龍眼體細(xì)胞胚胎發(fā)生早期AGO基因家族的全基因組鑒定、表達(dá)與功能分析
發(fā)布時(shí)間:2024-01-30 05:56
龍眼(Dimocarpus longan Lour.)是我國(guó)華南地區(qū)具有較高經(jīng)濟(jì)價(jià)值的熱帶亞熱帶果樹(shù)。龍眼果實(shí)質(zhì)量和產(chǎn)量與其胚胎發(fā)育息息相關(guān)。植物體細(xì)胞胚胎與合子胚在發(fā)育過(guò)程基本相似,可作為研究植物胚胎發(fā)生機(jī)制的優(yōu)良替代體系。植物體胚發(fā)生過(guò)程不僅受特異基因的調(diào)控,還受表觀遺傳調(diào)控,尤其是DNA甲基化,一定水平的DNA甲基化對(duì)植物體胚的正常發(fā)育是必須的。mi RNA能夠介導(dǎo)DNA的甲基化,該過(guò)程與mi RNA加工合成途徑中的相關(guān)蛋白有關(guān),AGO作為mi RNA加工合成途徑中的關(guān)鍵蛋白,參與介導(dǎo)DNA的甲基化,因此,AGO基因可能參與調(diào)控植物的體胚發(fā)生過(guò)程,但是具體作用機(jī)制尚不清楚,目前,關(guān)于龍眼AGO表達(dá)調(diào)控和功能特異性研究仍有大量空白。因此,本研究首先從三代測(cè)序的龍眼基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中鑒定出AGO基因家族,對(duì)Dl AGOs家族的表達(dá)模式進(jìn)行了分析,利用異位表達(dá)的方法對(duì)龍眼AGO基因及啟動(dòng)子功能進(jìn)行研究。最后,進(jìn)行了龍眼胚性愈傷組織去甲基化的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析。以此來(lái)探究AGO在龍眼體胚發(fā)生早期的甲基化調(diào)控機(jī)制。主要研究結(jié)果如下:1龍眼體胚發(fā)生早期AGO家族的全基因組鑒定、生物信息學(xué)分析及Dl A...
【文章頁(yè)數(shù)】:214 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
本文編號(hào):3889634
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圖1-1AGO蛋白結(jié)構(gòu)(引自Hervé等,2004)
圖1-2擬南芥中miRNA的合成途徑(引自Basso等,2019)
圖1-3植物體胚發(fā)生相關(guān)基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖(引自林玉玲和賴鐘雄,2007)
圖1-4植物基因組DNA甲基化的維持(引自Jones等,2001;Lindroth等,2001;Du等,2003;Cao等,2003)
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