柑橘黃龍病(Citrus Huanglongbing,HLB)是當前世界柑橘產(chǎn)業(yè)的頭號殺手。該病能侵染幾乎所有的柑橘栽培品種,目前尚無有效治愈手段。其病原暫定于α-變型菌綱(Proteobacteria)、韌皮桿菌屬(Liberibacter),是一種韌皮部專性寄生的難培養(yǎng)革蘭氏陰性細菌,根據(jù)16S rDNA序列不同可將其分為三個種:亞洲種(‘Candidatus Liberibacter asiaticus’,Las)、非洲種(‘Ca.Liberibacter africanus’,Laf)、美洲種(‘Ca.Liberibacter americanus’,Lam),其中Las分布最廣,且危害最大。迄今,在柑橘栽培種中尚未發(fā)現(xiàn)黃龍病抗性基因,嚴重制約了抗性育種的進程。有研究表明,馬蜂柑(Citrus hystrix)對黃龍病具有一定的耐病性,但其耐病機制尚不清楚。中國是世界柑橘的重要起源中心,有著豐富的野生柑橘資源,而這些野生資源對黃龍病的抗感性缺乏系統(tǒng)研究。因此,本研究以馬蜂柑、宜昌橙(C.ichangensis)、道縣野橘(C.daoxianensis)等野生柑橘資源為研究材料,...

【文章頁數(shù)】：107 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
    1.1 柑橘黃龍病概況
        1.1.1 黃龍病的發(fā)生與分布
        1.1.2 黃龍病癥狀
        1.1.3 黃龍病的寄主范圍及傳播途徑
        1.1.4 柑橘不同品種對黃龍病的敏感性差異研究
        1.1.5 病原分子生物學研究
    1.2 韌皮部桿菌亞洲種（Las）與植物寄主互作研究進展
        1.2.1 Las導致寄主代謝平衡失調
        1.2.2 激素介導的寄主應答反應
        1.2.3 寄主的防衛(wèi)反應
    1.3 轉錄組學技術研究進展
        1.3.1 轉錄組學及其研究方法
        1.3.2 RNA-seq技術及其在植物抗病研究中的應用
第二章 引言
第三章 野生柑橘響應Las侵染的生物學研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 供試材料
        3.1.2 主要試劑與儀器
        3.1.3 主要存儲液
        3.1.4 總核酸提取
        3.1.5 引物
        3.1.6 反應體系及程序
    3.2 結果與分析
        3.2.1 野生柑橘不同品種接種黃龍病后含菌量變化
        3.2.2 野生柑橘感染黃龍病后的癥狀差異
    3.3 討論
    3.4 結論
第四章 馬蜂柑和甜橙響應Las侵染的比較轉錄組學研究
    4.1 材料與方法
        4.1.1 供試材料
        4.1.2 主要試劑與儀器
        4.1.3 主要存儲液
        4.1.4 總核酸提取
        4.1.5 核酸RNA提取
        4.1.6 轉錄組測序
        4.1.7 數(shù)據(jù)分析
        4.1.8 RT-qPCR驗證
    4.2 結果與分析
        4.2.1 RNA質量檢測
        4.2.2 測序數(shù)據(jù)過濾
        4.2.3 參考基因組比對結果
        4.2.4 新轉錄本預測
        4.2.5 各樣品間差異表達基因情況
        4.2.6 差異表達基因GO功能分析
        4.2.7 差異表達基因代謝途徑富集分析
        4.2.8 差異表達基因功能聚類分析
        4.2.9 RT-qPCR驗證
    4.3 討論
        4.3.1 Las侵染對馬蜂柑和甜橙淀粉代謝和光合作用的影響存在差異
        4.3.2 馬蜂柑和甜橙對Las的防御機制
    4.4 結論
第五章 宜昌橙、道縣野橘和甜橙響應Las侵染的比較轉錄組學研究
    5.1 材料與方法
        5.1.1 供試材料
        5.1.2 主要試劑（盒）與儀器
        5.1.3 常用儲備液
        5.1.4 總核酸提取
        5.1.5 總RNA提取
        5.1.6 轉錄組測序
        5.1.7 數(shù)據(jù)分析
        5.1.8 RT-qPCR驗證
    5.2 結果與分析
        5.2.1 RNA質量檢測
        5.2.2 測序數(shù)據(jù)過濾
        5.2.3 參考基因組比對結果
        5.2.4 新轉錄本預測
        5.2.5 各樣品間差異表達基因情況
        5.2.6 差異表達基因GO功能分析
        5.2.7 差異表達基因代謝途徑富集分析
        5.2.8 差異表達基因功能聚類分析
        5.2.9 RT-qPCR驗證
    5.3 討論
        5.3.1 Las誘導的差異表達基因數(shù)量與顯癥程度具有一致性
        5.3.2 不同寄主對Las的應答反應存在一定差異
        5.3.3 不同野生柑橘品種對Las應答反應之間的異同
    5.4 結論
第六章 主要結論、創(chuàng)新點與展望
    6.1 主要結論
        6.1.1 野生柑橘響應Las侵染的生物學研究
        6.1.2 馬蜂柑和甜橙響應Las侵染的比較轉錄組學研究
        6.1.3 宜昌橙、道縣野橘和甜橙響應Las侵染的轉錄組學研究
        6.1.4 不同野生柑橘對Las的應答反應存在一定的相似性
    6.2 創(chuàng)新點
    6.3 展望
參考文獻
附錄Ⅰ 縮略詞與中英文對照
附錄Ⅱ 附表
攻讀碩士學位期間發(fā)表論文及參加科研項目
致謝



本文編號：3881102