發(fā)布時間：2024-03-03 12:58

　　ERF(ethylene responsive factor)轉(zhuǎn)錄因子是植物AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子超家族的一個家族,參與乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途(?)和植物對生物和非生物脅迫的響應(yīng),對植物的生長發(fā)育至關(guān)重要。目前已對擬南芥、水稻和楊樹等多個物種中的ERF基因家族進行鑒定及進化分析,但對草莓中ERF基因的研究非常少。草莓是一種營養(yǎng)豐富且經(jīng)濟價值高的園藝作物,2011年二倍體森林草莓全基因組序列的測定,為ERF基因家族的鑒定和研究奠定了基礎(chǔ)。本文在森林草莓基因組中一共鑒定出91個ERF基因。根據(jù)進化樹的聚類關(guān)系將整個ERF基因家族分成11個組,并將所有ERF基因分成單一支Ⅰ和基因簇Ⅱ兩大類。通過Mcscan及染色體定位分析發(fā)現(xiàn),草莓特異性擴張的Ⅱ類ERF基因主要來源于串聯(lián)復(fù)制、散點復(fù)制和染色體片段復(fù)制事件,說明這三類復(fù)制是森林草莓ERF基因特異性擴張的主要機制。未發(fā)生近期擴張的Ⅰ類ERF基因中,也存在處于串聯(lián)復(fù)制片段中的基因,這些基因來源于草莓與擬南芥分化之前的串聯(lián)復(fù)制事件(古老的串聯(lián)復(fù)制)。至少有31個(34.1%)森林草莓ERF基因起源于古老的串聯(lián)復(fù)制事件,表明串聯(lián)復(fù)制在草莓與擬南芥分化之前的E...

【文章頁數(shù)】：74 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１?ＡＰ２超家族的結(jié)構(gòu)??

的蛋白模塊，即ＥＲＦ結(jié)構(gòu)域，調(diào)控乙烯響應(yīng)基因的轉(zhuǎn)錄水ｆ。根據(jù)結(jié)構(gòu)域的特點，??ＡＰ２／ＥＲＦ轉(zhuǎn)錄因子超家族Ｋ要分成三個家族，分別足ＡＰ２家族、ＥＲＦ家族和ＲＡＶ家??族（圖１－丨）。ＡＰ２家族中人多越因是由兩個或者兩個以上的ＡＰ２／ＥＲＦ結(jié)構(gòu)域串聯(lián)復(fù)??制的，山于少數(shù)僅包含１個Ａ....

圖２－１森林草莓中￡／？／基因染色體定位

７號染色體上分布１７個基因，其：中包含３個串聯(lián)復(fù)制基因群。這表明串聯(lián)??Ｍ制可能足導(dǎo)致＇基因在基因組卜．分布小均勻的原因。森林草莓ＥＲＦ基因家族中個：??少有４０．７％?（３７／９１）的基因定位在染色體串聯(lián)復(fù)制片段上（圖２－１），由此可以推??斷草萄ＥＲＦ基因家族的擴張在很大程度....

圖２－４串聯(lián)基因在１２個物種中的分布情況??Ｆｉｇｕｒｅ２－４?Ｔｈｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｔａｎｄｅｍ?￡７？Ｆ?ｇｅｎｅｓ?ｉｎ?１２?ｓｐｅｃｉｅｓ??

含２個或２個以上的內(nèi)含子，其中ｍｍａ３２０２０中包含８個內(nèi)含子。這表明在擬南芥和草莓??分化后，ＥＲＦ家族基因在草莓物種中的復(fù)制可能伴隨著更多的內(nèi)含子插入。從蛋白水??平上分析，ＡＰ２／ＥＲＦ結(jié)構(gòu)域長度為６０？７０個氨基酸，在ＥＲＦ蛋白上非常保守（附圖２），??有１個ｏｔ螺旋和３....

圖３－２?１４個串聯(lián)復(fù)制基因在果實不同發(fā)育時期的表達情況

??ｍｒｎａ０８０７２和ｍｍａ０８０７５在果實早期發(fā)育時期的表達水平也較低（圖３－２）。綜上表明，??串聯(lián)復(fù)制的基因在果實成熟階段的表達水平與果實早期發(fā)育時期基本是一致的

本文編號：3917816