背景:DnaJ蛋白在植物發(fā)育和脅迫反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。近年來,通過對辣椒基因組全面的生信分析鑒定到76個(gè)DnaJ基因。但目前尚無辣椒DnaJ基因系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和表達(dá)譜的研究報(bào)道。因此,我們對不同組織、非生物脅迫和激素響應(yīng)下辣椒DnaJ基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和表達(dá)譜進(jìn)行了系統(tǒng)的分析。結(jié)果:系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,辣椒DnaJ基因按序列同源性可分為7個(gè)亞族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅶ亞族)。辣椒DnaJ基因在不同組織中的表達(dá)顯示,38%(29/76)的辣椒DnaJ基因在至少一個(gè)組織中表達(dá)。結(jié)果表明,DnaJ基因在辣椒生長發(fā)育中具有潛在的關(guān)鍵作用。另外,為了解辛辣和非辛辣辣椒DnaJ基因在胎座中的表達(dá)差異,我們還利用RNA-Seq數(shù)據(jù)和qRT-PCR分析了辣椒DnaJ基因的表達(dá)模式。通過比較分析發(fā)現(xiàn),8個(gè)基因在辛辣辣椒和非辛辣辣椒中的表達(dá)差異顯著。CaDnaJs與胎座發(fā)育過程中參與辣椒素合成的基因共同表達(dá)。更重要的是,我們的研究揭示了這8個(gè)DnaJ基因可能受到脅迫(熱、干旱和鹽)的調(diào)控,同時(shí)也受到植物激素的調(diào)控(ABA,GA3,MeJA和SA)。結(jié)論:綜上所述,部分在胎座中表達(dá)的DnaJ基因可能參與了植...

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圖1CM334辣椒中76個(gè)CaDnaJ基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

表1辣椒不同組織中表達(dá)的CaDnaJ基因亞族的組成Leaf%Root%Stem%Pericarp%Placenta%I10.0750.230.1760.2450.21III80.53100.4280.4490.369....

圖2CM334辣椒中76個(gè)CaDnaJs的亞科組成

圖1CM334辣椒中76個(gè)CaDnaJ基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系我們發(fā)現(xiàn)76個(gè)CaDnaJ基因中有29個(gè)在至少一個(gè)組織中表達(dá)([RPKM]≥5.0被認(rèn)為表達(dá))(附表2)。對各亞科組成的分析顯示,CaDnaJ亞科在被測組織中的表達(dá)存在差異(表1)。第III亞族成員在被測組織中擁有超過34....

圖3基于CM334轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的CaDnaJ基因在植物組織中的表達(dá)調(diào)查

我們發(fā)現(xiàn)76個(gè)CaDnaJ基因中有29個(gè)在至少一個(gè)組織中表達(dá)([RPKM]≥5.0被認(rèn)為表達(dá))(附表2)。對各亞科組成的分析顯示,CaDnaJ亞科在被測組織中的表達(dá)存在差異(表1)。第III亞族成員在被測組織中擁有超過34%的CaDnaJ表達(dá)(圖3),盡管只擁有22%的CaDna....

圖4CM334中不同組織中表達(dá)CaDnaJs的數(shù)量

表2辣椒不同組織中表達(dá)、優(yōu)先表達(dá)和特異表達(dá)CaDnaJ基因的數(shù)量TypeLeafRootStemPericarpPlacentaExpressedCaDnaJs1524182524PreferentiallyexpressedCaDnaJs5....

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