜,并將小孢子胚胎發(fā)生能力作為一種表型性狀,從分子遺傳學(xué)角度解析基因型間小孢子胚胎發(fā)生差異的成因,挖掘調(diào)控小孢子胚胎發(fā)生的候選基因。研究結(jié)果如下:1.利用NCBI非冗余辣椒EST數(shù)據(jù)庫,開發(fā)出可用的EST-SSR標記902個�；诶苯坊蚪M信息,共開發(fā)SSR標記177587個,包括基因區(qū)上下游SSR標記9182個;開發(fā)InDel標記4497個。2.從9182個基因組SSR和4497個InDel中選出平均分布于12條染色體的3356對基因組SSR引物和1400對InDel引物,以PM702和FS871為雙親構(gòu)建的Fi0代RIL群體為作圖群體,...

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【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖２－１親本材料ＰＭ７０２?（Ａ）和ＦＳ８７１?（Ｂ）的田間圖片??Ｆｉｇ．２－１?Ｐｈｏｔｏｇｒａｐｈｓ?ｏｆ?ｐａｒｅｎｔａｌ?ｌｉｎｅｓ?ＰＭ７０２?（Ａ）?ａｎｄ?ＦＳ８７１?（Ｂ）．??

ＦＳ８７１是一個栽培型甜椒自交系，由北京市農(nóng)林科學(xué)院蔬菜研宄中心辣椒育種課題組??選育而成，屬于植株中等高度，莖葉表面無表皮毛，葉片大，首花??節(jié)位１０節(jié)，中熟，果實深綠色，方燈籠型，高感疫病、高感南方跟結(jié)線蟲（圖２－１）。ＰＭ７０２??為從美國引進的一份野生型辣椒材料，也屬于Ｃ....

圖３－１?ＳＬＡＦ標簽在參考基因組各染色體上的分布??注：橫叱標為染色體氏度，每一個箝色條帶代表一條染色體，按照１Ｍ的大小對基閃組進行了劃分，每個ｗｉｎｄｏｗ內(nèi)的ＳＬＡＦ??

對參考物種基因組序列進行電子酶切預(yù)測，根據(jù)酶切方案選擇原則，選擇／／ａｅｌｌｌ酶，??酶切片段長度在３１４－３９４?ｂｐ的序列定義為ＳＬＡＦ標簽，預(yù)測可得到１６２３７１個ＳＬＡＦ標簽（圖??３－１；表３－２）。從圖３－１可以看出ＳＬＡＦ標簽在基因組各染色體上分布基本均勻，表明酶切....

圖３－２ＳＬＡＦ標簽（Ａ）和多態(tài)性ＳＬＡＦ標簽（Ｂ）在染色體上的分布??注：橫坐標和縱平標分別為染色體?

?第三章基于簡化基因組測序技術(shù)的辣椒高密度遺傳圖譜的構(gòu)建??測序深度為２８．２６Ｘ，子代平均測序深度為９．０５Ｘ?（表３－５）。ＳＬＡＦ標簽幾乎均勻分布在１２??條染色體上（圖３－２Ａ；表３－６）。其中，１１號染色體上ＳＬＡＦ標簽最多，高達２８１８６個，８??號染色體上包含的ＳＬ....

圖３－３各個分型方式的ＳＬＡＦ標簽的數(shù)量??Ｆｉｇｕｒｅ?３－３．?＂Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ＳＬＡＦｓ?ｉｎ?ｅａｃｈ?ｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ?ｐａｔｔｅｒｎｓ．??

?２Ｃ０Ｍ?２５０Ｍ??圖３－２ＳＬＡＦ標簽（Ａ）和多態(tài)性ＳＬＡＦ標簽（Ｂ）在染色體上的分布??注：橫坐標和縱平標分別為染色體長度和染色體編兮，每一個黃色條帶代表一條染色體，按照１?Ｍ的大小對革閃組進行了劃分．??顏色越深，ＳＬＡＦ標簽越多。??Ｆｉｇｕｒｅ?３－２．?Ｔｈｅ?ｄ....

本文編號：3951905